如何查找目标基因的详细信息?
2022/7/28 10:49:48 阅读:572 发布者:
基因的功能研究是生命科学研究中非常重要的一部分,而如何查找感兴趣已知基因的信息就显得非常重要。之前在《如何查找感兴趣基因的信息?》一文已经为大家介绍过一种方法,这里再为大家介绍一个类似的数据库。
数据库的首页如下:
数据库链接:https://www.genecards.org/
关于目标基因信息的查找,共有两种方式,一是输入关键词直接搜索基因信息,二是通过Explore a Genes输入框直接查找基因,例如,我们只要输入MDM2基因后点击GO按钮即可查看基因信息。当然也可以查看该基因相关的部分版块(Sections)信息。
查到的结果如下,结果页面的第1部分(Section)列出了该基因不同的别名。名称后面的数字代表名称来源的编号,类似于参考文献的序号,与结果页面的最后部分关联(Sources for MDM2 Gene)。
点击Jump to section可直接跳转到感兴趣的信息版块。这些版块包含的信息主要有:基因别名和分类、结构域、药物、基因表达情况、GO terms和代谢通路、信息来源、文章发表情况等。例如,以下是信息来源不同的基因信息概要(Summaries)
而在Genomics版块中,可以查看该基因的调控元件、基因组位点信息、染色体位置信息等。
在Proteins for MDMS Gene版块可以查看这个基因对应编码蛋白的属性信息,比如氨基酸数量、分子质量、3D结构、四级结构信息等。
而在Domains & Families for MDM2 Gene版块,可以查看MDM2基因的基因家族信息、蛋白结构域信息、蛋白结构域的图形展示。
在Function for MDM2 Gene版块,可以查看MDM2基因的分子功能信息、GO功能注释信息等。
在Localization for MDM2 Gene版块可以查看MDM2基因的亚细胞定位信息,如下图。
而在Pathways & Interactions for MDM2 Gene版块,可以查看MDM2基因相关的代谢通路,主要是Reactome pathways。
最后,在Publication for MDM2 Gene版块,可以查看MDM2基因相关的文献。
好啦,本次分享就先到这里!
转自:基迪奥生物
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