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Mol Cancer | 广西医科大学苏成团队揭示AP-1在ccRCC中的关键作用

2024/1/4 17:09:52  阅读:48 发布者:

透明细胞肾细胞癌(ccRCC)是肾癌最常见的组织学亚型,据报道主要起源于肾脏近端小管(PT)细胞。然而,目前对其相关分子机制的研究相对有限。

20231219日,广西医科大学苏成团队在Molecular CancerIF=37)在线发表题为“Unveiling the hidden AP-1: revealing the crucial role of AP-1 in ccRCC at single-cell resolution”的研究论文,该研究分析了来自不同研究团队的多个单细胞多组学数据集,揭示了激活蛋白1 (AP-1)ccRCC肿瘤发生中的重要作用。转录因子(TFs)的基序活性分析显示,与PT细胞相比,AP-1ccRCC癌细胞中具有明显的激活作用。此外,在单细胞分辨率下的研究结果显示,与ccRCC癌细胞相比,PT细胞中AP-1的表达明显缺失。

在发现队列的bulk-RNA中,正常肾脏和ccRCC样本中未检测到AP-1的差异表达,这可能归因于bulk-RNA测序的混淆效应。与此同时,空间转录组学分析显示,AP-1的表达范围比ccRCC标记物CA9更广。此外,在包括PT细胞在内的各种细胞类型中观察到AP-1的染色质可及性,这表明AP-1PT细胞中的转录表达可能受到后续转录修饰的影响,反映了AP-1转录的复杂调控机制。这些发现为深入了解AP-1ccRCC中的功能和调控机制提供了重要的见解,从而为今后的临床研究和治疗策略的制定奠定了理论基础。

透明细胞肾细胞癌(Clear cell renal cell carcinoma, ccRCC)是肾癌最常见的侵袭性组织学亚型,其全球发病率和死亡率每年都在持续上升。ccRCC临床表现不明显,具有侵袭性,在初诊时转移的发生中发挥了重要作用。尽管在转移性ccRCC的治疗干预方面取得了进展,但这一特殊类别的患者预后不利,总5年生存率仅为10%。目前,大量报道表明近端小管细胞是ccRCC癌细胞的主要来源。然而,人们目前对ccRCC肿瘤发生背后的分子机制的理解仍然相对有限。全面阐明ccRCC肿瘤发生的潜在机制势在必行,这将为制定有效的治疗策略奠定基础理论基础。

AP-1(激活蛋白1)转录因子是由JUN (c-JunJunBJunD)FOS (c-FosFosBFra-1Fra-2)ATFMAF蛋白家族成员组成的二聚体复合体。AP-1蛋白通过亮氨酸-拉链基序形成二聚体复合物,AP-1复合物的活性受到二聚体组成以及细胞和遗传背景的影响。特定二聚体的组成决定了下游被调控的基因。AP-1参与广泛的生理和病理过程。特别是在肿瘤发生和进展中,许多研究证明了它的重要作用。尽管AP-1在各种癌症类型中的广泛研究,但人们对其在ccRCC中的具体参与,特别是在阐明ccRCC肿瘤发生方面的理解仍然有限。

基于bulk-RNA数据的FOSJUN家族基因在ccRCC中的生存分析(图源自Molecular Cancer

该研究采用单细胞多组学分析来初步了解与PT细胞相比,AP-1ccRCC癌细胞中的显著激活。这一发现强调了AP-1ccRCC肿瘤发生中的关键作用。此外,在单细胞水平检测到的PT细胞中AP-1表达的缺失,突出了在大体积RNA测序研究中考虑细胞异质性混杂效应的重要性。此外,人们对与AP-1相关的染色质可及性的研究表明,AP-1PT细胞中的转录表达可能受到随后的转录修饰的影响,突出了AP-1转录的复杂调控机制。这些发现为深入了解AP-1ccRCC中的功能和调控机制提供了有价值的见解,从而为今后的临床研究和治疗策略的制定奠定了理论基础。

原文链接:

https://doi.org/10.1186/s12943-023-01913-9

转自:iNature”微信公众号

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