中山大学史俊鹏副教授课题组
GenoShilab
GenoShilab成立于2020年8月,位于深圳市光明区中山大学深圳校区,课题组负责人为史俊鹏副教授(博士生导师,入选中国科协第七届青年托举人才、中山大学“逸仙学者”、深圳市高层次人才)。
课题组主要从事玉米及近缘种的比较基因组学和染色质组学研究。团队现有副教授1人、博士后1人、研究助理1人、研究生5人、本科生4人,已发表研究论文16篇,其中代表性成果以第一和通讯作者(含共同)发表在Nat Genet (2023 & 2018)、Nat Com (2019)、Mol Plant (2023 & 2019)、PNAS (2016)、Plant Com (2023)等杂志。主持国家自然科学基金面上项目(2023 & 2021)、中国科协青年人才托举工程(2021)、国家自然科学基金青年项目(2019)等国家和省部级项目8项。
研究方向
我们立足作物育种前沿——
Q:我们的研究对象?
玉米及其黍亚科近缘作物
Q: 我们的研究手段?
二代和三代测序技术,比较基因组学和染色质组学
Q:我们的研究内容?
作物演化和育种选择过程的基因组结构变异和染色质调控
研究成果
课题组成立以来发表论文:
(*共同第一作者;#共同通讯作者)
1. Zhu Y*, Wang Z*, Zhou Z, Liu Y, Gao X, Guo W, Shi J. HEMU: an integrated Andropogoneae comparative genomics database and analysis platform.bioRxiv, 2023, DOI: https://doi.org/10.1101/2023.05.19.541421
2. Wang Z*, Huang S*, Yang Z, Lai J, Gao X#, Shi J#. A high-quality, phased genome of broomcorn millet reveals the features of its subgenome evolution and 3D chromatin organization.Plant Communications, 2023 May 8;4(3):100557. doi: 10.1016/j.xplc.2023.100557.
3. Shi J#, Tian Z, Lai J & Huang X#. Plant pan-genomics and its applications.Molecular Plant, 2023, 16(1): 168-186.
4. Wang B*, Hou M*, Shi J*, Ku L*, Song W*,..., Chen Y#, Zhao J#, Lai J#, Wang H#. De novo assembly and analysis of twelve founder inbred lines provide genomics insights into heterotic groups and heterosis in maize.Nature Genetics, 55, 312-323 (2023). https://doi.org/10.1038/s41588-022-01283-w.
5. He Q*, Tang S*, Zhi H*, Chen J*,..., Shi J,..., Jia G#, M Purugganan#, Diao X#. A graph-based genome and pan-genome variation of the model plant Setaria. Nature Genetics 55, 1232-1242 (2023). https://doi.org/10.1038/s41588-023-01423-w.
6. Chen J*, Wang Z*, Tan K, Huang W, Shi J,..., Lai J#. A complete telomere-to-telomere assembly of the maize genome.Nature Genetics 55, 1221–1231 (2023). https://doi.org/10.1038/s41588-023-01419-6.
代表性科研项目:
1. 国家自然科学基金面上项目(32372115,玉米及其近缘作物染色质开放性的演化研究,50万元,2024.1-2027.12,负责人,在研)
2. 国家自然科学基金面上项目(32172014,玉米驯化过程中非基因区结构变异的研究,58万元,2022.1-2025.12,负责人,在研)
3. 高校基本业务费中山大学青年拔尖人才培优项目(23lgbj016,玉米及其近缘作物染色质开放性的演化研究,40万,2023.1-2024.12,负责人,在研)
4. 中国科协青年人才托举工程项目(2021QNRC001,45万元,2021.12-2024.12,负责人,在研)
5. 中山大学百人计划人才启动经费(60万元,2020.9-2023.12,负责人,在研)
研究团队
我们团结且充满活力——
课题组负责人
史俊鹏副教授
课题组负责人史俊鹏博士为中山大学“百人计划”引进人才,副教授,博士生导师。长期从事作物基因组学和生物信息学研究,已发表论文16余篇,其中9篇以第一和共同第一作者发表在国际顶尖学术期刊Nat Genet (2023 & 2018)、Nat Com (2019)、Mol Plant (2023 & 2019)、PNAS (2016)、Plant Com (2023)等,总引用超过1000次。主持国家自然科学基金项目3项,入选第七届中国科协青年托举人才。
博士后
高翔博士(2021.11-至今)
主要研究方向:作物基因组学,表观组学以及蛋白质互作组学
简介:有家室,有娃~
研究助理
孔倩倩(2023.7-至今)
主要研究方向:基因组组装及比较基因组学
简介:性格稳重如体重
研究生
刘玉亭(2021.9-至今)
主要研究方向:玉米表观组学
简介:intj天秤座
姜艺(2022.9-至今)
主要研究方向:作物基因组学、玉米表观组学
简介:00年生,我超e的
范晓星(2022.9-至今)
主要研究方向:作物基因组学
简介:理性乐观派!
徐可妍(2023.9-至今)
主要研究方向:玉米表观组学
简介:爱科研爱学习爱生活
李昱辉(浙江农林大学客座,2023.6-至今)
主要研究方向:楠木基因组学和群体遗传学
简介:喜欢科研和篮球
本科生
王梓杰(20级)
主要研究方向:染色质组学、组学数据的整合开发及人工智能挖掘
简介:为天地立心,为生民立命,为往圣继绝学,为万世开太平
朱驭之(20级)
主要研究方向:比较基因组学、染色质组学和组学大数据整合开发
简介:喜欢摄影和打羽毛球,目前尚未找到对象 /doge
刘铸乐(21级)
主要研究方向:比较基因组学、染色质组学
简介:很高兴有机会加入这个大家庭,在这里不仅能学到专业的科研技能,还能认识一群可爱的老师师兄师姐,非常欢迎同学们来我们课题组交流互进。
杨骏宇(20级)
主要研究方向:比较基因组学、染色质组学
简介:爱好音乐&旅游,想去走遍大江南北
课题组已毕业学生
杨政乐(硕士,中山大学,2021.3-2022.6)
黄诗慧(客座硕士、香港中文大学,2020.8-2022.6)
甘苑娴(硕士,中山大学,2020.9-2023.6)
孔倩倩(硕士,中山大学,2020.9-2023.6)
王志恒(硕士,中山大学,2020.9-2023.6)
张天旭(本科,2020.9-2023.6)
江应平(本科,2020.9-2023.6)
叶笑雨(本科,2020.9-2023.6)
博士后招聘
我们诚挚邀请优秀的你——
岗位职责:
招聘博士后2-3名,独立开展课题,协助课题组组长指导研究生及独立申报科研项目等。
岗位条件:
具有农学、植物学、生物信息学、遗传学等相关专业博士学位,熟悉Linux环境以及Python/R/Perl等编程语言,有一定的统计学基础,或熟悉高通量测序和高通量功能基因组学手段(RNA-seq、ATAC-seq、DAP-seq、Chip-seq等),以第一作者发表过相关高水平论文,年龄不超过35岁,具有良好的英文写作及口头交流能力。
相关待遇:
聘期内提供国内有竞争力的工资、福利待遇(欢迎咨询)。入职中山大学深圳校区的博士后,可以申请居住学校人才房以及深圳市的相关人才待遇和项目。
联系方式:
应聘者请将个人简历、代表性论文的合并版本PDF以附件形式发送至:shijp6@mail.sysu.edu.cn ,邮件标题为“申请人姓名+现单位+博士后申请”,课题组将对应聘者的信息保密。
转自:“iPlants”微信公众号
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