Nature：SARS-CoV-2 BA.2.86 spike的抗原性和受体亲和力

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题目：Antigenicity and receptor affinity of SARS-CoV-2 BA.2.86 spike

期刊：Nature

IF：69.504

发表时间：2023年10月23日

通讯作者单位：哥伦比亚大学

DOI：https://doi.org/10.1038/s41586-023-06750-w

主要内容：

BA.2.86（奥密克戎的亚变体）的刺突蛋白具有大量突变，并以高亲和力与宿主细胞中的受体结合。尽管有这些特征，但BA.2.86对接种疫苗者的抗体的抵抗力并不比目前流行的主要变体强。

对SARS-CoV-2的社区免疫力（当大部分人口产生免疫力时发生的针对病原体的间接保护）减轻了COVID-19的临床后果。然而，它也对病毒的进化施加了巨大的选择性压力。在过去三年中，这种演变导致了具有不同抗原集（被宿主细胞识别并刺激免疫反应的病毒蛋白）的 SARS-CoV-2 变体的出现。每个新变种往往比前一个变种对宿主抗体的抵抗力更强。今年早些时候首次发现了一种名为BA.2.86的奥密克戎亚变体，现已传播到40多个国家。BA.2.86 因其刺突蛋白（使病毒能够进入宿主细胞的蛋白质）中的广泛突变而引起警报。刺突蛋白的突变可能导致病毒变异，该变异可以逃避先前感染和疫苗接种来源的血液中抗体的识别，也可以逃避用于治疗 COVID-19 的单克隆抗体。因此，确定 BA.2.86 是否以及在多大程度上对血清抗体具有耐药性至关重要，包括来自感染 XBB.1.5（更新的 COVID-19 加强疫苗所针对的病毒株）的个体的抗体。

作者为 BA.2.86、其前身 BA.2 和另外两个 Omicron 亚变体 XBB.1.5 和 EG.5.1 构建了假病毒（仅经历一个复制周期的合成病毒）。然后，作者测试了这些假病毒进入宿主细胞是否被来自总共五剂疫苗的个体血液中的抗体所阻止，包括三种单价（针对一种变体）和两种二价（针对两种变体）疫苗。作者还评估了多次接种疫苗后“突破性”BA.2或XBB.1.5感染者血液中抗体的影响。接下来，为了确定BA.2.86刺突蛋白中的哪些突变赋予了抗体抗性，作者生成了假病毒，每个假病毒都携带BA.2.86突变之一。作者使用一组针对每个表位的 26 种单克隆抗体测试了它们对中和的敏感性——抗原的抗体结合区域，已知这些抗原可以刺激中和抗体的产生。最后，作者使用一种称为表面等离子体共振的技术来量化刺突蛋白与血管紧张素转换酶 2（宿主细胞表面识别 SARS-CoV-2 的受体）的结合亲和力。

作者发现BA.2.86对人血清中和的抵抗力并不比XBB.1.5或EG.5.1强（图1a），这表明BA.2.86在这方面不具有生长优势。来自XBB.1.5突破性感染个体的血清显示出针对所有测试假病毒的高水平中和抗体（图1a），这表明更新的基于XBB.1.5的疫苗可以提供额外的保护。作者发现了六种刺突突变，这些突变增加了BA.2.86逃避抗体的能力。其中包括一种突变，该突变有助于从一些处于临床开发中的单克隆抗体中逃逸。相反，其他四个刺突突变增加了BA.2.86对某些抗体中和的敏感性。值得注意的是，BA.2.86 的受体结合亲和力比 EG.5.1 或 XBB.1.5 强得多（图 1b），这可能会增强其传播。

这些发现表明，更新后的基于XBB.1.5的疫苗将对包括BA.2.86在内的流行变异株产生令人满意的抗体反应。然而，SARS-CoV-2无疑将继续进化——通常是快速的——并且会出现新的变种。因此，作者必须预测并准备应对能够逃避当前疫苗提供的保护的变异株。    

COVID-19 疫苗会引起体液（基于抗体）和 T 细胞免疫反应，这两者都在决定身体控制 SARS-CoV-2 感染的程度方面发挥作用。然而，目前的研究侧重于疫苗诱导的免疫力，没有解决细胞反应，也没有考虑可能影响SARS-CoV-2传播或发病机制的病毒元素（刺突蛋白除外）。

几种基于 XBB.1.5 的 COVID-19 加强疫苗，例如美国公司 Moderna 和辉瑞公司生产的更新的 mRNA 疫苗，已获得临床批准。重要的是要验证这些加强剂引发的抗体反应是否能有效中和当前的奥密克戎亚变体，包括BA.2.86。此外，需要继续监测SARS-CoV-2和创新方法，以预测其进化轨迹。

原文链接：https://www.nature.com/articles/s41586-023-06750-w   

转自：“生物医学科研之家”微信公众号

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