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一键绘制ROC曲线--无需下载、适合新手小白

2022/3/28 14:43:56  阅读:918 发布者:chichi77

各位小伙伴好,今天和大家分享临床中经常遇到的一种研究类型:诊断试验。诊断试验的核心在于ROC曲线,了解了ROC就了解了诊断试验的一半。那么什么是ROC曲线,诊断试验又应该怎么设计呢?下面请先看定义:

ROC曲线,receiver operating characteristic curve,即受试者工作特征曲线,在临床上被应用于诊断阈值的设置,即选取确诊率高同时误诊率低的最佳诊断值,或是用于比较对于同种疾病的多种诊断标准。

通俗来说,就是通过一个或多个指标,来判断受试者是否诊断为某类疾病或诊断,比如,通过尿液来判断是否怀孕,就是检查尿液中的HCG超过某个数值来判断是否怀孕。当然,这种方法不是100%准确,评判一个指标诊断的准确度用到的就是AUC

AUC指的是ROC曲线下的面积大小,可以通俗理解为诊断的可靠程度,AUC越接近于1,说明诊断效果越好。(通常认为:AUC0.50.7时有较低准确性,AUC0.70.9时有一定准确性,AUC0.9以上时有较高准确性。AUC=0.5,说明诊断方法完全不起作用,无诊断价值。)

关于如何开展诊断试验,我们以2017年发表在GUT杂志上的文献为例:“ROC-king onwards: intraepithelial lymphocyte counts, distribution & role in coeliac disease mucosal interpretation”,文章大意是“ 通过上皮内淋巴细胞计数区分诊断乳糜泻患者。”

我们用PICOS方法来快速get一下文章的重点。

Population :研究由来自三大洲8个国家的19个中心的研究人员,招募了401名参与者。

Intervention :其中包括198名已确诊的乳糜泻(CD)Marsh III型病变患者。

Comparision:其余203名未患病者为对照组。

Outcome :以十二指肠活检中上皮内淋巴细胞(IEL)计数为待评价诊断标准,即每100个肠细胞中IEL的数量,同时收集了人口学和血清学数据。

Study :该研究为多中心病例对照。研究目的是找出用IEL计数来诊断乳糜泻(CD)Marsh III型病变的最佳阈值,也就是说,IEL数量为多少时,将病例诊断为乳糜泻是最可靠可信的。得到的ROC曲线如下:

从上图看到,IEL计数这个诊断标准很优秀,AUC达到了99.5%。而该曲线的最优cut-off点,是以25IEL/100个肠细胞为诊断阈值的这个点,此时的灵敏度为0.990,特异度为0.931。曲线上的每一个点代表的是某个阈值下的一对灵敏度和特异度数据。

换句话说,通过IEL计数诊断乳糜泻,可以达到99.5%的可靠程度,其中灵敏度(真阳性率)为99%,特异度(真阴性率)为93.1%,各方面都非常高。

关于敏感度、特异度、假阳性率的定义,大家可以收藏下图:

说不如做,如何才能快速画出一个ROC曲线,作出上述的指标呢?如果你会用SPSS、或者SASR,那么这个问题很简单,文章到这里就结束了。

如果你是一个小白,或者想用更简单的方法来做出ROC曲线,则可以试一试我们团队做出的一个小工具:EasyR在线统计分析软件。这个软件不用下载,不用编程,可以快速让我们做出符合SCI要求的图表。

现在就来说下ROC分析”这个新模块的具体操作流程:

1)进入ROC功能模块(目前在“其他功能”模块中,后期可能会修改入口):

2)确定结局变量(即实际分组变量),和待评价诊断指标(模型中的自变量),点击运行。

3)结果解读:软件可以得出包含AUC和最佳阈值在内的计算结果,点击“”则看到曲线本身。

4)如勾选下方的“多个自变量逐个建模分析”,就可以分别得出每种诊断指标的ROC分析结果。默认不勾选,则得到多个X联合诊断的AUC结果。

5)本模块也支持“Bootstrap重复采样”。支持1-2000次采样,勾选之后则会得到平滑的曲线,同时丢失“最佳阈值”,并且“Bootstrap重复采样次数”越多,运算过程就会变得越缓慢,勾选后请耐心等待。

以上就是EasyRROC模块的主要内容了,它帮助我们摆脱了敲代码和不断试错的过程,甚至不需要拖拽,只要选择好变量,然后点点点,就可以完成运算和画图了,非常适合新手小白。

EasyR是我们团队完全自主开发的一款在线分析工具,功能上也许还有很多欠缺,但是我们希望通过一些好用的工具,能够帮助大家快速的了解数据的潜在分析价值。欢迎各位小伙伴在使用中反馈,向我们提出意见。

另外回答一下大家可能关心的几个问题:

1. 使用EasyR需要下载软件吗?

不需要。EasyR是一款线上数据分析工具,打开网页就能使用。支持Mac电脑和Windows电脑,甚至也可以用IPAD打开。

2. 目前不是已经有XXX软件、XXX软件,你们为什么还要做一个新工具?

SPSSSAS等软件不同,EasyR是一款在线分析平台,不需要下载,不需要编程,也不需要我们懂太多分析方法,更适合新手小白,我们希望通过好用的工具,让大家快速了解数据潜在的分析价值。

3. 使用EasyR要收费吗?

EasyR目前处于公测阶段,近期内不会收费,之后会根据实际情况调整,大家可以抓紧时间注册哦。

4. 如何打开网站,获得邀请码?

大家在电脑上输入www.easyr.cc 就可以打开了,关注下方微信号“易侕科研”,回复:邀请码,领取邀请码。

好啦,以上就是本次分享的主要内容啦。EasyR目前免费,想要写SCI文章,但是又不懂统计、找不到人帮忙的小伙伴千万别错过哦,快来试试吧!

如有侵权,请联系本站删除!

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