中科院遗传发育所任勃/钱文峰课题组绘制大豆单细胞水平根瘤发育和共生固氮转录图谱
A high-resolution transcriptomic atlas depicting nitrogen fixation and nodule development in soybean
Baocheng Sun, Yu Wang, Qun Yang, Han Gao, Haiyu Niu, Yansong Li, Qun Ma, Qing Huan, Wenfeng Qian and Bo Ren
J. Integr. Plant Biol. 2023, 65 (6): 1536-1552.
https://doi.org/10.1111/jipb.13495
根瘤是豆科植物固氮的器官，由根瘤菌和植物共生形成。由于其复杂的细胞异质性，研究大豆根瘤发育和共生固氮分子机理的转录水平调控充满挑战。JIPB第6期刊发了中国科学院遗传与发育生物学研究所任勃课题组与钱文峰课题组题为“A high-resolution transcriptomic atlas depicting nitrogen fixation and nodule development in soybean”的研究论文。该研究利用单细胞核转录组测序绘制了高分辨率大豆根瘤发育和共生固氮的转录图谱，在单细胞水平解析了大豆根瘤的细胞组成和根瘤发育的转录水平调控机制，拓宽了对定型根瘤发育的理解，为提高豆科作物固氮效率提供了潜在的策略。
中科院昆明植物所孙航团队在超高多样化类群的系统演化方面取得重要进展
An updated classification for the hyper‐diverse genus Corydalis (Papaveraceae: Fumarioideae) based on phylogenomic and morphological evidence
Jun‐Tong Chen, Magnus Lidén, Xian‐Han Huang, Liang Zhang, Xin‐Jian Zhang, Tian‐Hui Kuang, Jacob B. Landis, Dong Wang, Tao Deng and Hang Sun
https://doi.org/10.1111/jipb.13499
长期以来，关于罂粟科中具有超高多样化的紫堇属（约530种）的系统发育研究往往基于个别叶绿体基因片段和少数类群取样，未能很好解决属内的组间系统发育关系，且所提出的亚属级和组级分类系统一直存在争议。近日，JIPB在线发表了中科院昆明植物所孙航研究团队题为“An updated classification for the hyper-diverse genus Corydalis (Papaveraceae: Fumarioideae) based on phylogenomic and morphological evidence”的研究论文。该研究对紫堇属首次进行全球广泛取样并测序，获得280个代表类群的叶绿体基因组序列和271个代表类群的低拷贝核基因数据集，涵盖紫堇属当前已定义的所有组和“系”。基于质体基因组和核基因两套数据，研究构建了紫堇属迄今最全面和最稳固的系统发育树，探讨了属下拓扑结构的核质不一致情况，阐明了属内的组间系统关系。在此基础上，结合形态学证据、地理分布和祖先特征的重建，研究人员提出了一个全新的紫堇属组级分类系统，包括4个亚属（1个新亚属被建立）、39 个组，并对各组异名进行了全面梳理，极大提高了对紫堇属性状进化的理解，为深入的分类学、多样性进化以及资源利用和保护等研究奠定了坚实基础。
新技术！中国农科院作科所刁现民课题组成功开发谷子智能不育系统
A straight‐forward seed production technology system for foxtail millet (Setaria italica)
Wei Zhang, Xiantao Qi, Hui Zhi, Yushuang Ren, Linlin Zhang, Yuanzhu Gao, Yi Sui, Haoshan Zhang, Sha Tang, Guanqing Jia, Chuanxiao Xie, Chuanyin Wu and Xianmin Diao
https://doi.org/10.1111/jipb.13503
利用杂种优势可以提高作物的产量和品质，而雄性不育系是自花授粉作物杂种优势利用的关键。谷子（Setaria italica）属于禾本科黍亚科狗尾草属，具有明显的杂种优势，然而谷子中细胞质雄性不育和环境敏感型细胞核雄性不育等系统尚未建立，严重影响了其杂种优势利用及杂交育种工作。近日，JIPB在线发表了中国农业科学院作物科学研究所刁现民课题组题为“A straight-forward seed production technology system for foxtail millet (Setaria italica)”的研究论文。该研究利用谷子细胞核雄性不育基因SiPKS2成功构建了谷子智能不育系统，同时提出谷子智能不育系统应用新策略。该策略可不经种子分选机分选过程即可实现不育系种子的快速扩繁，从而满足谷子杂交制种需求，对于提升谷子杂种优势利用水平具有重要意义，为谷子及其他高繁殖系数作物智能不育系统的利用提供了全新应用思路。
中国农科院作科所景蕊莲课题组发现小麦抗旱新机制
DIW1 encoding a clade I PP2C phosphatase negatively regulates drought tolerance by de‐phosphorylating TaSnRK1.1 in wheat
Jingyi Wang, Chaonan Li, Long Li, Lifeng Gao, Ge Hu, Yanfei Zhang, Matthew P. Reynolds, Xueyong Zhang, Jizeng Jia, Xinguo Mao and Ruilian Jing
https://doi.org/10.1111/jipb.13504
小麦是我国的主要口粮作物，干旱缺水严重制约其生产，亟需发掘利用优异基因资源改良小麦抗旱性。然而，抗旱基因发掘进展缓慢，其中一个重要限制因素是抗旱性评价困难。JIPB近日在线发表了中国农业科学院作物科学研究所景蕊莲课题组题为“DIW1 encoding a clade I PP2C phosphatase negatively regulates drought tolerance by dephosphorylating TaSnRK1.1 in wheat”的研究论文。该研究以干旱条件下叶片萎蔫程度为指标评价小麦保水力及抗旱性，通过图位克隆得到一个功能获得性基因DIW1/TaPP2C158，解析其功能，并通过关联分析，找到了TaPP2C158提高抗旱性的优异单倍型。该工作有助于了解小麦抗旱性的分子机制，为小麦抗旱性的遗传改良提供基因资源和分子标记。
北京市农林科学院许勇团队揭示ABA信号转导基因ClSnRK2.3负调控西瓜果实品质形成的新机制
ClSnRK2.3 negatively regulates watermelon fruit ripening and sugar accumulation
Jinfang Wang, Yanping Wang, Yongtao Yu, Jie Zhang, Yi Ren, Shouwei Tian, Maoying Li, Shengjin Liao, Shaogui Guo, Guoyi Gong, Haiying Zhang and Yong Xu
https://doi.org/10.1111/jipb.13535
西瓜（Citrullus lanatus）是典型的非呼吸跃变果实，经过三个进化阶段，由不能正常成熟的祖先种进化为瓤色鲜艳、口感酥脆、含糖量高的栽培西瓜。研究发现ABA主导了西瓜果实成熟进程及果实品质进化，且ABA信号转导基因ClSnRK2.3在最后一个进化阶段，即品质提高阶段受到选择。然而，ClSnRK2.3调控西瓜果实成熟与品质进化的机制仍不明确。近日，JIPB在线发表了北京市农林科学院蔬菜研究所许勇团队题为“ClSnRK2.3 negatively regulates watermelon fruit ripening and sugar accumulation”的研究论文，首次阐明ABA信号传导节点基因ClSnRK2.3负调控非呼吸跃变果实成熟的新机制，为全面揭示非呼吸跃变型果实的分子机制提供了一个新路径。
转自：“iPlants”微信公众号
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