细胞半数抑制率IC50的计算与比较，Excel、SPSS和prism哪种方法好用？

以下文章来源于Zto实验动物世界 ，作者Mr lucky yang

情景重现

    有老师咨询IC50用什么软件计算比较准确，本期我们就采用3种方法计算IC50，看看差异大不大。分别采用Excel、SPSS和Graphpad prism来预测计算。

3种方式比较分析

    1.Excel：

  这里随机编了数据如下：

输入到Excel里，然后作图用散点图：

    然后点击鼠标右键添加趋势线（判断用对数拟合）：

拟合曲线和公式如下：

  随机输了拟合还不错，R接近1。然后根据公式，反对数计算出抑制率y在50%时的浓度x值，约为88.32mg/mL。

  2. SPSS：

    我们先输入数据：包括浓度、抑制率和总数（注意总数就写100，不然不能计算）。

    然后分析-回归-Probit，如下：

按照红框选入变量：

运算结果显示：IC50~93.448 Cl [79.826,110.551]

3.prism：

  选择上述X-Y单独对应：

在点击分析，transfer,如下图选择：

  然后点击OK获得转换后的数据，我们再点击分析，选择非线性拟合：

点击OK，然后点击Constrain，分别设置bottom和Top值为0~100。

最终结果为IC50 [80.69-111.5]

【总结】

    Excel：88.32mg/mL，没有置信区间，不知道Excel能不能算。

    SPSS：IC50~93.448 Cl [79.826,110.551]

    Prism：IC50 [80.69-111.5]

今天就分享到这了，可见三种方式，IC50结果相近，那大家自己选择吧~

转自：“如沐风科研”微信公众号

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