复旦大学合作最新Nature
2023/8/18 10:03:06 阅读:42 发布者:
转录的适当调控对于维持基因组完整性和执行其他下游细胞功能至关重要。
2023年8月9日,复旦大学复旦大学Fei Xavier Chen及浙江大学陆华松共同通讯在Nature 在线发表题为“R-loop dependent promoter-proximal termination ensures genome stability”的研究论文,该研究确定了SOSS-INTAC是基因组稳定性调节剂ssDNA传感器(SOSS)和转录调节剂Integrator-PP2A (INTAC)的稳定结合。
通过SSB1介导的ssDNA识别,SOSS-INTAC刺激启动子-近端终止转录,并减弱暂停的Pol II相关R环,以防止R环诱导的基因组不稳定。SSB1形成液体状凝析物的能力增强了依赖于SOSS-INTAC的R环衰减。在其内在无序区(IDR)中删除或引入癌症相关突变,导致R环的普遍积累,突出了SOSS-INTAC的基因组监测功能,该功能能够及时终止启动子处的转录,以限制R环的积累,以确保基因组的稳定性。
在转录过程中,脱离Pol II延伸复合体的新生RNA可以侵入双链DNA,并与模板链重新杂交,形成RNA-DNA双链,即R环。R环在含有高水平暂停Pol II的活性启动子上富集,由于暴露的ssDNA编码链易受诱变剂和核酸酶的影响,R环会导致复制应激和基因组不稳定,同时也会阻止复制叉的进展。R环也可以在转录、DNA修复和免疫应答中发挥有益的调节作用。此外,R环的动态控制有助于细胞分化和重编程过程中转录程序开关的动力学。
通过液-液相分离(LLPS)形成的生物分子凝聚物在多种细胞过程中具有重要功能,包括转录调控、信号转导和DNA损伤反应。这些无膜结构通常富含含有重复模块结构域或长段内在无序区域(IDRs)的蛋白质。例如,一些R环调控因子的相分离行为已被报道与其IDR相关。
该研究发现转录调节剂Integrator-PP2A (INTAC)通过与ssDNA结合复合体SOSS结合形成SOSS-INTAC来调节R-loop水平。SOSS-INTAC亚基SSB1通过ssDNA识别和液体状凝析物形成能力,将SOSS-INTAC定位在启动子上,并催化转录终止,以防止异常的R环积累,确保基因组的稳定性。
参考消息:
https://www.nature.com/articles/s41586-023-06515-5
转自:“iNature”微信公众号
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