中科院植物所博士后以共同第一作者身份在Plant Physiology上发表研究成果

近日，中国科学院植物研究所张梅研究组联合焦远年研究组等发布了马齿苋高质量的参考基因组，并结合比较基因组学和转录组学分析深入探讨了马齿苋基因组中整合C4和CAM光合途径的分子基础及其起源进化的过程。比较基因组学分析表明，马齿苋在核心真双子叶植物分化后经历了两次全基因组加倍（WGD）事件。进一步分析发现，C4和CAM途径中关键酶或转运蛋白的编码基因以及一些重要的转录因子家族如热休克因子A（HsfA）通过WGD和串联重复（TD）事件显著扩张，且在高温干旱处理下高度表达。该结果暗示马齿苋基因组中的WGD和TD基因促进了其对逆境胁迫环境的适应性。研究还通过对石竹目中多个物种编码磷酸烯醇丙酮酸羧化酶（PEPC）的基因家族进行系统发育分析、功能位点鉴定、昼夜表达模式检测等，准确鉴定了马齿苋中分别参与C4和CAM光合固碳途径的基因拷贝。并通过多物种的共线性及Ks分析等发现WGD和TD事件参与了马齿苋基因组中PEPC编码基因多拷贝的发生。另外通过对编码β-碳酸酐酶（β-CA）的基因家族进行深入分析，发现较为古老的WGD事件是产生C4和CAM特异的β-CA编码基因祖先拷贝的直接原因。最后，通过共表达网络分析鉴定了CAM特异性表达的基因模块。基因启动子的motif富集分析暗示CAM特异性表达基因招募了晚间和午夜节律元件以及由乙烯反应因子顺式元件介导的非ABA依赖的逆境应答模块。

该研究为植物C4和CAM两种光合代谢系统的整合提供了宝贵基因资源，也为作物高光效合成生物学研究奠定了重要基础。这种新型的光合作用系统有望使普通作物转变为“超级作物”，在耐旱的同时保持高产。

研究成果于8月17日在线发表于国际期刊Plant Physiology。中科院植物所博士后王晓亮、工程师马旭旭、博士研究生闫歌和剑桥大学华磊博士为该论文共同第一作者，张梅研究员、焦远年研究员、马旭旭为共同通讯作者。

马齿苋植物特征及基因组组装注释概况

来源：中科院植物所

转自：“植物研究进展”微信公众号

如有侵权，请联系本站删除！