四川农业大学郑有良教授研究团队针对四川地方种质资源和育种品种的品质进行了全面评价和全基因组关联分析
2022/11/11 16:27:35 阅读:134 发布者:
以下文章来源于农业科学微平台 ,作者蒲至恩
小麦是重要的粮食作物,其品质影响着小麦的最终用途。四川作为小麦的生产区之一,品质一直受到育种家的广泛关注。小麦品质性状和蛋白质含量、淀粉含量和湿面筋含量是衡量品质的重要指标,同时受遗传因素和环境因素影响。为了改良四川小麦品质,需要对现有四川特色种质资源进行种质资源评价和特异位点挖掘。
近期,四川农业大学小麦所品质研究团队郑有良教授课题组完成的题为“Identification and validation of novel loci associated with wheat quality through a genome-wide association study”的研究论文在Journal of Integrative Agriculture (《农业科学学报》(英文),JIA) 2022年11期正式发表。
该研究通过多年多点对四川地方小麦和育种品种进行了品质性状评价,并通过全基因组关联分析找到控制蛋白质含量、淀粉含量和湿面筋含量的位点,对位于5D上的位点进行KASP标记开发,用于后续的品质改良。研究结果为四川小麦品质改良提供了种质资源和可利用的分子标记。
该研究采用236份四川小麦材料,包括76个地方品种和160个栽培品种,于2017-2019年在中国四川省的崇州和绵阳四个不同的环境下种植,测定了蛋白质含量、淀粉含量和湿面筋含量。
利用55K芯片共鉴定出12个稳定的QTL/SNPs,其中与GPC、GSC和WGC相关的qtl分别为3个、7个和2个,分别位于1B、1D、2A、2B、2D、3B、3D、5D和7D染色体上,表型变异率 (PVE) 为4.2-10.7%。与之前报道的qtl /基因相比,5个qtl (QGsc.sicau-1BL QGsc.sicau-1DS QGsc.sicau-2DL.1, QGsc.sicau-2DL.2和QWgc.sicau-5DL) 可能是新的位点。
成功构建了与湿面筋浓度相关的5D染色体单核苷酸多态性AX-108770574和AX-108791420的KASP标记。AX-108770574中含有A等位基因的品种和AX-108791420中含有T等位基因的品种,其表型与湿面筋浓度的关系极显著 (P<0.01) 高于含有G等位基因或C等位基因的地方品种。本研究开发和验证的KASP标记可用于小麦品质的分子育种。
四川农业大学小麦研究所品质研究团队郑有良教授为该文章的通讯作者,蒲至恩副教授为该文章第一作者。该研究得到了国家重点研发计划(2017YFD0100900, 2016YFD0102000和 2016YFD0100100)、四川省科学技术厅国际科学技术合作与交流项目 (2019YFH0063) 和四川省重点研发计划 (2018 NZDZX0002) 支持。
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https://doi.org/10.1016/j.jia.2022.08.085
转自:“植物生物技术Pbj”微信公众号
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