高福院士团队《柳叶刀》（IF=203） 发文：北京新冠疫情爆发期间未出现新变种

由于中国实施了国家动态清零新冠肺炎战略，2022年12月之前，北京没有持续的SARS-CoV-2本地传播。但近3年来，境外输入病例频繁出现。随着近期中国新冠肺炎确诊病例的激增，人们担心可能会出现新型SARS-CoV-2变种。

2023 年2月8日，北京疾控中心王全意及中国科学院微生物研究所高福共同通讯在Lancet （IF=203）在线发表题为“Characterisation of SARS-CoV-2 variants in Beijing during 2022: an epidemiological and phylogenetic analysis”的研究论文，研究团队发现，自2022年11月14日以来，BF.7和BA.5.2在北京爆发，目前没有证据表明出现了新的变异。

该研究共获得2994条完整的SARS-CoV-2基因组序列，其中2881条高质量基因组序列用于进一步分析。11月14日至12月20日，共检测到413例新病例，其中本地病例350例，境外输入病例63例。所有这些基因组都属于现有的123个Pango谱系，表明没有持续的显性变异或新的谱系。然而，BA.5.2和BF.7目前在北京占主导地位，占11月14日以来本地病例的90%。北京市BA.5.2和BF.7有效种群规模在2022年11月14日后均有所增加。总之，自2022年11月14日以来，BF.7和BA.5.2在北京爆发，目前没有证据表明出现了新的变异。

新冠肺炎大流行已持续近3年，仍是全球关注的问题。鉴于新冠病毒的广泛传播和不断演变，全球出现了许多变种。关注的变体(VOCs)的出现，如Alpha (B.1.1.7)、Beta (B.1.351)、Gamma (P.1)、Delta (B.1.617 .2)和Omicron (B.1.1.529)，引起了多次浪潮。Omicron最早在南非被发现，并被世卫组织指定为挥发性有机化合物；它因空前数量的突变和更高的传播性，迅速接管了全球其他共同传播的变种，增加了病毒谱系的多样化。

在2022年12月之前，中国采取了与其他国家不同的疫情应对策略，从2020年武汉的封锁到动态清零政策、精准防控策略阻止了SARS-CoV-2的传播，从而在2020年初至2020年期间迅速控制了COVID-19的区域聚集性疫情。中国在2022年12月之前调整了防控政策，疫情在中国的快速发展引起了世界的关注，并引起了人们对此次疫情是否由新型SARS-CoV-2变体的出现所驱动的担忧。这凸显了在基因组水平上长期和持续监测SARS-CoV-2的重要性。

2022年11月14日以后北京市BA.5.2和BF.7种群的时间动态（图源自Lancet ）

在这里，作者描述了2022年收集的高质量SARS-CoV-2全基因组序列的流行病学和系统发育。该研究共获得2994条完整的SARS-CoV-2基因组序列，其中2881条高质量基因组序列用于进一步分析。11月14日至12月20日，共检测到413例新病例，其中本地病例350例，境外输入病例63例。

所有这些基因组都属于现有的123个Pango谱系，表明没有持续的显性变异或新的谱系。然而，BA.5.2和BF.7目前在北京占主导地位，占11月14日以来本地病例的90%。北京市BA.5.2和BF.7有效种群规模在2022年11月14日后均有所增加。总之，自2022年11月14日以来，BF.7和BA.5.2在北京爆发，目前没有证据表明出现了新的变异。

原文链接：

https://doi.org/10.1016/S0140-6736（23）00129-0

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