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北京大学伊成器课题组招聘博士后

2022/6/21 10:09:46  阅读:370 发布者:

北京大学伊成器课题组招聘博士后

本实验室依托北大-清华生命科学联合中心和北京大学生命科学学院,开展基因编辑、表观遗传学、单细胞组学和精准医学的生物学研究和前沿技术开发,尤其关注DNA/RNA生物学在人类疾病诊断与治疗中的应用。

详见: 

http://www.bio.pku.edu.cn/homes/Index/news_cont_jl/16/91.html

实验室网页:yilab.org.cn


1

//  博士后招聘

1、具有生物信息学、生物统计学等相关专业背景,具有博士学位;

2、优先考虑具有编程能力,能利用生物信息软件和统计学方法对大数据进行分析、处理和展示,熟悉新一代高通量测序技术的人选。

3、优先考虑具有基因编辑、单细胞组学、肿瘤生物学和生殖医学等相关研究经历者。


2

//  待遇条件

按北京大学博士后管理规定,提供有竞争力的薪酬待遇。解决博士后期间的子女入托、入学问题。推荐申请中国博士后创新基金、北大博雅博士后基金和北大-清华生命联合中心博士后基金。


3

//  申请方法

请将应聘信及简历以电子邮件的方式发到:chengqi.yi@pku.edu.cn。邮件主题请注明“博士后申请”。

本招聘长期有效。


PI简历

伊成器

北京大学生命科学学院教授

北大-清华生命科学联合中心PI

邮箱:

chengqi.yi@pku.edu.cn


实验室主页:yilab.org.cn
研究领域:

实验室致力于RNA/DNA修饰的生物学功能和机制研究,以及基因编辑新方法的开发。为了实现这一目标,我们综合运用包括化学生物学、表观遗传学、基因编辑和单细胞组学等多学科手段,旨在揭示核酸表观遗传修饰的新功能、发展RNA编辑的新技术。
1. RNA修饰和表观转录组学

几十年的研究已经鉴定了100多种转录后修饰。研究人员之前认为,一旦RNA修饰产生,这些共价修饰都是稳定存在、不可逆转的。然而,最近关于6-甲基腺嘌呤(m6A)的一系列研究证明,RNA甲基化也是动态可逆的,并且在基因表达调控中起到重要作用。因此,“表观转录组学”也随之兴起。

除了m6A,转录组上还存在其它表观遗传修饰。我们课题组最近的研究发现,多种之前认为只在非编码RNA上存在的转录后修饰,即假尿嘧啶(Ψ) 1-甲基腺嘌呤(m1A) 和m6Am,也广泛存在于哺乳动物的mRNA当中。我们的研究表明这些转录后修饰在转录组中广泛存在,受多种外界刺激的动态调控,并且动态、可逆。我们希望利用课题组已经开发的新颖表观转录组测序技术,来阐释这些RNA修饰在生理及病理条件下的功能和调控机制,从而在表观转录组学这个新兴起的学科中发现一片“新大陆”。


2. 基因编辑

基因编辑作为新兴的颠覆式生物技术,已经在生物医药、农业、能源和生物安全等方面展现了巨大的潜力。本课题组发展了一系列现有基因编辑器的安全性评价技术,不仅为更精准的基因编辑工具的开放提供了关键参考,也为基因编辑用于临床治疗提供了重要依据。此外,由于DNA编辑会产生永久的“脱靶”编辑,我们也致力于新型RNA编辑技术的开发,有望获得更为精准、安全、便捷的基因编辑新技术。
3. DNA修饰和表观基因组学

哺乳动物基因组中,具有5-甲基胞嘧啶(5mC)、5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)、5-醛基胞嘧啶(5fC)和5-羧基胞嘧啶(5caC)等多种表观基因组修饰。本实验室开发了多个单碱基、单细胞水平上表观基因组的组学检测技术,未来将应用于单细胞测序和临床研究,以期鉴定疾病的生物标志物。此外,我们也关注染色质可及性的组学检测技术。

代表性研究成果:
1. Zhuang Y, Liu J, Wu H, Zhu Q, Yan Y, Meng H, Chen PR, Yi C*. Increasing the efficiency and precision of prime editing with guide RNA pairs. Nat Chem Biol. 2022; 18: 29-37.
2. Lei Z, Meng H, Lv Z, Liu M, Zhao H, Wu H, Zhang X, Liu L, Zhuang Y, Yin K, Yan Y, Yi C.* Detect-seq reveals out-of-protospacer editing and target-strand editing by cytosine base editors. Nat Methods. 2021; 18: 643-651.
3. Cui Q, Yin K, Zhang X, Ye P, Chen X, Chao J, Meng H, Wei J, Roeth D, Li L, Qin Y, Sun G, Zhang M, Klein J, Huynhle M, Wang C, Zhang L, Badie B, Kalkum M, He C, Yi C* and Shi Y*. Targeting PUS7 suppresses tRNA pseudouridylation and glioblastoma tumorigenesis. Nat Cancer. 2021; 2: 932–949.
4. Liu J, Li K, Cai J, Zhang M, Zhang X, Xiong X, Meng H, Xu X, Huang Z, Peng J. Fan J*, YI C*. Landscape and Regulation of m6A and m6Am Methylome across Human and Mouse Tissues. Mol Cell. 2020; 77: 426-440.
5. Song J, Zhuang Y, Zhu C, Meng H, Lu B, Xie B, Peng J, Li M*, Yi C*. Differential roles of human PUS10 in miRNA processing and tRNA pseudouridylation. Nat Chem Biol. 2020; 16: 160-169. 
6. Li X, Xiong X, Zhang M, Wang K, Chen Y, Zhou J, Mao Y, Lv J, Yi D, Chen X, Wang C, Qian S, Yi C*. Base-Resolution Mapping Reveals Distinct m1A Methylome in Nuclear- and Mitochondrial-Encoded Transcripts. Molecular Cell, 2017; 68: 993-1005.
7. Zhu C, Gao Y, Guo H, Xia B, Song J, Wu X, Zeng H, Kee K, Tang F*, Yi C*. Single-Cell 5-Formylcytosine Landscapes of Mammalian Early Embryos and ESCs at Single-Base Resolution. Cell Stem Cell, 2017; 20: 720-731.
8. Li X, Xiong X, Yi C*. Epitranscriptome sequencing technologies: decoding RNA modifications. Nat. Methods, 2016; 14: 23-31.
9. Li X, Xiong X, Wang K, Wang L, Shu X, Ma S, Yi C*. Transcriptome-wide mapping reveals reversible and dynamic N1-methyladenosine methylome. Nat. Chem. Biol., 2016; 12: 311-316. 
10. Xia B, Han D, Lu X, Sun Z, Zhou A, Yin Q, Zeng H, Liu M, Jiang X, Xie W, He C*, Yi C*. Bisulfite-free, base-resolution analysis of 5-formylcytosine at the genome scale. Nat. Methods, 2015; 12: 1047-1050.


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