脑科学与脑医学学院斯科团队在生物医学图像深度学习处理算法方向取得新进展
浙江大学脑科学与脑医学学院斯科教授团队在Journal of Biomedical Informatics在线发表题为“A multi-feature deep learning system to enhance glaucoma severity diagnosis with high accuracy and fast speed”的研究论文。
该研究提出了基于眼压、彩色眼底照和视野图的多模态深度学习系统(Multi-Feature Deep Learning: MFDL)。
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https://www.zju.edu.cn/2022/1107/c32861a2667112/page.htm
医学院白瑞良团队发明新型AQP4分子磁共振成像技术,有望无创预测胶质瘤治疗敏感性
浙江大学医学院系统神经与认知科学研究所、教育部脑与脑机融合前沿科学中心白瑞良团队联合山东省立医院刘英超团队在Nature Biomedical Engineering杂志发表了题为“Transmembrane water-efflux rate measured by magnetic resonance imaging as a biomarker of the expression of aquaporin-4 in gliomas” (DOI: 10.1038/s41551-022-00960-9)的研究论文。
该文首次报道了一种水通道蛋白4(AQP4)的在体可视化技术,在胶质瘤治疗敏感性预测方面展现出初步效果。该技术可在临床环境中轻松实现,有望为未来胶质瘤精准诊断和治疗管理提供一种有效的影像学工具。
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系统所奚望/王菁联合钱骏团队开发高效AIE探针辅助的猕猴脑皮层血管大深度三光子荧光显微成像
浙江大学系统神经与认知科学研究所副研究员奚望,Anna Wang Roe教授以及浙江大学光电学院钱骏教授团队合作开发了一套适用于猕猴脑部皮层活体大深度成像的三光子荧光显微成像系统、配合相应的成像探针,实现了当前活体猕猴脑部多光子荧光显微成像的最大深度。
相关成果以标题为“Large-depth three-photon fluorescence microscopy imaging of cortical microvasculature on nonhuman primates with bright AIE probe In vivo”于近期(2022.10)发表在Biomaterials。
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农学院喻景权/张明方/周艳虹教授团队在Nature 子刊发文揭示葱属作物基因组进化与特殊辛辣风味形成机制
近日,浙江大学农学院喻景权/张明方/周艳虹教授团队合作在知名自然子刊Nature Communications发表了“Chromosome-level genome assembly of bunching onion illuminates genome evolution and flavor formation in Allium crops”的研究长文。
该研究首次从头组装了分葱染色体水平的基因组,并结合多组学方法揭示了葱属植物基因组进化、染色体同源性、关键基因家属扩张及其特殊辛辣风味形成的基因组基础,从基因组水平上明确了中国是分葱大葱起源和驯化中心。该成果为葱属植物进化生物学研究、基因组育种和分子改良提供了重要科学理论指导。研究还揭示了葱的起源和驯化途径。
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浙江大学药学院朱峰和曾苏团队在《Nucleic Acids Research》发文报道面向所有药物的“药物-分子相互作用图谱”
浙江大学朱峰教授、曾苏教授与清华大学陈宇综教授合作在生物医药领域重要期刊Nucleic Acids Research上发表了构建面向所有药物的“药物-分子相互作用图谱”研究,并开发了全球首个描述此类型图谱的数据平台DrugMAP。
该平台描述了三万余种药物与超过五千种生物分子间的全方位互作信息。在强调临床价值的前提下,构建了当前最大的药物-分子相互作用图谱。随着AI技术在药学领域应用的不断深入,以药物为中心的异质性互作网络被认为是当前AI药学发展所亟需的基础性数据,具有重要的应用价值。
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基础医学院欧阳宏伟课题组《Annals of Rheumatic Diseases》发文揭示人体关节软骨钙化的物质科学机制
近日,浙江大学基础医学院欧阳宏伟教授团队以“Stage-specific and location-specific cartilage calcification in osteoarthritis development”为题在Annals of Rheumatic Diseases上发文。
该文首次从物质分子组装、微纳结构及微观力学等多学科角度探索OA发展中“自上而下”和“自下而上”的双向软骨钙化病理机制,发现“自上而下”钙化是从关节面开始的渐变式钙化,“自下而上”钙化是从骨软骨交界处发生的跳跃式钙化并形成“骨-软骨-钙化软骨”的三明治特征结构。该项研究是本团队继第一篇揭示正常人体关节骨软骨界面组织后,第一篇揭示人体关节软骨病理钙化的物质科学机制。
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基础医学院徐鹏飞/金希课题组《PLOS Biology》合作发文利用斑马鱼模型研究出一种发育相关罕见疾病的致病机制和治疗策略
浙江大学基础医学院徐鹏飞、浙江大学医学院附属第一医院金希团队合作在PLOS Biology杂志发表题为“Mycn regulates intestinal development through ribosomal biogenesis in a zebrafish model of Feingold syndrome 1”的研究论文。
该论文首次构建了Feingold综合征1型的斑马鱼模型,利用此模型阐明了该疾病肠道发育缺陷的发病机制,并提供了一个可能的治疗方案。
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基础医学院郭江涛/侯盼盼/杨巍课题组《PNAS》合作揭示人源钾通道KCNQ1的配体激活机制
浙江大学基础医学院郭江涛课题组、澳门科技大学侯盼盼课题组和浙江大学基础医学院杨巍课题组在《PNAS》上合作发表了题为“Structural mechanisms for the activation of human cardiac KCNQ1 channel by electro-mechanical coupling enhancers”的研究论文。
该研究报道了人源KCNQ1-CaM复合物在apo状态、激动剂ML277结合状态、以及ML277和PIP2同时结合状态的4个高分辨率冷冻电镜结构,揭示了配体激活KCNQ1通道的分子机制。
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药学院侯廷军课题组在《Nucleic Acids Research》报道了蛋白降解靶向嵌合体数据库PROTAC-DB 2.0
浙江大学药学院侯廷军教授课题组在国际生物医药重要期刊Nucleic Acids Research上发表了论文“PROTAC-DB 2.0: an updated database of PROTACs”,对初代PROTAC-DB做出了重大更新。
PROTAC-DB始建于2020年,是首个PROTAC在线数据平台,囊括了化学结构、生物活性、理化性质在内的多种数据,现已成为PROTAC领域的重要数据资源。该平台在发表之初,便受到了PROTAC创始人Crews教授的推荐,并多次被Nature Reviews Drug Discovery、Chemical Society Reviews等国际权威期刊正面引用和介绍,现平台访问量已突破75,000次,为ESI高被引论文。
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生研院范衡宇实验室在《Science Advances》发文揭示poly(A)结合蛋白PABPN1通过液-液相分离机制调控卵子发生过程中mRNA的转录后加工和稳定储存
浙江大学生研院范衡宇团队在Science Advances发表题为“PABPN1 Functions as a Hub in the Assembly of Nuclear Poly(A) Domains that are Essential for Mouse Oocyte Development”的研究论文。
该研究首次报道了小鼠卵母细胞中的新生mRNA定位在细胞核的一个特定功能区域,并命名为nuclear poly(A) domain (NPAD)中。Poly(A)结合蛋白PABPN1通过液-液相分离机制调控卵子发生过程中mRNA的转录后加工。
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药学院范骁辉教授课题组在《Nature Communications》报道首个可将传统转录组测序数据重构至单细胞空间分辨率的方法
浙江大学药学院、长三角智慧绿洲创新中心范骁辉教授团队联合计算机科学与技术学院陈华钧教授团队和军事医学科学院高月教授团队在国际知名期刊Nature Communications上发表了题为“De novo analysis of bulk RNA-seq data at spatially resolved single-cell resolution”的研究论文。
该研究提出了一种空间解卷积算法——Bulk2Space,利用β-VAE等深度学习框架,首次实现将Bulk转录组重构至单细胞空间分辨率。
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农学院叶恭银教授团队等在《Nature Communications》发文揭示平腹小蜂维持基因组稳定与毒液快速演化的遗传机制
浙江大学农业与生物技术学院叶恭银教授团队联合广东省农科院植保所等团队在Nature Communications发表题为为“Genomic signatures associated with maintenance of genome stability and venom turnover in two parasitoid wasps”的研究论文。
该研究揭示了寄生蜂维持基因组稳定与毒液快速演化的基因组特征。同时,该论文还报道了两种平腹小蜂的高质量基因组信息,为生物防治研究提供了重要的基因信息资源。
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来源:浙江大学官网(相关单位供稿)等,内容有增删
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