课题组简介
课题组主要利用多组学、进化基因组学、群体遗传学及分子生物学方法，分析近缘物种、驯化群体及自然群体，从而鉴定茄科作物进化及驯化过程中受选择位点，解析复杂性状遗传机制及演化规律，挖掘育种有益位点；以此利用全基因组预测、机器学习等生物信息及分子生物学手段辅助基因组设计育种，解决茄科作物育种难题，提高育种效率，实现重要性状的快速改良。课题组招收硕士、博士、钟山青年研究员及教师（讲师或副教授编制）。
课题组长吴瑶瑶博士，2009年毕业于南京农业大学金善宝实验班，2013-2018年，中国农业大学博士，师从田丰教授。2018-2023年，于中国农业科学院深圳农业基因组研究所黄三文组进行马铃薯、番茄等茄科作物遗传育种研究。2019-2021年，进入康奈尔大学EdBuckler课题组进行群体遗传学的合作研究。迄今已在国际学术期刊发表论文10余篇，其中近五年以第一作者或通讯作者在Cell、Molecular Plant、Plant Genome、Journal of Integrative Agriculture等期刊上发表文章。
联系方式：
yaoyaowu@outlook.com;
yywyaoyaowu@gmail.com;
招聘岗位：
钟山青年研究员及青年教师。
招聘需求
在分子生物学、遗传学、基因组学、群体遗传学、园艺学等相关研究方向，拟招聘钟山青年研究员2名，青年教师1名。将从事分子生物学实验和生物信息学分析，结合多组学数据，剖析关键农艺性状的遗传基础，并开展茄科作物遗传育种研究。青年教师（讲师或副教授编制）以分子生物学、遗传育种优先。
应聘条件
1.获得或即将获得分子生物学、遗传学、作物遗传育种、园艺学、生物信息学、基因组学等相关专业博士学位。
2.以第一作者发表高水平文章。
3.热爱科研，具有以解决科学问题为导向的实验设计能力。
4.具有良好的学习能力，逻辑能力，表达沟通能力。
5.具有以批判思维阅读英文文献的能力及以及良好的中英文写作能力。
6.具有强烈的钻研精神和责任心，工作细心、踏实、积极主动、持之以恒。
7.为人乐观向上，富有团队协作精神。
钟山青年研究员待遇
1.聘期内钟山青年研究员年薪不少于23万元，业绩特别优秀人员，年薪可达25-30万元及以上。钟山青年研究员如在岗期间获得“博士后创新人才支持计划”项目、“博士后国际交流计划引进项目”、江苏省“卓越博士后资助计划”或其他博士后专项人才项目，在保持学校待遇基础上全额享受相关博士后专项计划的资助叠加，项目资助期内年薪可达65万元及以上。学院、平台、中心在此基础上进一步提供支持条件，具体资助额度根据签订的聘用合同执行。享受国家重点实验室博士后专项经费补贴，出站前根据研究完成情况发放绩效津贴。
2.享受学校在职教职工的福利待遇，学校依法为钟山青年研究员办理社保和住房公积金等待遇。
详情请见http://www.njau.edu.cn/2023/0411/c579a123100/pagem.htm
招生：硕士、博士研究生。
应聘条件：热爱科学研究，并乐于为之脚踏实地的奋斗。
代表论文：
1. Yaoyao Wu#, Dawei Li#, Yong Hu#, Hongbo Li, Guillaume P. Ramstein, Shaoqun Zhou, Xinyan Zhang, ZhiguiBao, Yu Zhang, Baoxing Song, Yao Zhou, YongfengZhou,EdelineGagnon,TiinaSärkinen,SandraKnapp,ChunzhiZhang,ThomasStädler,Edward S. Buckler, Sanwen Huang*.(2023) Phylogenomic discovery of deleteriousmutations facilitates hybrid potato breeding.Cell.
2. Yaoyao Wu#*, Keyi Ye#, Jian Yin, Xue Cao, Hongjun Lyu, Yanling Wang, Yaqing Lyu,Yong Hu,Yuxin Jia, Yuanchao Xu,Sanwen Huang,Jinzhe Zhang*.Multi-omics reveals the genetic regulation and function of lncRNAs in tomato.Plant Physiology(Submitted).
3. Yaoyao Wu#, Lynn Johnson#, Baoxing Song, Cinta Romay, Michelle Stitzer, Adam Siepel, Edward Buckler, Armin Scheben*.(2022) A multiple alignment workflow shows the effect of repeat masking and parameter tuning on alignment in plants. The Plant Genome15, e20204.
4. Dan Liu#, Liang Yang#, Jinzhe Zhang, Guangtao Zhu, Hongjun Lv,Yaqing Lv, Yanling Wang, Xue CAO, Tianshu Sun, Sanwen Huang*, Yaoyao Wu*.(2019) Domestication and breeding changed tomato fruit transcriptome. Journal of Integrative Agriculture, 19120–132.通讯作者.
5. XufengWang#, QiuyueChen#, YaoyaoWu#, Zachary H.Lemmon, GuanghuiXu,ChengHuang, YamengLiang, DingyiXu, DanLi, John F.Doebley, FengTian*. (2018) Genome-wide analysis of transcriptional variability in a large maize-teosinte population. Molecular Plant 11443-459. 共同第一作者.
6. Yao Zhou#, Zhiyang Zhang#, Zhigui Bao#, Hongbo Li, Yaqing Lyu, Yanjun Zan,Yaoyao Wu, Lin Cheng, Yuhan Fang, Kun Wu, Jinzhe Zhang, Hongjun Lyu, Tao Lin, Qiang Gao, Surya Saha, Lukas Mueller, Zhangjun Fei, Thomas Städler, Shizhong Xu, Zhiwu Zhang, Doug Speed, Sanwen Huang*. (2022) Graph pangenome captures missing heritability and empowers tomato breeding.Nature，606527–534.
7. Baoxing Song, Edward S. Buckler, Hai Wang, Yaoyao Wu,Evan Rees, Elizabeth A. Kellogg, Daniel J. Gates, Merritt Khaipho-Burch, Peter J. Bradbury, Jeffrey Ross-Ibarra, Matthew B. Hufford, M. Cinta Romay*. (2021) Conserved noncoding
sequences provide insights into regulatory sequence and loss of gene expression in maize.Genome Research 311245–1257.
8.XingyaoXiong#,JunboGou#,QinggangLiao#,YanlinLi#,QianZhou,GuiqiBi,Chong Li, Ran Du, Xiaotong Wang, Tianshu Sun, Lvjun Guo, Haifei Liang, Pengjun Lu, Yaoyao Wu, Zhonghua Zhang, Dae-Kyun Ro, Yi Shang, Sanwen Huang, Jianbin Yan. (2021) The Taxus genome provides insights into paclitaxel biosynthesis. Nature Plants，71026–1036.
9. Junwei Yang, Bin Liang, Yuemei Zhang, Yun Liu, Shengyuan Wang, Qinqin Yang, Xiaolin Geng, Simiao Liu, Yaoyao Wu, Yingfang Zhu & Tao Lin*(2022). Genome-wide association study of eigenvectors provides genetic insights into selective breeding for tomato metabolites. BMC biology，20, 120.
10.Dingyi Xu#, Xufeng Wang#, Cheng Huang,Guanghui Xu, Yameng Liang, Qiuyue Chen,Chenglong Wang, Dan Li, Jinge Tian,Lishuan Wu, Yaoyao Wu, Li Guo,Xuehan Wang, WeihaoWu,Weiqiang Zhang, Xiaohong Yang andFeng Tian*.(2017) Glossy15plays an important role in the divergence of the vegetative transition between maize and its progenitor, teosinte. Molecular Plant，101579-1583.
11. Guanghui Xu#, Xufeng Wang#, Cheng Huang, Dingyi Xu, Dan Li, Jinge Tian, Qiuyue Chen, Chenglong Wang, Yameng Liang, Yaoyao Wu, Xiaohong Yang, Feng Tian. (2017) Complex genetic architecture underlies maize tassel domestication.New phytologist， 214852–864.
12. Dan Li, Xufeng Wang, Xiangbo Zhang, Qiuyue Chen, GuanghuiXu,DingyiXu,ChenglongWang,YamengLiang,LishuanWu,ChengHuang,JingeTian, YaoyaoWu, Feng Tian. (2015) The genetic architecture of leaf number and its genetic relationship to flowering time in maize. New phytologist 210256–268.
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