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Western blot——从黑白条带to组合SCI图

2022/4/19 17:37:50  阅读:617 发布者:chichi77

背景介绍

最近在做WB的实验,发现自己以前也没有写过相应的帖子,所以就着手写一篇关于从拿到WB的图,到最后的SCI组合图的帖子。希望对大家的WB数据分析有所帮助!也祝大家WB顺利出结果!

软件介绍

[软件名称]FIJI或者ImageJ

[软件名称]AI2021

[软件名称]Origin2022(也可使用其他软件皆可以)

[软件名称]Excel2019

[WB]FIJI或者ImageJ内置

AI进行条带组合

1.AI新建画板设置相应名称,颜色模式,以及对应ppi或者dpi

2.将自己实验做出来的放进去AI,这里我用的是一张软件自带的。拖拽进去,首先将嵌入AI

3.使用矩形工具,将最下面的内参框选起来,如果出现了白色,将填充颜色设置为无填充即可

4.选中左边的选框和条带,Alt+鼠标移动,即可出现一模一样的图形

5.将右边的选框挪动,选中第二个条带

6.同理,选中第三个,进行复制平移。同时,选中黑色框框,复制对应的三个在下边备用

7.选中第一个的和选框,右击,建立剪切蒙版

8.同时将最下面的黑色选框将其对其,右击,编组

9.其他两个同理。

10.选中三个将其进行对其:水平居中,纵向分布

11.使用文本工具,添加上对应的指标名称即可

12.成图了

FIJI/ImageJ对条带进行积分

1.打开FIJI/ImageJ,打开一个Excel,将拖拽进去FIJI

2.首先对条带转置为8-bit

3.进行矫正背景

4.一般直接点一下Auto就行了

5.也可以通过手动设置对比度

6.直接使用矩形工具,对图形进行积分

7.然后再选择Plot Lanes

8.出现波浪线之后,对图形进行封口,记住是封口,一定要封紧。这种采用直线封底的方法,其实是扣除了背景值的。因为在曲线上,纵坐标值只有显著高于背景值才会出峰。

9.使用魔棒工具,点击封口的部分,就会出现相应的面积

10.将数值复制到Excel

11.同理,将上面两条带,按照上述步骤进行,得到数据,放在Excel

12.将指标的数值除以对应的内参数值,即可得到相对数值,也就是作图用的数值。目前这是一次实验的结果,那么一般情况,我们最少得重复三次实验,才能拿着数据去统计。

13.第二次和第三次做完实验后,按照上述进行数据处理即可,得到三组可以用来作图的数据。

Origin进行作图

1.打开Origin软件,我们先来做Ras的指标,将数据整理一下:将Ras的数据放在一起

2.复制进去Origin软件

3.对数据按照列进行统计

4.一般选择均值和标准差就行

5.复制均值和标准差进行绘图即可

Origin进行绘图

1.右击Origin的下方,插入表格

2.将每组的数值复制进来,并将Sd设置为y误差

3.选中数据,点击柱状图

4.对图形标签和颜色进行设置,哪里需要设置,点哪里,最终柱状图就成型了。

5.柱状图的**好像还没有添加,一般常用的有t检验或者单因素方差分析,统计结果分析出来直接进行添加即可。这里我们使用Origin进行单因素方差即可。

Origin做单因素方差分析的内容可以参考下方:

数据的描述统计和正态性检验

Origin如何做单因素方差分析

Origin如何进行非参数检验并作图

6.最后我们将图形使用AI软件组合在一起即可

7.怎么样,赶紧来试试吧!

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