以下文章来源于医工结合科研路 ,作者Cherish老师
孟德尔随机化
文献速读
01
心情不稳定与自身免疫性疾病之间的
因果关系:孟德尔随机化分析
Autoimmun Rev. 2023 Jan;22(1):103214.doi: 10.1016/j.autrev.2022.103214. Epub 2022 Oct 20.
目的
近年来,心理健康和自身免疫之间的相互关系得到了越来越多的关注。然而,人格特征与自身免疫性疾病之间的因果关系在很大程度上仍然是未知的。
方法
我们首先对普通人群中常见的人格特征--情绪不稳定与10种自身免疫性疾病之间的关系进行了双样本孟德尔随机化(MR)分析。在不同的MR方法、种族、性别和确认方法进行比较的敏感性二级分析中,结果得到了进一步验证。
结果
在一级分析中,三种自身免疫性疾病显示出情绪不稳定的遗传倾向:哮喘(OR[95%CI]=3.45[2.48,4.78],P=1.33E- 13)、甲状腺功能减退症(OR[95%CI]=1.02[1.00,1.03],P=1.71E-02)和系统性红斑狼疮(OR[95%CI]=5.25[1.21,22.76],P=2.67E-02)。这些结果在随后的二级分析中是一致的。通过不同的MR方法,三种疾病与情绪不稳定仍有明显的相关性,其中哮喘在芬兰和混合人群以及英国生物库的女性中仍有意义,而甲状腺功能减退症在英国生物库的两种性别中仍有意义。
结论
情绪不稳定是三种自身免疫性疾病(包括哮喘、甲状腺功能减退和系统性红斑狼疮)的可改变的风险因素。
关键词
自身免疫力;GWAS;相互作用;孟德尔随机化;可改变的危险因素;情绪不稳定。
02
吸烟、饮酒和24种胃肠道疾病:
孟德尔随机化分析
Elife. 2023 Feb 2;12:e84051. doi:10.7554/eLife.84051.
背景
吸烟和饮酒与胃肠道疾病的正相关关系是否是因果关系还不确定。我们进行了这项孟德尔随机化研究(MR),以全面检查吸烟和饮酒与常见胃肠道疾病的关系。
方法
在全基因组显著性水平上选择与吸烟和饮酒相关的遗传变异作为工具变量。与24种胃肠道疾病的遗传关系来自英国生物库、FinnGen研究和其他大型联合体。在对吸烟和饮酒的遗传责任进行相互调整后,进行了单变量和多变量的MR分析,以估计总体和独立的MR关联。
结果
开始吸烟的遗传倾向与24种胃肠道疾病中的20种风险增加有关,包括7种上消化道疾病(胃食管反流、食管癌、胃溃疡、十二指肠溃疡、急性胃炎、慢性胃炎和胃癌)、 4种下消化道疾病(肠易激综合征、憩室病、克罗恩病和溃疡性结肠炎),8种肝胆和胰腺疾病(非酒精性脂肪肝、酒精性肝病、肝硬化、肝癌、胆囊炎、胆石症、急慢性胰腺炎),以及急性阑尾炎。在调整了遗传预测的酒精消费后,20个关联中的15个持续存在。遗传预测的较高酒精消费与十二指肠溃疡、酒精性肝病、肝硬化和慢性胰腺炎的风险增加有关;然而,在调整了开始吸烟的遗传倾向后,十二指肠溃疡的关联在统计上并不显著。
结论
这项研究提供了MR证据,支持吸烟与广泛的胃肠道疾病的因果关系,而饮酒只与少数胃肠道疾病有关。
资助
浙江省杰出青年学者自然科学基金;国家自然科学基金;湖南省研究与发展计划重点项目;瑞典心肺基金会;瑞典研究理事会;瑞典癌症协会。
关键词
孟德尔随机化;饮酒;流行病学;胃肠道疾病;遗传学;基因组学;全球健康;吸烟。
03
肠道微生物群与癌症之间的因果关系:
一项双样本孟德尔随机化研究
BMC Med.2023 Feb 21;21(1):66. doi: 10.1186/s12916-023-02761-6.
背景
来自观察性研究和临床试验的证据表明,肠道微生物群与癌症有关。然而,肠道微生物群和癌症之间的因果关系仍有待确定。
方法
我们首先根据系统、类、目、科和属的信息确定了两组肠道微生物群,癌症数据来自IEU Open GWAS项目。然后我们进行了双样本孟德尔随机化(MR),以确定肠道微生物群是否与八种癌症类型有因果关系。此外,我们还进行了双向的MR分析,以检查因果关系的方向。
结果
我们确定了肠道微生物组的遗传责任与癌症之间的11种因果关系,包括涉及双歧杆菌属的关系。我们发现肠道微生物组中的遗传责任与癌症之间有17个强关联。此外,我们使用多个数据集发现了肠道微生物组中的遗传责任与癌症之间的24个关联。
结论
我们的MR分析显示,肠道微生物群与癌症有因果关系,可能有助于为微生物群介导的癌症的进一步机制和临床研究提供新的见解。
关键词
癌症;遗传学;肠道微生物群;孟德尔随机化;SNPs
04
血清25-羟基维生素D与
非酒精性脂肪肝的逆向关系
Clin Gastroenterol Hepatol.2023Feb;21(2):398-405.e4.doi:10.1016/j.cgh.2022.01.021. Epub 2022 Jan 31.
背景和目的
在许多观察性研究中,血清25-羟维生素D[S-25(OH)D]和非酒精性脂肪肝(NAFLD)是相关的,而这种关联的因果关系是不确定的,特别是在欧洲人群中。我们进行了一项双向孟德尔随机化研究,以确定S-25(OH)D和非酒精性脂肪肝之间的关联。
方法
我们选择了7个和6个与S-25(OH)D和非酒精性脂肪肝相关的独立遗传变体作为工具变量。S-25(OH)D的汇总级数据来自于维生素D和高度相关性状的基本遗传决定因素研究联盟,包括79,366人。非酒精性脂肪肝的汇总级数据来自全基因组关联荟萃分析(1483例和17781例对照)、FinnGen联盟(894例和217898例对照)和英国生物库研究(275例和360919例对照)。从英国生物银行获得了4种肝酶的汇总数据。
结果
S-25(OH)D与非酒精性脂肪肝和某些肝酶存在遗传相关性。在3个来源中,遗传预测的较高的S-25(OH)D水平与非酒精性脂肪肝风险的降低一致相关。遗传预测的S-25(OH)D水平增加1个SD,非酒精性脂肪肝的综合几率为0.78(95%置信区间[CI],0.69至0.89)。遗传预测的较高的S-25(OH)D水平与天门冬氨酸氨基转移酶水平显示出边缘性的关联(变化-1.17;95%CI,-1.36至0.01)。非酒精性脂肪肝的遗传倾向与S-25(OH)D没有关系(变化0.13;95%CI,-1.26至0.53)。
结论
我们的研究结果具有临床意义,因为它们表明,在欧洲人群中,增加维生素D水平可能在预防非酒精性脂肪肝方面发挥作用。
关键词
肝酶;孟德尔随机化;非酒精性肝病;维生素D
05
教育、智力和认知与高血压的独立关系
及心脏代谢危险因素的中介作用:
孟德尔随机化研究
Hypertension.2023 Jan;80(1):192-203.doi:10.1161/HYPERTENSIONAHA.122.20286. Epub 2022 Nov 10.
背景
教育、智力和认知与高血压有关,但哪一个在高血压的发病机制中起着最突出的作用,哪些可改变的风险因素介导了因果关系,仍然是未知的。
方法
利用主要是欧洲血统的全基因组关联研究的汇总统计,我们进行了2个样本的多变量孟德尔随机化,以估计教育、智力或认知对高血压(FinnGen研究,70 651例/223 663例对照;英国生物银行,77 723例/330 366例对照)和血压(国际血压联盟,757 601名参与者)的独立影响,并使用2步孟德尔随机化来评估关联的25个潜在调解因素,计算出调解比例。
结果
对FinnGen和UK Biobank的反方差加权孟德尔随机化结果的Meta分析显示,遗传预测的1-SD(4.2年)高等教育与44%(95%CI:0.40-0.79)的高血压风险降低有关,收缩压降低1.682mmHg,舒张压降低0.898mmHg,与智力和认知无关。虽然智力和认知对高血压的因果效应并不独立于教育;在25个心脏代谢风险因素中,有6个被确定为教育和高血压之间关系的中介因素,按中介比例排列,包括身体质量指数(中介比例:30.1%)、腰臀比(22.8%)、体脂率(14.1%)、严重抑郁症(7.0%)、高密度脂蛋白胆固醇(4.7%)和甘油三酯(3.4%)。这些结果对敏感性分析是稳健的。
结论
我们的研究结果说明了教育对高血压和血压的因果关系和独立影响,并概述了心脏代谢介质作为预防因教育程度低而导致的高血压的优先目标。
关键词
孟德尔随机化;心脏代谢风险因素;认知;教育;高血压;智力
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