浙大学报英文版:转录组揭示弓形虫感染可通过多途径诱导细胞发生凋亡
2022/6/28 10:28:17 阅读:1146 发布者:
目的:研究并阐明弓形虫感染宿主细胞后影响细胞凋亡及相关信号通路。
创新点:通过转录组研究发现弓形虫感染促进了细胞凋亡,并发现了包括DDIT3、GADD45A、CASP3及HtrA2在内的多个关键上调基因。
方法:首先通过流式细胞仪对感染及未感染弓形虫的细胞进行凋亡检测,提取RNA后进行转录组测序,通过转录组基因上调、下调分析,GO和KEGG通路、关键基因富集、基因网络关系图、RT-PCR验证等手段进行分析。
结论:流式细胞仪检测发现弓形虫感染后能显著诱导细胞发生凋亡,进一步的转录组分析发现,与对照组相比,感染组有1579个基因表达有显著变化,其中有918个基因上调,661个基因下调;在富集的54条通路中,凋亡通路有16个关键基因上调,11个基因下调,其中caspase-3是我们发现的关键网络基因。细胞凋亡与细胞周期密切、与免疫及多种疾病有关,进一步深入研究和探索弓形虫与宿主细胞之间的凋亡机制可为寻找理想药物靶点提供理论基础。
关键词组:
弓形虫;转录组;凋亡;感染
Kaige DU, Fei LU, Chengzuo XIE, Haojie DING, Yu SHEN, Yafan GAO, Shaohong LU, Xunhui ZHUO
本文引用格式:
Kaige DU, Fei LU, Chengzuo XIE, Haojie DING, Yu SHEN, Yafan GAO, Shaohong LU, Xunhui ZHUO. Toxoplasma gondii infection induces cell apoptosis via multiple pathways revealed by transcriptome analysis[J]. Journal of Zhejiang University Science B, 2022, 23(4): 315-327.
https://doi.org/10.1631/jzus.B2100877
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