如何通过免费的医学数据库发表文章?
2022/4/21 9:31:26 阅读:383 发布者:chichi77
MIMIC医学数据库
因时间精力有限等原因,经常无法建立自己的专科数据库,或因一些重症患者资料过少,难以分析。目前国内外已经有很多免费对外开放的大样本的临床数据库,只要通过一定的申请,就可以获得相应的数据。
接下来介绍一个可以通过注册,完成相关课程答题(可以反复答题,每次答完之后可以看到正确答案,所以花费些时间,就可以满分),申请数据下载,就可以分析写作论文的医学数据库:MIMIC。
MIMIC 是一个重症医学数据库,全称是Medical Information Mart for Intensive Care。2003年,在NIH的资助下,来自贝斯以色列女执事医疗中心(Beth Israel Deaconess Medical Center)、麻省理工(MIT)、牛津大学和麻省总医院(MGH)的急诊科医生、重症科医生、计算机科学专家等共同建立的一个数据库MIMIC III 数据库为普通医生,特别是重症医学科医生开展临床研究提供了极大的便利,因为该数据不仅资料详细,而且包括随访资料。其随访终点包括:住院期间死亡、ICU内死亡和出院后的全因死亡。对影响重症病人预后的因素进行探讨具有极为重要的价值,因为疾病预后在很大程度上可以影响治疗措施的制定。
MIMIC之所以备受推崇,在于它:
1.免费,是同类中唯一可自由访问的重症监护数据库;
2.数据集跨越十多年,包括多样化和大量的ICU患者
3.包括人口学资料,实验室结果,治疗方案等数据。
4.一旦数据使用协议被接受,分析就不受限制。
下载数据库以及安装分析
本地数据的安装分析:
1.从physionet进入个人帐号,进入MIMIC III数据库,下载所有的数据包(约40G),然后解压缩为本地计算机上某处的.csv文件
2.下载并安装postgresSQL。
3.下载建库的脚本(script)。
MIMIC-III的数据文件内容非常大,约有40G的文件。
MIMIC数据库申请,下载还是比较方便的,不过,对于数据的分析、提取,还是需要学习相关的计算机语言SQL。不过,相比较自己花费数年制作数据库、做课题、写论文而言,这个已经是一个捷径了,而且你只需要一台笔记本即可。
我也是从昨天开始了解MIMIC数据库,自己做了大量的笔记。
今天开始注册,并完成网络课程学习,拿到了考核证书。接下来,要提交申请下载权限,后面再学习SQL,便于数据分析提取。大家有兴趣的话,可以一起学习,毕竟免费的临床数据库(可以用来发文章),还是非常香的。
Reference
傻瓜版MIMIC数据库注册指南:https://www.sohu.com/a/440575509_664421
教你如何轻松获取MIMIC数据使用权限:https://blog.csdn.net/foneone/article/details/122473987
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