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R作图配色---颜色提取及色彩搭配

2022/4/1 13:55:42  阅读:411 发布者:chichi77

看SCI文章,发现一个规律,越是高分的文章作图越是“花里胡哨”,出各种新奇的图,色彩上也很鲜艳,而大多数人就喜欢看那种花里胡哨的。其实很多时候,我们里高分文章的图只差一个思路和配色,同样的数据别人做的图看起来很好,很大原因是颜色搭配的好。今天我们就谈谈R的色彩搭配,让你的作图可视化向高分文章看齐。

一、提取颜色

      看到别人文章中好看的配色,直接提取是最方便的方法,可以使用AI或者PPT操作,主要是为了得到颜色的十六进制代码,可用于R绘图。不过这里我们介绍一种R的方式,可以将读入R中,提取一张所有颜色。

      首先截取文献的,尽量清晰,然后读入:


      然后尽可能多的获取颜色,并查看颜色,然后自行搭配。


二、自动色彩搭配R包

      还记得我们在说单细胞UMAP修饰的时候(单细胞基因可视化之UMAP图修饰),里面提到过一个函数ggsci。这个包提供了各种形式的色彩搭配,有适用于连续变量的--=例如热图,也有离散性变量的颜色搭配,还是比较方便的。与ggplot2配合使用,做好图之后,选择需要的主题修饰即可。


      以下是ggsci网站提供的各种主题函数汇总:

      

三、自己造

      要说最简单粗暴、最有个性的搭配还是靠自己,这里分享R语言颜色表以供参考,还请不要太过“浓妆艳抹”。想要获取完整版的可以在公众号后台回复:R语言颜色,自行下载。

                       快去修改下自己图的颜色吧,让其变个装!

 

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