一文读懂生存曲线及其作图

导言

首先说一下，什么是生存率？

生存率乃指某生物种群内的每一个体经过一定时限以后生存的机率。如以横轴为经过的时间(日、月或年)，纵轴为生存率，则可绘出生存曲线。根据生存曲线的类型可以判断生物种群死亡的规律[1]。

目前临床或者生命科学领域最常用生存率曲线（也称Kaplan-Meier曲线）来描述各组患者的生存状况或者各组实验动物的存活情况。

所以呢，我们今天介绍一种比较简单地生存曲线的绘图方法。

软件

Graphpad

图文教程

动物实验

动物实验的话，因为受到人为控制，所以死亡和未死亡的都可以统计到，不存在删失的情况。所以，转换为生存曲线作图数据一般是从1到1，或者从1到0。没有从1到0，再到1，再到0的情况。

这里的话，我们设置两个组，分别为模型组和给药组，每组动物共10只。表格里面记录的是当天存活/剩余的鼠的数量，一共测了15天。

接下来，我们将上述数据处理为作图使用的数据。

(一)假设15天为实验的终点

模型组，从第一天开始给药物就出现死亡，死亡1只，所以天数记为1，作图数据记为1，中间未出现死亡的天数不计。而到了第11天，死亡三只，所以天数记连续3个11，作图数据记为1，也就是在哪一天，死了几只，就罗列几个天数，计数为1。

给药组因为还有存活鼠，比如，到第15天，还有三只存活，所以15天连续记为三个0。

最后，我们整理一下数据，将天数放在同一列，将组别数据分开放。

1. 打开Graphpad软件，选择生存曲线分析

2. 将上述的数据复制进去Graphpad。

3. 点击Results中的Survival of Data 1，就可以出现两组比较的结果了。查看第一个统计结果就行，这里表明，两组比较，有显著性差异。

4. 点击Graph中的Data1，进行作图，按照默认参数进行即可。

5. 调节线条的颜色，以及粗细。

6. 双击Y轴，设置Y轴范围和节点。

7. 设置X轴节点和范围。

8. 最后，你可以给图形拉一个框(个人喜好)，然后你就可以将图形导出了

9. 当然，上述举例的是两组的比较，如果是多组的话怎么办，你就得两组进行两两比较了，选择analyze，选择分析中的生存曲线，将想要分析的两组进行选择。

10. 看一下，这里有默认设置，死亡为“1”，存活或删除为“0”。

11. 然后在Results中，你就可以看到两组对比的差异性了。

(二) 假设10天为实验的终点

如果假设第10天是实验的终点，那么数据的处理如下，到第10天，存活的全部记为0。总数加起来依然是10，这也是核对自己是否统计遗漏的办法。

作图的话，按照上述作图方法进行作图即可。

(三) 临床实验数据

1. 点击生存曲线绘图，这里使用软件提供的数据。

2. 我们会发现，他的数据是从1到0，再从0到1，这是因为在第46天，有病人联系不上，或者其他原因不参与实验，但是又在好好生活，所以为存活，作为删失数据，记为0。

3. 作图如上述所示，最终我们会发现，做的图中会出现短线，这就是因为有删失数据。

4. 怎么样，你明白了吗？

参考文献

[1] 辛毅，于夫主编．科技采编手册．郑州：河南科学技术出版社，1986.10：33

转自：医学科研小坑 2022-05-18 22:03

文章来源于Paper绘图 ，作者超级super栋

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