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New Phytol | 河南师范大学植物性别演化与发育生物学研究团队邓传良教授课题组建立一种快速组装单染色体的技术体系

2023/8/28 17:28:43  阅读:110 发布者:

植物性别决定区的鉴定有助于研究性染色体演化、性别决定基因、重组抑制、异染色质形成以及异型染色体进化等。通过全基因组测序,一些植物的性别决定区已被鉴定。但是,全基因组测序通常需要大量的近等基因系和大量群体,并且测序和组装的经济成本较高。另外,基因组的重复序列、多倍性等因素也会干扰组装结果的准确性。因此,植物性别决定区的鉴定受到一定限制。

202382日,河南师范大学植物性别演化与发育生物学研究团队邓传良教授课题组在New Phytologist期刊(生物学1区,IF=10.323)发表了题为“A rapid method for assembly of single chromosome and identification of sex determination region based on single-chromosome sequencing”的研究论文。该研究建立了一种经济高效快速组装单染色体的技术体系,该体系将染色体微分离技术和单细胞测序技术结合,高效精确地组装了菠菜性染色体(XY型)。该研究在XY性染色体上分别鉴定到大约13.2 Mb24.1 Mb的性别决定区以及大约10 MbY染色体雄性特异区。该技术体系也可用于组装其它植物的特定染色体。这为植物性染色体演化和性别决定机制研究提供了新方法。

河南师范大学李宁副教授、周健硕士为该论文共同第一作者,河南师范大学邓传良教授、中国农科院钱伟研究员为该论文共同通讯作者,河南师范大学为第一作者单位。该研究得到了国家自然科学基金项目的资助。

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转自:“植物生物技术Pbj”微信公众号

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