同期三篇Nature论文，绘制人体肠道、肾脏和母胎界面细胞图谱

对人类来说，细胞的组织方式和细胞间的相互作用决定了器官和组织的功能。HuBMAP计划旨在绘制整个人体的细胞排列方式，帮助科学家研究细胞如何工作，以及细胞间的关系如何影响个体健康。

为此，人类生物分子图谱计划（HuBMAP）合作组一直在开发能在单细胞水平上绘制组织和器官内细胞分子组成空间图谱的工具，这些组成包括RNA、蛋白质和代谢物。这类工具已被用来构建人类肠道、肾脏以及与胎盘相连组织的参考细胞图谱。

2023年7月20日，Nature 期刊同期发表了三篇论文报道了人体肠道、肾脏和母胎界面（胎盘和母体细胞共存处）的参考细胞图谱。

斯坦福大学医学院的 Michael Snyder 团队等在 Nature 期刊发表了题为：Organization of the human intestine at single-cell resolution 的研究论文，对人体肠道进行了研究。

人体肠道这个复杂的器官有许多不同的结构和功能（从消化到支持免疫系统）。研究团队分析了9个人的8个肠道部位，揭示了不同位置肠道组成的巨大差异。该研究发现了新的上皮细胞亚型，还发现了不同细胞类型会形成“社区”，有些“社区”能特异性地调节免疫应答。研究结果揭示了能促进肠道发挥功能的复杂、差异化的细胞组成。

圣路易斯华盛顿大学的 Sanjay Jain 团队等在 Nature 期刊发表了题为：An atlas of healthy and injured cell states and niches in the human kidney 的研究论文，对人体肾脏进行了研究。

该研究分析了45个健康的和48个生病的人体肾脏。这些器官的损伤会触发肾细胞变化，最终影响肾脏功能。研究团队绘制了肾脏不同区域的51种主要细胞类型的单细胞和空间图谱。他们还发现了会在急性或慢性损伤下改变的细胞状态和肾脏免疫细胞、基质细胞和上皮细胞“社区”，包括与修复途径是否成功或存在缺陷有关的状态。

斯坦福大学的 Michael Angelo 团队等在 Nature 期刊发表了题为：A spatially resolved timeline of the human maternal–fetal interface 的研究论文，对人类母胎界面进行了研究。

该研究构建了妊娠前半期的人体胎盘图谱。研究团队分析了来自66例人体母胎界面（母体和胎盘细胞共同为胎儿提供生命支持的位置）样本的约50万个细胞和588个动脉。具体而言，他们研究了胎盘和子宫之间的界面，这里的母体动脉会发生改变，从而给胎儿供血。这些图谱覆盖了不同的发育阶段（妊娠6-20周），识别了胎盘和免疫细胞之间的相互作用；后一项发现阐明了母体免疫细胞如何支持母体和胎儿完全不同的细胞的共存。

这三个HuBMAP图谱，通过定义与疾病相关的细胞状态的空间位置，有望推动我们对疾病的理解。预计将来还会有来自其他组织的更多图谱，但我们仍需检验更多样本来“建立细胞组织和功能在健康和疾病中的可靠关联”。

除了上述3篇 Nature 论文外，人类生物分子图谱计划（HuBMAP）还在 Nature 子刊 Nature Methods、Nature Communications 上发表了一系列论文。

这些工作揭示了各类型细胞排列以及它们与人体不同组织和器官相互作用的新信息，是研究人体生物学和疾病的宝贵资源。

论文链接：

1. https://www.nature.com/articles/s41586-023-05915-x

2. https://www.nature.com/articles/s41586-023-05769-3

3. https://www.nature.com/articles/s41586-023-06298-9

转自：“生物世界”微信公众号

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