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Cell子刊 | 复旦大学丁琛/叶定伟/张海梁/赵健元通过血浆蛋白质组学分析发现与上尿路尿路上皮癌相关的分子特征

2023/8/28 11:43:32  阅读:32 发布者:

上尿路尿路上皮癌(UTUC)通常诊断较晚,预后较差。用于疾病监测的潜在非侵入性生物标志物数据有限。

2023825日,复旦大学丁琛、叶定伟、张海梁及赵健元共同通讯在Cell Reports Medicine 在线发表题为“Plasma proteomic profiling discovers molecular features associated with upper tract urothelial carcinoma”的研究论文,该研究提出了一种综合的组织-血浆蛋白质组学方法来推断识别肌肉侵袭性UTUC患者的特征蛋白。

该研究检测了362UTUC患者和239名健康对照者的血浆蛋白质组学特征。该研究发现了一个反映淋巴结转移的蛋白面板,这对识别高危和预后不良的UTUC患者很有意义。该研究还确定了一个十蛋白分类器,并建立了一个预测UTUC患者无进展生存的进展时钟。最后,在一个独立的队列中通过平行反应监测实验进一步验证了特征蛋白。

UTUC包括输尿管癌和肾盂癌,相对罕见,仅占尿路上皮癌(UCs)的约5%-10%。此外,90%-95%UCs发生在膀胱(UCB)。由于UTUC是比较罕见的,对于UTUC患者的临床决策是根据UCB的治疗数据来推断的。在最近对116UCB患者的研究中,作者报告了三种基于蛋白质组的亚型(U-I, U-IIU-III),它们具有不同的临床结果和分子特征。然而,UTUC的分子发病机制尚不清楚,也没有有用的生物标志物可用于准确的诊断和分类。

怀疑患有UTUC的患者需要接受侵入性手术,如计算机断层尿路造影、逆行肾盂造影或输尿管镜检查以明确诊断。然而,这些工具很难检测到疾病的早期进展。尿细胞学是一种检测UC的非侵入性方法,但也不能检测大多数UTUC。血浆样本很容易获得,它们提供了癌症状态的指示,包括各种细胞成分,如蛋白质。然而,关于UTUC中基于血浆的蛋白质生物标志物的可用数据有限。

大约55%-59%UTUC病例在诊断时是肌肉侵袭性的,而UCBs只有15%。肌肉侵袭性UTUC患者(MI-UTUCs)通常预后很差,pT2/pT3期和pT4期的5年特异性生存率分别<50%<10%。高达30%MI-UTUCs在区域淋巴结有转移,这是一个公认的不良预后因素。一个主要的问题是很难确定患者是否患有肌肉侵袭性疾病或更严重的疾病,因为影像学检查、细胞学检查或活检结果不能可靠地诊断疾病的分期,也不能在手术前确定患者是否有淋巴结侵袭。因此,发现用于识别MI-UTUCUTUC淋巴结受累的可靠血浆生物标志物对于改善临床管理和患者预后至关重要。

机理模式图(图源自Cell Reports Medicine

血浆蛋白是血浆的主要功能成分,在各种生物过程中发挥关键作用,包括信号传导、转运和抵抗感染近年来,血浆蛋白质组学技术已广泛应用于前列腺癌、新型冠状病毒病(COVID-19)、酒精相关性肝病等多种疾病的研究。因此,基于血浆的蛋白质组学的发展为临床转化和应用提供了巨大的可能性。

总之,该研究捕捉到了UTUC患者血浆蛋白质组的变化,这些变化与潜在疾病的病理特征和临床表现有关。证明了血浆蛋白质组分析能够发现与疾病相关的分子特征,这可能对疾病管理的重要方面产生重大影响:(1)诊断分类器可能有助于诊断UTUC(2)潜在预测模型可以区分MIUTUCsNMI-UTUCs(3)进展时钟可以提供有关疾病进展的信息。总的来说,该研究描绘了UTUC队列的血浆蛋白质组学景观,并为进一步的UTUC生物学和诊断研究提供了宝贵的资源。

原文链接:

https://doi.org/10.1016/j.xcrm.2023.101166

转自:iNature”微信公众号

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