以下文章来源于医工结合科研路 ,作者Cherish老师
孟德尔随机化
文献速读
胸部主动脉直径与血压的关系:
孟德尔随机化研究
(医学1区 IF:10.51)
Arterioscler Thromb Vasc Biol.2023 Feb;43(2):359-366. doi: 10.1161/ATVBAHA.122.318149. Epub 2023 Jan 5.
背景
观察性研究发现,血压(BP)升高是胸主动脉扩张的一个强有力的风险因素,降低血压是推荐用于防止主动脉瘤进展的主要医疗干预措施。然而,尽管血压可能影响主动脉扩张,但主动脉大小也可能影响血压。血压和胸主动脉大小之间的因果关系还没有可靠地确定。
方法
获得BP和升主动脉直径(AscAoD)的全基因组关联研究汇总统计。使用2个样本的孟德尔随机化方法估计了BP对AscAoD的因果效应,并使用了一系列的多效性方法。
结果
遗传预测的收缩压、舒张压和平均动脉压的增加都与较高的AscAoD显著相关(收缩压:β估计值,0.0041 mm/mm Hg [95% CI, 0. 0008-0.0074];P=0.02,舒张压:β估计值,0.0272毫米/毫米汞柱[95% CI,0.0224-0.0320];P<0.001,平均动脉压:β估计值,0.0168毫米/毫米汞柱[95% CI,0.0130-0.0206];P<0.001)。同时,遗传预测的脉压与AscAoD呈反向关系(β估计值,-0.0155毫米/毫米汞柱[95%CI,-0.0213至-0.0096];P<0.001)。多变量孟德尔随机化分析显示,基因预测的平均动脉压升高和脉压降低与AscAoD独立相关。双向孟德尔随机化显示,遗传预测的AscAoD与脉压(β估计值,-2.0721毫米汞柱/毫米[95%CI,-3.1137至-1.0306];P<0。001)和收缩压(β估计值,-1.2878 mm Hg/mm [95% CI, -2.3533 to -0.2224]; P=0.02),而与舒张压直接相关(0.8203 mm Hg/mm [95% CI, 0.2735-1.3672]; P=0.004)。
结论
血压可能对升胸主动脉扩张有因果关系。AscAoD的增加可能有助于降低收缩压和脉压,但不是舒张压,这与主动脉直径缩小的血流动力学后果一致。
关键词
孟德尔随机化;分析;动脉瘤;主动脉;血压;基因组学。
全表型孟德尔随机化分析确定了
老年性黄斑变性的因果因素
(医学1区 IF:8.71)
Elife. 2023 Jan 27;12:e82546. doi: 10.7554/eLife.82546.
背景
老年性黄斑变性(AMD)是工业化国家失明的主要原因,预计到2040年全球将有超过2.8亿人受到影响。为了确定这一常见病症的致病因素和潜在的治疗目标,我们设计并进行了一项全表型孟德尔随机化(MR)研究。
方法
我们使用单变量MR评估了4591个暴露特征对早期AMD的影响。对具有统计学意义的结果进行了进一步探讨:在晚期AMD队列中进行验证;MR贝叶斯模型平均化(MR-BMA);以及多变量MR。
结果
总的来说,在单变量分析中发现有44个性状被认为与早期AMD有因果关系。发现与AMD有明显关系的血清蛋白包括S100-A5(几率[OR]=1.07,P值=6.80E-06),猫蛋白酶F(OR=1.10,P值=7.16E-05),以及丝氨酸棕榈酰转移酶2(OR=0.86,P值=1.00E-03)。单变量MR分析也支持补体和免疫细胞性状的作用。尽管发现许多脂质性状与AMD明显相关,但MR-BMA建议血清鞘磷脂具有驱动性因果作用(边际纳入概率[MIP]=0.76;模型平均因果估计[MACE]=0.29)。
结论
这项MR研究的结果支持AMD的几个推定因果因素,并强调了未来转化研究的途径。
关键词
AMD;孟德尔随机化;孟德尔随机化;年龄相关性黄斑变性;因果推断;人类;黄斑变性;医学;统计学。
特发性肺纤维化合并症的因果图谱:
一个双向的孟德尔随机化研究
(医学1区 IF:10.26)
Chest. 2023 Mar 2:S0012-3692(23)00308-2. doi:10.1016/j.chest.2023.02.038. Epub ahead of print.
背景
特发性肺纤维化(IPF)是一种致命的肺部疾病,具有很高的肺部和肺部以外的合并症负担。
研究问题
这些合并症与IPF是否有因果关系?
研究设计和方法
我们搜索了PubMed,以确定可能的IPF相关合并症。使用迄今为止最大的全基因组关联研究的汇总统计数据,在双样本环境下对这些疾病进行了双向孟德尔随机化(MR)研究。在不同的模型假设、IPF的复制数据集和次级表型下,使用多种MR方法验证了研究结果。
结果
共包括22种有遗传数据的合并症。双向MR分析显示,有两个合并症有令人信服的证据,四个合并症有提示性的证据。胃食管反流病、VTE和甲状腺功能减退症与IPF的风险增加有因果关系,而COPD与IPF的风险减少有因果关系。对于相反的方向,IPF显示与较高的肺癌风险有因果关系,但高血压的风险降低。对肺功能参数和血压测量的后续分析支持COPD对IPF的因果效应和IPF对高血压的因果效应。
解释
本研究从遗传学角度提出了IPF与某些合并症之间的因果关系。需要进一步研究以了解这些关联的机制。
关键词
孟德尔随机化;因果关系;合并症;特发性肺纤维化。
炎症和认知之间的关系:
使用基于人口的队列和孟德尔随机化分析的证据的三角关系
(医学1区 IF:19.23)
Brain Behav Immun. 2023 Feb 13;110:30-42. doi: 10.1016/j.bbi.2023.02.010. Epub ahead of print.
背景
炎症与老年人的认知功能和痴呆有关,但炎症是否与年轻人的认知功能有关,以及这些关联是否是因果关系仍不清楚。
方法
在一个基于人口的队列(Avon Longitudinal Study of Parents and Children; ALSPAC)中,我们调查了炎症标志物(C-反应蛋白[CRP]、白细胞介素-6[IL-6]和糖蛋白acetyls[GlycA])与24岁时冷(工作记忆、反应抑制)和热(情绪识别)认知的交叉关联(N = 3,305的多重归因模型)。此外,我们还进行了一个样本和两个样本的双向孟德尔随机化(MR)分析,以检查基因代理的炎症标志物(CRP、GlycA、IL-6、IL-6受体、可溶性IL-6受体)对认知措施(上述)和一般认知能力的潜在因果影响。
结果
在ALSPAC队列中,在调整了潜在的混杂因素后,有有限的证据表明标准化的炎症标志物与24岁时的标准化认知指标之间存在关联(N=3,305;β范围,-0.02[95%置信区间(CI)-0.06至0.02,p=0.27]至0.02[95% CI-0.02至0.05,p=0.33])。同样,在使用ALSPAC数据的单样本MR中,我们发现有限的证据表明,遗传推测的炎症标志物增加1个单位对标准化工作记忆、情绪识别或反应抑制的潜在影响(β范围,-0.73 [95 % CI -2.47 to 1.01, p = 0.41] to 0. 21 [95% CI -1.42 to 1.84, p = 0.80];或在使用最新的全基因组关联研究(GWAS)数据集的双样本MR中,标准化的一般认知能力(反方差加权的β范围,-0.02 [95% CI -0.05 to 0.01, p = 0.12] 至 0.03 [95% CI -0.01 to 0.07, p = 0.19])。
结论
我们的MR研究结果没有提供强有力的证据证明炎症标志物(CRP、IL-6、IL-6受体、GlycA)对这里研究的认知功能有潜在的因果效应。鉴于单样本MR的置信区间较大,需要对特定的认知指标进行更大规模的GWAS研究,以使MR分析具有良好的动力,从而研究炎症是否对特定的认知领域产生因果影响。
关键词
ALSPAC;CRP;认知;情绪识别;GlycA;IL-6;炎症;孟德尔随机化;观察性;反应抑制;工作记忆。
子代血压的母体和胎儿来源:
使用遗传相关性和基于遗传风险评分的孟德尔随机化的统计分析
(医学1区 IF:9.69)
Int J Epidemiol. 2023 Mar 21:dyad034. doi: 10.1093/ije/dyad034. Epub ahead of print.
背景
流行病学研究表明,通过使用出生体重作为母体宫内暴露的代表,子宫内不良环境与后代高血压的风险增加有关;然而,这种关联的性质仍不太清楚。
方法
用母亲/胎儿特定的出生体重汇总统计(自身出生体重n=297 356,后代出生体重n=210 248)和血压的汇总统计[即 收缩压(SBP)、舒张压(DBP)和脉压(PP)](n = 757 601),我们用跨性状联系不平衡得分回归评估了胎儿特定出生体重和血压之间的遗传相关性,接下来用一种称为混合调整交叉联合多态性测试的多态性图谱方法检测了它们的多态性基因。此外,我们在英国生物库队列的父母-后代对(n = 6031)中进行了基于遗传风险评分(GRS)的孟德尔随机化分析,以评估母体特异性GRS和血压对胎儿基因型调节的因果关系。
结果
我们发现胎儿特异性出生体重与DBP(ρ^g=-0.174,P=1.68×10-10)、SBP(ρ^g=-0.198,P=8.09×10-12)和PP(ρ^g=-0.152,P=6.04×10-8)有负的遗传关系,并分别检测到胎儿特异性出生体重与PP、SBP和DBP之间共享的143、137和135个多态基因。这些基因往往表现出相反的遗传效应,在胰腺、肝脏、心脏、大脑、全血和肌肉骨骼组织中更容易出现差异表达。在考虑了胎儿特异性GRS的影响后,发现母体特异性出生体重与母子对中的SBP(P=2.20×10-2)和PP(P=7.67×10-3)有因果关系,但与DBP(P=0.396)没有关系;而且这两个显著关系对仪器的横向多态性和妊娠期及早产的混杂影响是稳健的。然而,这些因果关系在父亲与后代的配对中无法检测到。
结论
这项研究揭示了出生体重和血压的共同遗传成分,并为高血压的病因和早期预防提供了重要的见解。
关键词
血压;孟德尔随机化;出生体重;遗传风险评分;工具变量;宫内环境;母体/胎儿特定的遗传效应;多态性分析;汇总统计。
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