Cell Systems：在多种男性癌症中意外发现X染色体失活

早期女性胚胎细胞的X染色体的两个副本中会有一个失活，只留下一个功能正常。这样避免了女性细胞中产生双倍量的X相关蛋白。近三十年来，研究发现在胚胎发育的早期，控制X染色体失活需要一种名为XIST的基因，其转录产物为长链非编码RNA。

Dana-Faber癌症研究所的研究人员分析包含数千个癌症DNA样本的公共数据库，发现了癌细胞与普通细胞的又一个差异。他们的结果表明，X染色体受XIST调控失活的过程也可能发生在男性癌症细胞中。在分析的部分男性癌症样本中发现了XIST的高表达，同时这些癌症细胞也出现一定程度的基因表达沉默，甲基化等现象。他们的这项研究于今年11月10日发表在《Cell Systems》。

(来源文献）

描述研究工作流程的图形摘要

在异常男性癌症样本中，74%来自已经显示使X染色体失活的生殖系统癌症，但剩下26%来自其他癌症类型，包括肝癌、脑癌、皮肤癌、心脏病、肺癌和甲状腺癌。“我们的结果显示，XIST在广泛的男性癌症中表达和活跃，”研究人员说。

(来源文献）

XIST在癌症中的表达改变

为了确定XIST的表达不是来自健康细胞，研究小组使用RNAseq数据测量在男女健康组织中正常存在的XIST RNA的数量。比较汇总数据时，发现癌细胞表达的XIST水平高于健康的男性组织，而与女性组织相当。在部分病例中，研究人员从同一个人的健康组织和癌变组织中提取样本，结果只在癌细胞里发现了XIST的表达。

在报告中，研究人员总结道，“进一步研究在某些癌症中诱导XIST表达的信号以及生理和癌症相关X染色体失活之间的差异，可能会揭示治疗干预的潜在靶点。”

这里格外值得关注的是，这是一个完全来自于现有数据挖掘的重要发现，随着高通量数据采集技术的普遍，可以预见，在生命科学相关的数据量超线性增长的环境下，单纯通过数据挖掘辅以越来越丰富的数据分析以及建模的技术，同样可以发现大量有价值的信息。

文献原文：

Somatic XIST activation and features of X chromosome inactivation in male human cancers

转自：“科研腔”微信公众号

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