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天津大学生命科学学院团队揭示GPR119非典型ClassA结构骨架

2022/12/2 9:00:18  阅读:185 发布者:

糖尿病(diabetes)和肥胖症(obesity)在当下已成为一种流行病,对人类的健康造成了严重的威胁。大麻素受体样G蛋白偶联受体(GPCRGPR119属于AGPCR, 在胰岛β细胞和肠道L细胞中高表达,在维持葡萄糖稳态和影响摄食行为中发挥关键作用。GPR119作为治疗靶点,为寻找具有更好药理特性的新型抗肥胖和抗糖尿病的药物提供可能。

近日,天津大学生命科学学院乔安娜、叶升团队联合湖北大学吴姗团队首次解析了两种代表性激动剂AR231453(第一个人工合成的GPR119激动剂)和MBX-2982(处于II期临床研究)结合的人源GPR119 -Gs复合物的单颗粒冷冻电镜结构(图1),分辨率分别为2.87 Å 2.33 Å。研究者发现GPR119与其他classA家族GPCR不同结构骨架和结合口袋,结合细胞水平功能实验和分子动力学实验等方法,阐明了GPR119的配体识别和与下游Gs蛋白结合的分子机制,为药物的研发提供结构基础。相关研究于近日发表在《Nature Communications》上。

 AR231453-GPR119-Gs(左)和MBX-2982-GPR119-Gs(右)冷冻电镜结构

以往的研究认为,激活态和非激活态的classAGPCR结构都有一个共同的结构骨架,由不同跨膜区(transmembrane domain,)中的36个氨基酸组成的24对相互作用组成。在我们解析的结构中发现,5对相互作用(3.44:5.54, 3.47:5.57, 3.51:5.57, 3.51:5.60 5.54:6.41BallesterosWeinstein numbering used in superscript)不保守(图2)。与经典的classA受体β2AR结构比对发现,TM5的螺旋上升了一个氨基酸,使得其形成新的5TM间相互作用(3.44:5.55, 3.47:5.58, 3.51:5.58, 3.51:5.61 5.55:6.41)。所以,基于以往同源建模得到的GPR119模型进行的药物开发和筛选存在误差,研究团队解析的GPR119结构提高了药物开发的精准性。

 与传统classA家族成员相比,GPR119显示非典型的结构骨架

AR231453/MBX-2982-GPR119-Gs的复合物结构揭示GPR119的结合口袋特征显著:第一,非常深,接近到达膜中间;第二,包含7个跨膜螺旋氨基酸;第三,高度疏水。作者将两个小分子配体的结合口袋分成三个部分(图3):胞外腔(extracellular cavity);共轭相叠阀(stacking gate);激活腔(activation cavity)。胞外腔由胞外氨基酸组成,AR2314532氟苯环和MBX的苯环与受体的F157ECL2W2657.39堆积在一起构成了共轭相叠阀,激活腔包含toggleswitch开关的氨基酸W2386.48。作者对不同的AR231453MBX-2982变构体进行对接实验,结合功能实验完美的揭示了以往药理活性与结构(structure-activity relationship)的分子机制。

为了进一步研究其内源性配体的识别和激活机制,作者对内源性脂类配体油酰乙胺醇(N-oleoylethanolamineOEA)进行了分子对接和信号转导实验。OEA结构中包含长的疏水尾部和亲水头部,它与小分子配体AR231453MBX-2982的结合方式类似。作者发现OEA的顺式双键与W2386.48堆积在一起,在受体激活中发挥关键作用。

GPR119的延展性结合口袋

 此外,结构显示GPR119ICL1Gβ之间存在盐桥,盐桥破坏后使下游的cAMP积累量减少,表明Gβ在GPR119中信号传导中具有重要意义,这在其他AGPCR中从未观察到。结构以及细胞信号转导研究阐明了不同GPR119激动剂的保守结合模式,并深入了解了GPCR的激活和G蛋白偶联的分子机制。

原文链接:

https://doi.org/10.1038/s41467-022-34696-6

转自:“威斯腾生命科学研究院”微信公众号

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