以下文章来源于青椒医学 ,作者青椒哥
随着高通量测序的发展,lncRNA的研究热度一直居高不下,大量lncRNA得到注释,其通过在转录、转录后水平及表观遗传方式调控基因的表达,参与机体的生长发育过程。
与lncRNA相关的研究一直是国自然的热点,但近年来也显现出趋于饱和的趋势,而ceRNA机制的研究更是多得泛滥,中标和文章发表都越来越困难,在这种情况下研究lncRNA怎么才能发高分文章呢?
今天,小编为大家整理了10篇近期发表的lncRNA相关高分文章,另附每篇文章的分子机制图和原文链接,有助于了解最新的lncRNA研究思路,感兴趣的文章可跳转具体链接研读全文。
1. Targeting Xist with compounds that disrupt RNA structure and X inactivation
Nature(IF 49.962)
Pub Date: 2022-03-30
分子机制:越来越多疾病与非编码RNA相关,而靶向这些RNA 将拓宽药物研发的化学空间。为了克服传统RNA药物低特异性的局限,该研究设计了一种基于亲和选择质谱的无偏筛选方式。该方式基于自动配体识别系统(Automated ligand identification system,ALIS),利用生物物理绑定技术,确定配体的亲和力强于10µM的靶物质,识别出可结合非编码RNA原型Xist的小分子,X1化合物具有药物样特征,可在体外和体内特异结合Xist的RepA基序,由此减少RepA的构象空间,最终阻断了X染色体失活的启动。X1的药物化学特性研究将有助于进一步促进其效力以及特异性,从而应用于X染色体失活的再激活以及X染色体连锁的相关疾病。这些研究结果有助于扩大药物筛选的靶标范围,更好地应对药物开发中的挑战。
原文链接:
https://www.nature.com/articles/s41586-022-04537-z
2. WTAP-mediated m6A modification of lncRNA NORAD promotes intervertebral disc degeneration
Nat Commun(IF 14.919)
Pub Date: 2022-03-18
分子机制: 在衰老的髓核细胞(NPC)中,下调的 KDM5a 增强了 WTAP 启动子的 H3K4me3 修饰并促进 WTAP 表达。WTAP 促进 lncRNA NORAD 的 m6A 修饰并通过 YTHDF2 识别诱导 NORAD 转录本的降解。较少的 NORAD 使其与RNA 结合蛋白 PUM1/2的结合减少,导致 PUM1/2 与 E2F3 mRNA 的更多结合,从而促进 E2F3 转录本的降解,促进 NPC 的衰老。这些研究结果提出了m6A调控介导的NPC衰老过程中的机制,揭示了中断NORAD m6A修饰或靶向NORAD/PUMILIO/E2F3轴可以减缓椎间盘退变 (IVDD)的进展,并进一步提供针对IVDD的表观遗传治疗策略。
原文链接:
https://www.nature.com/articles/s41467-022-28990-6
3. A non-coding RNA balancing act: miR-346-induced DNA damage is limited by the long non-coding RNA NORAD in prostate cancer
Mol Cancer(IF 27.401)
Pub Date: 2022-03-22
分子机制: miR-346 在前列腺癌(PC)细胞中诱导快速和广泛的 DNA 损伤——通过转录过度激活、R 环形成和复制压力导致检查点激活和细胞周期停滞。miR-346与基因组保护性 lncRNA NORAD 相互作用以破坏其与 PUM2 的相互作用,导致 PUM2 稳定并增加 DNA 损伤反应 (DDR) 转录本的转换。NORAD 表达和活性与较差的 PC 临床结果和活检 RNA-seq 研究中增加的 DDR 密切相关。相比之下,miR-346 与 PC 存活率的提高有关。NORAD 沉默使成熟的 miR-346 水平增加数千倍,NORAD能够拯救miR-346 诱导的 DNA损害。miR-346 使 PC 细胞对包括 PARP 抑制剂和化疗在内的 DNA 损伤药物敏感,并作为体内单一疗法诱导肿瘤消退,表明靶向 miR-346/NORAD 平衡是一种有效的治疗策略。这些研究结果表明miR-346 和 NORAD 之间的平衡作用调节 PC 中的 DNA 损伤和修复。在晚期 PC 和转录过度活跃的癌细胞中观察到的 NORAD 减少的情况下,miR-346 作为治疗剂可能特别有效。
原文链接:
https://molecular-cancer.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12943-022-01540-w/figures/6
4. WDR82-binding long noncoding RNA lncEry controls mouse erythroid differentiation and maturation
J Exp Med(IF 14.307)
Pub Date: 2022-04-04
分子机制:该研究通过深度RNA测序分析了16个小鼠造血细胞群的转录组,并鉴定了一种新型lncRNA Gm15915,其在红细胞相关的祖细胞和红细胞中高度表达。因此,将其命名为lncEry。研究人员还鉴定了一种新的 lncEry亚型,这是以前没有报道过的主要转录本。lncEry缺失导致红细胞生成受损,表明lncRNA在调节红细胞分化和成熟中发挥重要作用。机制上,lncEry与WDR82(WD重复蛋白82)相互作用以促进Klf1和珠蛋白基因的转录,从而分别控制红细胞生成的早期和晚期阶段。这些研究结果将lncEry确定为红细胞生成转录调控的重要参与者。
原文链接:
https://rupress-org.proxy.library.carleton.ca/jem/article/219/4/e20211688/213079/WDR82-binding-long-noncoding-RNA-lncEry-controls
5. Interaction of lncRNA MIR100HG with hnRNPA2B1 facilitates m6A-dependent stabilization of TCF7L2 mRNA and colorectal cancer progression
Mol Cancer(IF 27.401)
Pub Date: 2022-03-12
分子机制:MIR100HG的表达与EMT标记物密切相关,并作为EMT的阳性调节因子。MIR100HG在体外和体内均能维持西妥昔单抗耐药性,促进结直肠癌(CRC)细胞的侵袭和转移。hnRNPA2B1被鉴定为MIR100HG的结合蛋白。在机制上,MIR100HG通过与hnRNPA2B1相互作用,维持了TCF7L2的mRNA稳定性,TCF7L2是Wnt/β-catenin的主要转录激活因子。hnRNPA2B1在MIR100HG存在下识别TCF7L2 mRNA的m6A位点。TCF7L2反过来激活MIR100HG转录,形成正反馈调节回路。MIR100HG/hnRNPA2B1/TCF7L2轴在出现局部或远处转移或与西妥昔单抗耐药相关的疾病进展的CRC患者中得到增强。这些研究结果表明,MIR100HG是结肠癌中一种有效的EMT诱导剂,激活MIR100HG/hnRNPA2B1/TCF7L2反馈回路能够增强CRC对西妥昔单抗的耐药性和转移能力。
原文链接:https://molecular-cancer.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12943-022-01555-3
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