PBJ | 中国农科院油料所揭示芝麻基因组结构变异和株型调控机制

近日，中国农业科学院油料作物研究所芝麻与特色油料遗传育种创新团队在芝麻株型和产量性状解析方面取得较大进展，其在成功构建5个高质量的染色体水平的芝麻参考基因组的基础上，从全基因组水平鉴定了芝麻自然群体结构变异，发现了调控芝麻株型和产量性状的候选基因，初步揭示了芝麻株型和产量相关性状变异的分子基础。该项研究成果发表在国际知名学术刊物《植物生物技术（Plant Biotechnology Journal）》上。

该研究通过整合二代、三代测序数据，实现了五个代表性芝麻品种基因组的De novo组装，为芝麻研究提供了5个高质量的参考基因组，结合214份芝麻种质的自然群体重测序分析，发现了与芝麻株型和产量性状相关的结构变异。SiCEN2和SiACS9被推断为调控芝麻分枝和每叶腋蒴果数的多效性候选功能基因，SiCEN2中465 bp长末端重复序列（LTR）的插入导致的等位变异与芝麻单杆株型和每叶腋3蒴果的表型形成的紧密关联，正向调控芝麻产量性状。该研究结果为分析芝麻基因组结构和进化、重要性状基因发掘与等位基因鉴定提供了宝贵的基因组资源和有效的方法。

该团队已出站博士后宋胜楠、在站博士后Senouwa Segla Koffi Dossou和华中农业大学博士研究生孟明辉为论文共同第一作者，王林海研究员和游均副研究员为共同通讯作者。该研究得到了中国农科院科技创新工程、国家特色油料产业技术体系建设专项等项目的资助。

转自：“植物生物技术Pbj”微信公众号

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