橙医生 科研论文时间 2022-04-28 11:41
常言道：一图胜千言。科研论文中更是如此。
通过上周《可以色色！如何科学色色？》这篇文章，相信大家已经了解了论文配图的配色和排布。但是科研作图是个大学问，如何规范作图，仍是许多科研人的痛点。
图片作为论文的门面，须得规范，非得要「西装革履」「衣冠楚楚」才行，绝不能「胡子拉碴」「不修边幅」。
可惜许多刚刚踏入科研之门的萌新，并不了解科研论文图片的制作规范，甚至许多好不容易熬到毕业季的老腊肉，也是一知半解，云里雾里。
接下来，笔者就从一个具体例子出发，和大家系统性的说一下，规范科研论文组图的流程。
我们来看看下面这张组图（图 1）。这张图乍看还 OK，但其实很不规范。比如说：图片大小不统一、线条和字体大小粗细不统一、图片模糊等等，像个不修边幅的抠脚大汉。
那么今天，笔者带大家将其修改规范，从而符合科研论文图片的要求，华丽变身成为「衣冠楚楚的职场精英」。
在修改之前，我们需要了解几个基础知识：
一、基础知识
1、科研论文图片的物理尺寸和一般要求
正如人有身高、声音等很多特征，一张图片有很多属性，如宽高、像素、分辨率。
首先，我们一定要牢记在心的是，当我们进行组图排版时，一定要基于图片的物理尺寸，即整张组图的长宽是多少（厘米）、组图里面每张图片的长宽是多少（厘米）。
就像我们用 Word 文档时，一般情况下也是基于 A4 纸的大小去写作的（宽 21 厘米，长 30 厘米）。
在科研论文组图中，我们主要考虑的是宽度。由于科研论文也是按照类似 A4 纸的尺寸进行排版，A4 纸宽 21 厘米，除去两边的页边距空白，就是其可以容纳图片的宽度。
科研论文组图根据宽度主要分为三种：全版图，宽度约为 17 cm；半版图，宽度约为 8 cm；以及 2/3 版图，宽度约为 12-15 cm（图 2）。
我们在进行组图的时候，首先要确定的是，我们要做上面三种组图的哪一种。然后，再一一处理组图里的单张图片。
对于单张图片，也都有相应的格式要求。比如说，字体类型推荐为 Arial 或 Times New Roman，字体大小最好在 6-14pt，线条粗细在 0.25-1.5pt 之间。（具体的各类要求，大家可以参考《SCI 插图规范（国际通用版）》详细了解。）
2、科研论文图片的两种类型
科研论文图片主要有两种类型，一种是位图，一种是矢量图。
位图由像素点构成，放大可以见到如马赛克般的像素小点，常用的格式有.tiff，.jpg，.png，科研论文图片中的位图主要是照片，比如说荧光图、组化图、动物成瘤照片等，分辨率至少要达到 300 像素/英寸。
矢量图由路径和锚点构成，任意放大缩小清晰度是不变的，常用的格式有.pdf，.eps，科研论文图片中的矢量图主要是统计图（如散点图、柱状图）和模式图（如信号通路图、流程图）。如图 1 中，A 图和 B 图就是矢量图，C 图是位图。（所有能做成矢量图的建议都做成矢量图。）
根据以上两种图片类型，我们要分别采用不同的软件去生成和处理。
对于位图，我们要尽量获取高质量的原图，然后在 Adobe Photoshop （PS）中进行处理。对于矢量图，我们一般由矢量图软件生成，生成后可以同时处理，如 GraphPad Prism；也可以生成后，导入至 Adobe Illustrator（AI）中进行处理。（不推荐使用 PPT 作图和排版组图。）
二、科研论文图片处理和组图排版的一般流程
有了上述两个基础知识，我们就可以归纳一下科研论文图片处理和组图排版的一般流程：
1. 确定排版：全版图？半版图？2/3 版图？组图里并排放几张图片？从而得出单张图片的基本参数，如宽度和高度。
2. 用 PS 处理位图，调整到所需大小和分辨率。只处理图片，不要添加文字或线条。
3. 在 Graphpad Prism，Excel，SPSS 里生成矢量统计图，在相应软件或导入至 AI 中进行处理。
4. 用 AI 制作模式图并处理。
5. 将上述处理好的单张图片都导入至 AI，在 AI 中添加文字、进行修饰，完成排版组图。
6. 最后，导出。如果以位图格式导出，选择.tiff。如果以矢量图格式导出，选择.eps。
三、具体实例演示
接下来，我们就以图 1 为例，进行详细演示。
我们首先确定组图的宽度。笔者选择 2/3 版图，将图 1 设置为宽度 120 毫米，有 3 个图，每个图的宽度便是 40 毫米，然后在图片两端和每个图之间设置 1 毫米的间隙，这样，图片的宽度一共是 124 毫米。
如图 3 所示，打开 AI，点击画板工具（1），新建一个画板（2），设置画板参数（3），命名为 Figure 1，将宽度设置为 124 毫米（4），把左上角起始位置 XY 标尺均设置 0（5）。然后分别在 1 mm，41 mm，82 mm，123 mm 处添加参考线，以标明图片的宽度（6）。
然后，设置图片的高度。常见荧光图的宽高比为 4：3，因此，图 1（C）的高度设置为 3 厘米，鉴于荧光图片的高度一般与坐标轴相一致，所以我们也将图 1（A、B）的坐标轴高度设置为 3 厘米。
接下来，我们就分别处理图片。
首先处理荧光图，修改宽高和分辨率。如图 4 所示，打开 PS，将图片导入，点击菜单栏中的「图像（1）」，选择「图像大小（2）」，就可以看到原图的宽高和分辨率（3），这个时候，将分辨率改成 300，点击「确定」（不要勾选底下的「重新采样」）。
现在，图片的宽高为 13.55×10.16 厘米，由于我们需要的只是 4×3 厘米，所以图片的大小是完全足够的。
然后，如图 5 所示，使用「矩形选区」的功能，将样式设置为「固定大小」，宽高为 4×3 厘米。点击菜单栏中的「图像（1）」，选择「裁剪（2）」。
这个时候我们再次查看「图像大小」，图片宽高已经变成 4×3 厘米，分辨率 300（3），我们导出即可。
处理好荧光图后，我们开始处理柱状图（图 1（A））。这里以 GraphPad Prism 为例讲解。原图在 Graphpad Prism 里制作完成后，开始调整图片样式尺寸。如图 6 所示，打开 Graphpad Prism，在「视图（View）（1）」菜单中选择「显示网格（Show Grid）（2）」，以便清晰展示图片的宽高。
随后，如图 7 所示，我们点击工具栏中的「Change」（1），先选择「Titles & Fonts」（2），调整字体类型、大小和与坐标的距离。
我们在「Numbering and labeling」（3）中，点击 X axis 和 Left Y axis 右侧的「Font」（4），调整为「Arial-Regular-7pt」（5）。然后在 Distance from axis 中，设置为 0.1 cm（6）。
然后，我们选择「Frame and Origin」（7），调整坐标轴的宽高和线条粗细。我们在「Shape，Size and Position」（8）中，将「Shape」选择为「Custom」，自定义坐标轴宽高。我们按照荧光图的高度，先将」Height」设置为「3 cm」。
这个时候，我们回到图片窗口，发现将「Width」设置为「3.6 cm」时，整个图片的宽度在 4 厘米左右，是合适的。然后，我们在「Axes and Colors」中，将「Thickness of axes」调整为「1/2pt」（9）。
现在就将图片按照科研论文规范调整完毕了。笔者推荐，在 Graphpad Prism 里将图片直接复制粘贴到 AI 里，进行组图排版。
接下来，我们处理流式图（图 1（B））。流式图是用 Flowjo 导出的 PDF，我们直接将其导入至 AI 处理。
这个图处理的流程大致步骤依次是「释放剪切蒙版-调整大小-调整线条粗细-调整字体类型和大小」。（流程比较复杂，这里就不展开讲了）。
最后，将处理好的三张图导入到 AI 中。如图 9 所示，可以看到，处理后，三张图的尺寸、字体类型和大小、线条粗细等都是一致的。
接下来，使用参考线将它们对齐，添加上图片编号。这样，一张简单的组图就初步完成了。和图 1 相比，是不是赏心悦目多了呢？
看到这里，有些小伙伴可能已经晕了。总结一下，图 10 就是科研论文组图排版的大概流程。小伙伴们只需要按照流程，理清思路，跟着一步步操作，就可以拥有同款规范帅气的组图哦！
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