在之前的文章中,分享了Matlab散点图矩阵的绘制模板:
也分享过气泡矩阵图的绘制模板:
考虑到规范性和便捷性,再来分享一下进阶版的气泡矩阵/热图。
先来看一下成品效果:
模板中最关键的部分内容:
1. 数据准备
此部分主要是读取原始数据并初始化绘图参数。
% 读取数据
load data.mat
% 生成矩阵坐标数据
[r,c] = size(data);
x = 1:c;
y = 1:r;
[xx,yy] = meshgrid(x,y);
yy = flipud(yy);
f1 = data(:)*10;
f2 = data(:);
2. 颜色定义
作图不配色就好比做菜不放盐,总让人感觉少些味道。
但颜色搭配比较考验个人审美,需要多加尝试。
这里直接使用TheColor配色工具中的SCI权威配色库:
%% 颜色定义
map = TheColor('sci',2068);
% map = flipud(map);
3. 进阶气泡热图绘制
通过调用‘bubblechart’和‘tiledlayout’命令,绘制初始气泡热图。
t = tiledlayout(1,1);
nexttile
bubblechart(xx(:),yy(:),f1,f2,'MarkerFaceAlpha',0.8);
bubblesize([5 25])
hTitle = title('BubbleMatrixPlus Plot');
hXLabel = xlabel('XAxis');
hYLabel = ylabel('YAxis');
4. 细节优化
为了插图的美观,对坐标轴细节等进行美化:
% 赋色
colormap(map)
% 坐标轴美化
axis equal
set(gca, 'Box', 'on', ...
'XGrid', 'on', 'YGrid', 'on', ...
'TickDir', 'in', 'TickLength', [0 0], ...
'XMinorTick', 'off', 'YMinorTick', 'off', ...
'XColor', [.1 .1 .1], 'YColor', [.1 .1 .1],...
'XTick', 0:1:c+1,...
'XLim', [0 c+1],...
'YTick', 0:1:r+1,...
'YLim', [0 r+1],...
'XTickLabel',{'','A1','A2','A3','A4','A5','A6','A7','A8','A9','A10',''},...
'YTickLabel',{'','B1','B2','B3','B4','B5','B6','B7','B8','B9','B10',''})
ytickangle(90)
% 添加图例
% 颜色条
cb = colorbar;
cb.Label.String = 'Feature2';
cb.Layout.Tile = 'east';
% 气泡尺寸
blgd = bubblelegend('Feature1',...
'Style','vertical',...
'BubbleSizeOrder','descending',...
'box','on',...
'NumBubbles',3,... ...
'FontName', 'Arial',...
'FontSize', 10);
bt = get(blgd,'Title');
bt.FontWeight = 'normal';
bt.FontName = 'Arial';
bt.FontSize = 10;
blgd.Layout.Tile = 'east';
% 字体字号
set(gca, 'FontName', 'Arial', 'FontSize', 10)
set([hXLabel,hYLabel], 'FontName', 'Arial', 'FontSize', 11)
set(hTitle, 'FontSize', 13, 'FontWeight' , 'bold')
% 背景颜色
set(gcf,'Color',[1 1 1])
设置完毕后,以期刊所需分辨率、格式输出图片。
%% 图片输出
figW = figureWidth;
figH = figureHeight;
set(figureHandle,'PaperUnits',figureUnits);
set(figureHandle,'PaperPosition',[0 0 figW figH]);
fileout = 'test';
print(figureHandle,[fileout,'.png'],'-r300','-dpng');
以上。
转自:“阿昆的科研日常”微信公众号
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