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JIPB | 山东大学生命科学学院谭保才课题组发现玉米线粒体内含子剪接的新机制

2023/8/28 17:18:21  阅读:32 发布者:

以下文章来源于JIPB ,作者JIPB

虽然植物线粒体基因组包含的遗传信息较少,但是对植物生长发育必不可少。线粒体基因的表达涉及复杂的转录和转录后加工过程,包括II型内含子剪接(很少I型)、胞嘧啶到尿嘧啶RNA编辑、5’和3’末端加工等。II型内含子是自剪接RNA,属于可移动逆转录元件家族,存在于原生动物、真菌、植物甚至细菌基因中。然而,植物细胞器II型内含子与其细菌祖先有很大不同,它们失去自我剪接能力,剪接过程需要大量剪接因子辅助完成。目前,细胞器II型内含子剪接的分子机制尚不清楚。

JIPB近日在线发表了山东大学生命科学学院谭保才教授课题组题为“The DEAD-box RNA helicase ZmRH48 is required for the splicing of multiple mitochondrial introns, mitochondrial complex biosynthesis, and seed development in maize”的研究论文(https://doi.org/10.1111/jipb.13558)。该研究发现玉米DEAD-box RNA解旋酶ZmRH48通过与剪接因子PPR-SMR1SPR2互作参与多个线粒体II型内含子剪接,并通过影响线粒体电子传递链复合物IIII的生物合成参与玉米种子发育。

. ZmRH48参与线粒体内含子剪接机制

谭保才课题组发现玉米RNA解旋酶ZmRH48功能丧失严重阻碍了胚胎发生和胚乳发育,导致种子缺陷。ZmRH48定位于线粒体,其功能缺失大大降低了五个顺式内含子(nad5内含子1nad7内含子123ccmFc内含子1)和一个反式内含子(nad2内含子2)的剪接效率,导致线粒体电子传递链复合物IIII含量降低。ZmRH48与两个特殊PPR蛋白类剪接因子PPR-SMR1SPR2相互作用,后二者参与线粒体中超过一半内含子的剪接。PPR-SMR1SPR2相互作用,并都与PPPR蛋白和CRM蛋白Zm-mCSF1相互作用,促进内含子剪接。因此,ZmRH48可能是剪接复合物的组成成分,并对线粒体复合物的形成和玉米种子发育至关重要。

谭保才课题组在线粒体基因转录后加工机制研究中取得一系列进展,揭示了线粒体基因胞嘧啶到尿嘧啶RNA编辑机制(Yang et al., 2022; Wang et al., 2023)。这篇文章揭示RNA解旋酶在线粒体内含子剪接过程中的重要作用。

副研究员杨雁卓为论文第一作者,谭保才教授为通讯作者。该研究得到了国家自然科学基金和山东省自然科学基金的资助。

参考文献:

Yang, Y.Z., Liu, X.Y., Tang, J.J., Wang, Y., Xu, C., Tan, B.C. (2022). GRP23 plays a core role in E-type editosomes via interacting with MORFs and atypical PPR-DYWs in Arabidopsis mitochondria. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 119: e2210978119.

Wang, Y., Li, H., Huang, Z.Q., Ma, B., Yang, Y.Z., Xiu, Z.H., Wang, L., Tan, B.C. (2023). Maize PPR-E proteins mediate RNA C-to-U editing in mitochondria by recruiting the trans deaminase PCW1. Plant Cell. 35: 529-551.

转自:“植物生物技术Pbj”微信公众号

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