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如何找到气象论文的数据和代码?

2022/7/13 13:46:20  阅读:545 发布者:

前段时间由于科研需要发邮件给NCAR的一个教授请求了点数据,由于数据比较大,教授说可以通过NCAR Data Sharing Service共享(数据存在NCAR服务器教授的个人文件夹上,通过Globus Connect Personal来和collaborator共享,无需NCAR员工accout即可访问),来回弄了几次最后终于搞定了。科学下载的话速度还是很快的能达到30m/s左右,只能感叹大数据时代下源代码和数据的珍贵,正巧前端时间也有人问复现论文或者算法的过程中怎么找源代码和数据资源。特别是对于大气科学相关的研究,有啥常用的平台呢?于是就有了这期关于数据及源码托管的“水文”哈哈。另外对于大气科学论文溯源及预印本平台的总结可以见我之前的一期推送:气象专业的你还只知道arXiv?(非广告doge

NCAR Data Sharing Service 

数据对研究者至关重要,但分析、存储和共享大型数据集是一项艰巨的任务。同时为了确保发表结果的可重复性、提高学术报道的透明度、促进科研数据的开放共享,很多期刊也要求作者在投稿时提交论文支撑性数据和补充材料文件。下面就简单列出一些我知道的比较常用的数据源码托管网站,文末还附有一招万不得已的时候可以用的“暴力破解”,话不多说直接发车(doge

Github

对于源代码来说,首当其冲的毋庸置疑肯定是世界最大同性交友网站Github,各种工具包算法的首选托管平台。大家都熟知就不多介绍了哈哈

网址:https://github.com/

Github yyds 

Figshare

Fighare是一个基于云计算网络的在线数字资源库,科研人员可以保存和分享他们的研究成果,包括数据、数据集、图像、视频、海报和代码,从而使得他们的研究,甚至包括初步研究,曝光并获得认可。由于 Fighare 遵循开放数据原则,用户可以自由访问数据和上传内容。因此,科研人员可以通过Fighare 公开他们的数据,Fighare 上的所有条目都有 DOI,方便引用。

网址:https://figshare.com/

Figshare的主页 

Zenodo

Zenodo与前面说的FigShare都是知名的数据分享平台,一站式发布研究成果和资助信息。Zenodo对数据格式没有限制,且数据可以终身保存,最多可以存储 50GB 的数据。支持各种内容,包括刊物、演示文稿、论文集、项目、图像、软件(包括与 GitHub 的集成)以及所有语言的数据。

网址:https://figshare.com/

Zenodo的主页 

Science Data Bank

科学数据银行(Science Data Bank,简称ScienceDB)是中国科学院计算机网络信息中心自主研发的致力于打造科学数据长期共享与出版的国际化通用存储库,面向国际学术界、学术期刊和出版商等提供数据出版和获取服务。ScienceDB一直大力推动其在学术期刊、科学数据中心、重大科研项目、科研机构、高校、科研个人等方向的应用推广。截至目前,ScienceDB已被Springer NatureScientific DataElsevierCell Press和美国地球物理学会(AGU)旗下期刊收录到其推荐的通用型数据存储库名单;获得Web of ScienceData Citation Index收录认证、Google Dataset Search收录索引;成为NatureElsevier等出版商旗下6000余本国际期刊推荐的数据存储库。

网址:https://www.scidb.cn/en

ScienceDB的主页 

Dryad

Dryad是一个国际开放访问的研究数据存储库,尤其是进化、遗传和生态生物学的基础数据。Dryad 是一个精心策划的通用存储库,它使数据可发现、可自由重用和可引用。由于Dryad最开始是面向生态生物学及环境等,数据集多与生态气候学,古气候相关,涉及气候变化居多。

网址:https://datadryad.org/stash

Dryad的主页 

对于论文源代码,尤其是涉及机器学习和大气科学交叉的研究,可以从以下几个比较有名的网站看看:

Paperwithcode

自动把论文连接到实现代码的 GitHub 资源库和数据集,并根据 GitHub 的收藏量排序。每篇论文可能有多个合并的条目。但是收录的文章可能有延时,缺少最新的文章。

网址:https://paperswithcode.com/

Code Ocean

不仅提供提供源码托管,也提供收费算力, 可以直接为文章托管代码的网站,部分源码比较新,托管的文章水平也不错。

网址:https://codeocean.com/

PaperwithcodeCode Ocean 

最后是关于一个复现论文的时候万不得已的暴力破解方法,即逆向作图,一般仅限对一维数据时(非二维地图)。可以使用Origin中自带的图像快速数字化工具进行自动或者手动追踪,比如对他人文章中经过复杂处理的的一些序列需要做相关或者回归等分析可以尝试,但是其结果较为粗糙,适合快速定性验证猜想使用。

其实类似的提取图片数据的方法也很多,通过pythonmatlab等代码也可以实现,只不过origin这个已经有UI界面功能也相对比较完善了。

转自:happy科研

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