WB实验作为分子生物学中最为常见的实验,却蕴含了很多技巧与知识,那要怎样才能做出漂亮的WB检测结果呢?
接下来小编将从蛋白样本制备、凝胶配制、电泳、转膜、封闭、抗体杂交等方面详细讲解wb检测过程中常见容易忽略的操作错误与注意事项,新手必看。
WB实验注意事项
01
蛋白样本制备
1. 蛋白质的样品制备注意以下问题:
(1)在合适的条件下,保持蛋白质的最大溶解性和可重复性。
(2)选择合适的表面活性剂和还原剂,使其形成各自多肽的溶液。
(3)尽量去除核酸,多糖,脂类等分子的干扰,裂解完毕离心之后取中层澄清溶液时避免吸到底层沉淀和上层脂类。
(4)整个制作蛋白样本的制备过程必须在低温下进行,避免细胞破碎释放出各种酶类,但是注意不要反复冻融。
(5)所抽取样品的蛋白含量,蛋白变性是否充分等等,还有,蛋白样品的pH值是否在7~8之间。这会直接影响到样品浓缩的效果。此外,蛋白样品是否降解、目的蛋白是否已抽取充分都会对最终结果的可靠性有影响。
2. 细胞水平要做WB,多少细胞提的蛋白够做WB?
一般5×106就足够。
3. 小分子量蛋白10KD需要的注意点
1)可选择孔径0.22μm的PVDF膜或者NC膜,转膜时间缩短,另外可采用Tricine-SDS-PAGE体系;
2)也可以选择PSQ膜,同时缩短转移时间。也可以将两张膜叠在一起,再转移,其他按步骤即可。
4. 大分子量蛋白200KD需要的注意点:
(1)做200kd蛋白的WB时要注意,分离胶最好选择>7%的;剥胶时要小心;
(2)转移时间需要相应延长;要做分子量参照(否则出现杂带不知道如何分析);
(3)转膜液中甲醇含量可适当降低,推荐使用湿装转膜效率更高。
02
凝胶的配制
制胶关键是聚合时间,分离胶聚合控制在从加入10%AP和TEMED至开始凝胶,时间为10—20分钟(未完全凝聚),浓缩胶最佳聚合时间为8-10min,可通过控制AP和TEMED量来控制。
1. 凝胶质量
不连续SDS-PAGE胶对凝胶的要求较高,分离胶的pH值应在8.8左右,而浓缩胶的pH应在6.8左右,最好不要差过0.5个pH单位,因为这个pH条件是保证电泳液中的甘氨酸不电离的必要条件,也是保证能充分压缩样品的前提。
因此,制备凝胶的时候所用Tris-HCl缓冲液的pH值是否稳定是很重要的。
2. 在用ddH2O压分离胶的时候为什么经常存在中间凸的现象?
(1)加水时不能对着胶冲,要沿着玻璃板缓慢流行;
(2)加水满后一定要保证上方水平面是平齐的;
(3)加胶要避免气泡,也要避免加胶太慢而提前凝固等现象;
(4)有其他人的经验是用异丙醇封胶封胶后左右晃一下。
03
加样
1. 点样
样品尽量不要与电泳液混合,这样能提高浓缩的效果,因为电泳液pH值为8.3,而样品为7.5,混合后会影响到样品的pH值,进而影响浓缩效果。
因此,建议点样最好用长枪头,或者加样器,轻轻的将样品加到孔的底部。
2. 如果上样量超载,要用什么方法来增加上样量
可以浓缩样品,也可以根据目标分子量透析掉一部分小分子蛋白。一般地,超载30%是不会有问题的。如果已经超了不少了,而且小分子量的也要,可以考虑加大胶的厚度,可以试试1.5mm的。
04
电泳
(1)应待凝胶充分凝固后电泳,或者催化剂加入后充分混匀,否则条带容易中间凹陷两边翘起。
(2)两板玻璃之间排除所有的气泡,防止条带中间鼓两边下陷。
(3)加样前离心,选择适当的样本缓冲液(尽量用新鲜配制的,这样能保证pH值和离子强度的稳定),加适量的样品促溶剂,防止wb条带拖尾或蛋白出现纹理。
(4)常用浓缩时80V,分离时100V比较好,条带很平。
05
转膜
膜的选择主要从实验目的和实验要求来考虑:
(1)要使western blot蛋白质组分能有效的从凝胶转移到固相纸膜上,缓冲液的pH值很重要。分子量不是很大的蛋白质区带要适当改变转移缓冲液的pH,而分子量较小的蛋白质,可以在缓冲液中加入适量甲醇促进它们固定在固相膜上(大分子量的蛋白质不适合加甲醇)。
(2)电转印膜常用的NC膜使用的最为普谝,它的蛋白质容量大,可用各种染色方法进行检测,但是它与蛋白质的结合是非价性的,膜干燥后很脆。操作过程中要注意。
(3)如果所分离的蛋白需要进行测序,则非PVDF膜不可,因为只有PVDF膜才能经受住严酷的清洗条件。
06
封闭
(1)蛋白质免疫印迹电泳转膜过后,为防止与一抗或二抗非特异性结合,膜上其他没有结合蛋白质的空白位置需要用封闭液加以封闭。
(2)封闭液中加入适量的防腐剂,避免封闭蛋白变性影响封闭效果。
封闭液的选用要求:
(1)常用封闭液为脱脂牛奶(GBCBIO-232100)、牛血清白蛋白(BSA GBCBIO-0332)、无蛋白封闭液(GBCBIO-G7205)等
(2) 封闭时间:室温1-2h、4度过夜或37度半小时
(3) 封闭液pH:一般5%脱脂牛奶pH大约为6.0-6.5左右,而1%脱脂牛奶可能6.5-7
注:5%脱脂牛奶封闭效果最佳,但有时也可能封闭过度,可以与BSA或无蛋白封闭液轮流更换。
07
抗体
(1)适当降低抗体的浓度,增加洗膜次数防止非特异性条带过多;
(2)优化转移时间和电流,增加抗体的浓度,适当延长曝光时间,防止信号弱、可能转膜不完全;
(3)一抗尽量选择小鼠或者兔来源的单克隆抗体,还有要注意所用的抗体是否能够识别变性条件下的目标蛋白;
(4)二抗一般都是效价很高的,只要室温下杂交1小时就可以了,适当延长也是可以的。另外,要选择灵敏度较高的化学反应底物。
2. WB中抗体的可以重复应用吗
抗体工作溶液一般不主张储存反复使用,但是如抗体比较珍贵,可反复使用2-3次。稀释后应在2-3天内使用,4度保存,避免反复冻融。
转自:“晶莱生物”微信公众号
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