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中国农业大学马会勤团队详细综述芒果基因测序和关键性状研究进展

2022/12/13 11:14:21  阅读:292 发布者:

生物技术的进步迎接着基因组育种时代的到来,这一背景下,热带和亚热带地区的重要水果作物芒果(Mangifera indica L.)的 de novo 转录组数据和遗传图谱数据陆续公开,并在2020年公布了染色体水平的全基因组数据。传统的育种技术在提高芒果质量方面表现出很大的局限性,高效基因工具的应用有助于将现有芒果品种改良成为更迎合市场需求的高经济效益品种。

202211月,Horticulture Research上线了(Advance Access)中国农业大学园艺学院题为 Advances in Sequencing and Key Character Analysis of Mango (Mangifera indica L.)  的综述性文章,这是中国农业大学建立三亚中国农业大学研究院,园艺学科参与热带园艺作物基础与应用基础研究的一项成果。文章系统总结了国内外芒果基因组和转录组测序的最新进展,讨论基因组测序和生物信息学的快速发展为识别、标记、克隆和操作许多经济上重要的基因提供了有效的策略。

1  芒果基因组学研究进程

目前转录组测序或是多组学方法局限于芒果果实成熟的复杂机制研究,包括果实特有的次级代谢物和香气挥发物,果实甜度,非生物和生物胁迫等(图1)。但破译芒果基因组和分析果实相关的转录组为品种鉴定、遗传多样性和生物过程的转录调控提供了宝贵的数据。特别是花期调控,完善芒果果实外观和生长特性的研究已经取得了良好的势头。未来利用多组学数据的全基因组关联,遗传群体和自然群体分析,甚至加入构建的泛基因组,将准确定位关键性状的调控基因,如抗病基因,可以在短时间内轻松、准确地培育出新的优质品种。文章总结发现目前基因功能的验证受困于较低的遗传转化效率和基因型依赖,亟需发展高效的芒果组织培养再生和基因编辑技术。

中国农业大学园艺学院博士后宋苗语和研究生王浩淼为本论文的并列第一作者,马会勤教授为通讯作者。

作者团队介绍

马会勤课题组主要研究领域涉及果树生理生态与智慧生产,长期从事葡萄、芒果和无花果果实发育分子基础研究、种质资源创新、新品种引进、品种保护与栽培技术推广等工作。团队利用生物信息学和分子生物学技术,破译影响果实品质代谢物(糖、花色苷、香气等)的积累调控,以及影响耐贮性的果实软化相关机理;同时致力于开拓农业智慧生产新模式,已研发无人机高光谱遥感监测果树生长和基于近红外光谱对芒果采后品质与贮放潜力预判的无损检测模型。

团队合照

文章链接:

https://doi.org/10.1093/hr/uhac259

转自:“园艺研究”微信公众号

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