以下文章来源于医工结合科研路 ,作者Cherish老师
孟德尔随机化文献速读
调查银屑病的可调节途径:
孟德尔随机化研究
(医学1区 IF:15.49)
J Am Acad Dermatol. 2023 Mar;88(3):593-601. doi:10.1016/j.jaad.2022.11.010. Epub 2022 Nov 9.
背景
潜在的可改变的风险因素以前只在传统的观察性研究中被调查过。
目的
评估遗传预测的可改变因素的暴露是否与银屑病的风险有关。
方法
双样本孟德尔随机化(MR)分析。
结果
遗传预测的终生吸烟指数(几率[OR]MR-IVW=2.11;95%置信区间[CI],1.28-3.51)、童年(OR MR-IVW=1. 40;95% CI,1.14-1.71)和成人身体质量指数(OR MR-IVW = 1.63;95% CI,1.32-2)、腰围(OR IVW = 1.86;95% CI,1.31-2.64)和臀围(OR MR-IVW = 1.55;95% CI,1.15-2.07)。遗传预测的较长睡眠时间(OR MR-IVW = 0.56;95% CI 0.37-0.84)和受教育年限的增加(OR MR-IVW = 0.78;95% CI,0.62-0.98)之间也有保护性联系。在调整了吸烟和成人体重指数的遗传预测因素后,教育的这种影响在多变量MR中仍然存在(ORMVMR-IVW = 0.72;95% CI,0.56-0.92)。
局限性
不可能对银屑病的严重程度进行分层。
结论
戒烟和预防肥胖是降低银屑病发病率的重要策略。同样,针对教育不平等问题,预计将进一步导致银屑病病例的减少。
关键词
孟德尔随机化;流行病学;遗传学;可改变的因素;银屑病;风险。
炎症性肠病的治疗目标:全蛋白质组的孟德尔随机化和共聚焦分析
(医学1区 IF:11.21)
EBioMedicine.2023 Mar;89:104494. doi: 10.1016/j.ebiom.2023.104494. Epub 2023 Feb 27.
背景
识别炎症性肠病(IBD)的新药物靶点是迫切需要的。蛋白质组是治疗目标的一个主要来源。我们进行了全蛋白质组的孟德尔随机化(MR)和共聚焦分析,以确定IBD的可能靶点。
方法
从包括35,559人的大规模蛋白质定量性状位点研究中提取了4907个循环蛋白水平的汇总级数据。与IBD及其亚型的遗传关联来自炎症性肠病遗传学联盟(25,024例和34,915例对照)、FinnGen研究(7206例和253,199例对照)和英国生物库研究(7045例和449,282例对照)。进行MR分析以估计蛋白质和IBD风险之间的关联。协同分析被用来检查已确定的蛋白质和IBD是否共享休闲变体。
研究结果
3种和5种循环蛋白的基因预测水平分别与IBD和溃疡性结肠炎(UC)有关。具有高度支持性的协同证据,基因预测的MST1(巨噬细胞刺激1)和HGFAC(肝细胞生长因子激活剂)水平与IBD风险成反比。STAT3(信号转导者和转录激活者3)、MST1、CXCL5(C-X-C图案趋化因子配体5)和ITPKA(肌醇-三磷酸酯3-激酶A)与UC风险的关联得到了结点分析的支持。
解释
全蛋白质组的MR调查确定了许多与IBD风险相关的蛋白质。MST1、HGFAC、STAT3、ITPKA和CXCL5作为IBD的潜在治疗目标值得进一步研究。
关键词
炎症性肠病;孟德尔随机化;蛋白质;治疗目标。
多不饱和脂肪酸与肾脏功能之间的因果关系:一个双向的孟德尔随机化研究
(医学1区 IF:8.47)
Am J Clin Nutr. 2023 Jan;117(1):199-206. doi:10.1016/j.ajcnut.2022.11.010. Epub 2022 Dec 19.
背景
在观察性研究中,PUFAs被认为对肾脏功能有益。然而,这些关联是否是因果关系仍不清楚。
目标
本研究采用双向2样本孟德尔随机法(MR)探讨了PUFAs与慢性肾脏疾病(CKD)或估计肾小球滤过率(eGFR)之间的因果关系。
方法
与PUFAs和肾功能相关的单核苷酸多态性来自最大和最新的全基因组关联研究,样本量为:ω-3脂肪酸、ω-6脂肪酸、DHA、LA和其他大于18:2的PUFAs(otPUFA)分别为13,544、13,506、13,499、13,527和13,549;CKD和eGFR分别为480,698 和1,201,909。采用MR反方差加权(IVW)和褶皱残差和离群点检验(MR-PRESSO)进行数据分析,并辅以加权中位数估计法、MR-Egger回归和多变量MR,给出β或OR及其95%CIs。
结果
有暗示性的证据表明,使用MR-PRESSO,较高的ω-6脂肪酸与eGFR的增加有关[β:ω-6脂肪酸每增加一个SD值,就会增加0.005 log(mL/min/1.73 m2);95% CI:0.002, 0.008;P = 0.008]。较高的LA水平也与较高的eGFR有关[β:使用MR-PRESSO,LA每增加一个SD,就有0.005 log(mL/min/1.73 m2);95% CI:0.003, 0.007;P = 0.0007]。既没有发现其他PUFAs,即omega-3脂肪酸、DHA和otPUFA,与CKD或eGFR的关联,也没有发现CKD和eGFR与PUFAs的关联。在敏感性分析中也发现类似的结果。
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结论
我们的结果表明,较高的omega-6脂肪酸和LA可能增加eGFR水平。虽然估计的效果相对较小,但结果提供了公共卫生和研究的意义,表明需要进一步对ω-6脂肪酸改善肾功能进行纵向队列或随机对照试验。
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关键词
孟德尔随机化;慢性肾脏病;估计肾小球滤过率;欧米伽3;欧米伽6;多不饱和脂肪酸。
成纤维细胞生长因子-23与心血管疾病的风险:孟德尔随机化研究
(医学1区 IF:10.61)
2023 Jan 1;18(1):17-27. doi: 10.2215/CJN.05080422.
背景
在传统的流行病学研究中,成纤维细胞生长因子-23(FGF-23)与一系列心血管和非心血管疾病有关,但可能存在大量的残余混杂因素。孟德尔随机化方法可以帮助控制这种混杂因素。
方法
SCALLOP联盟19195名参与者的数据被用来生成FGF-23基因评分。来自337,448名英国生物库参与者的数据被用来估计较高的遗传预测FGF-23浓度与任何动脉粥样硬化性心血管疾病(n=26,266事件)、非动脉粥样硬化性心血管疾病(n=12,652)以及先前与FGF-23相关的非心血管疾病之间的关联。颈动脉内膜厚度和左心室质量的测量在一个子集中可用。在三个大型病例对照组中也测试了与心血管结果的关系:CARDIOGRAMplusC4D(冠状动脉疾病,n=181 249例)、MEGASTROKE(中风,n=34 217)和HERMES(心衰,n=47 309)。
结果
我们确定了34个循环FGF-23的独立变异,形成了一个有效的遗传评分。遗传预测的FGF-23与任何心血管或非心血管的结果之间没有关联。在英国生物库中,任何动脉粥样硬化性心血管疾病的概率(OR)为1.03(95%置信区间[95% CI],0.98至1.08),而任何非动脉粥样硬化性心血管疾病的概率为1.01(95% CI,0.94至1.09)。在病例对照组中,冠状动脉疾病的ORs为1.00(95% CI,0.97至1.03),中风的ORs为1.01(95% CI,0.95至1.07),心力衰竭的ORs为1.00(95% CI,0.95至1.05)。在有影像学检查的人中,logFGF-23与颈动脉或心脏的异常没有关系。
结论
遗传预测的FGF-23水平与动脉粥样硬化性和非动脉粥样硬化性心血管疾病没有关系,表明没有重要的因果关系。
遗传代用CRP(C-反应蛋白)水平
与脑叶内出血风险
(医学1区 IF:10.17)
Stroke. 2023 Apr;54(4):e130-e132. doi: 10.1161/STROKEAHA.122.041889. Epub 2023 Mar 9.
背景
最近有证据表明,较高的CRP(C反应蛋白)水平与较低的阿尔茨海默病风险有关,推测CRP可能参与了Aβ清除机制。为验证这一假设,我们探讨了遗传代理的CRP水平是否也与脑叶内出血(ICH)有关,该病通常由脑淀粉样血管病变引起。
方法
我们使用了CRP基因中的4个遗传变异,这些变异解释了循环CRP水平64%的变异,并在2个样本的孟德尔随机化分析中探讨了与任何、大叶和深部ICH风险的关系(1545例和1481例对照)。
结果
较高的基因代理CRP水平与较低的大叶ICH几率有关(CRP每SD增量的几率比为0.45[95%CI,0.25-0.73]),但与深部ICH无关(几率比为0.72[95%CI,0.45-1.14])。在CRP和大叶ICH的信号中,有证据表明存在同源性(关联的后验概率,72.4%)。
结论
我们的结果提供了支持性的证据,即高CRP水平可能对淀粉样蛋白相关的病理有保护作用。
关键词
阿尔茨海默病;C反应蛋白;淀粉样蛋白;脑淀粉样血管病;脑出血。
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