医学课题设计是提前对课题探究的规划与安排，也是判断课题探究能否实现的重要步骤。因而对于医学课题设计的写作，我们需要把握好设计的要素、内容和原则。
关于课题设计的要素
1)实验对象
实验所用的材料即为实验对象。如用小鼠做实验，小鼠就是本次实验的实验对象，或称为受试对象。实验对象选择的合适与否直接关系到实验实施的难度，以及别人对实验新颖性和创新性的评价。一个完整的实验设计中所需实验材料的总数称为样本含量。最好根据特定的设计类型估计出较合适的样本含量。样本过大或过小都有弊端。
2)实验因素
所有影响实验结果的条件都称为影响因素，实验研究的目的不同，对实验的要求也不同。影响因素有客观与主观，主要与次要因素之分。研究者希望通过研究设计进行有计划的安排，从而能够科学地考察其作用大小的因素称为实验因素(如药物的种类、剂量、浓度、作用时间等);对评价实验因素作用大小有一定干扰性且研究者并不想考察的因素称为区组因素或称重要的非实验因素(如动物的窝别、体重等);其他未加控制的许多因素的综合作用统称为实验误差。最好通过一些预实验，初步筛选实验因素并确定取哪些水平较合适，以免实验设计过于复杂，实验难以完成。
3)实验效应
实验因素取不同水平时在实验单位上所产生的反应称为实验效应。实验效应是反映实验因素作用强弱的标志，它必须通过具体的指标来体现。要结合专业知识，尽可能多地选用客观性强的指标，在仪器和试剂允许的条件下，应尽可能多选用特异性强、灵敏度高、准确可靠的客观指标。对一些半客观(比如读pH试纸上的数值)或主观指标(对一些定性指标的判断上)，一定要事先规定读取数值的严格标准，只有这样才能准确地分析自己的实验结果，从而也大大提高了自己实验结果的可信度。
关于课题设计的内容
1.阐述背景。即阐述该课题研究的背景，包括理论背景和实践背景。理论背景主要是阐述该课题的研究是在什么样的意识形态环境下产生和进行的，理论依据是什么，将在什么样的理论指导下进行研究。实践背景主要是说明在什么样的实践环境中产生和进行，其中具有什么有利条件和不利因素，存在什么问题等。在阐述背景的时候要将理论背景和实践背景结合起来论述，单独的论述并不能体现课题的研究价值。
2.研究的对象和内容。确定课题研究的对象和内容目的是让人明确该课题要研究什么，在什么范围内研究。这是课题设计中的重要内容，所以在撰写的过程中，要清楚明白的表述出研究的内容。
3.研究的必要性和可行性。包括说明问题产生的原因、课题的理论和实践价值、前人的工作和经验教训、完成本课题已具备的条件、存在的困难和障碍，以及克服困难的主要措施等。
4.研究的目的和意义。阐明该课题的研究有什么意义，要达到什么目的。这是开展此次课题研究的核心价值，所以在撰写的过程中，我们要突出这部分的内容。
5.研究假设。确定和阐明研究的实验因子，提出对解决课题中问题的最初假设，即假设根据某种理论和条件，通过研究可以取得什么样的成果。假设部分要贴切实际，不要随意想象，要有理有据。
6.研究原则、方法和手段。要规定课题研究的指导原则，并根据课题的类型和性质决定采用什么研究方法和手段。
7.评价。阐明对研究成果将如何评价，包括评估的人员、原则、过程、方法等等。
8.实施步骤和措施。确定整个研究过程的实施步骤，包括研究阶段划分，每阶段的具体任务，各位参与研究人员的工作范围和任务，各阶段各方面的负责人，研究成果的形式和要求，所需财力、物力及开支的预算计划与安排。
关于医学课题设计的原则
1.随机原则：即运用“随机数字表”实现随机化;运用“随机排列表”实现随机化;运用计算机产生“伪随机数”实现随机化。尽量运用统计学知识来设计自己的实验，减少外在因素和人为因素的干扰。
2.照原则：空白对照组的设立——只有通过对照的设立我们才能清楚地看出实验因素在当中所起的作用。当某些处理本身夹杂着重要的非处理因素时，还需设立仅含该非处理因素的实验组为实验对照组;历史或中外对照组的设立一一这种对照形式应慎用，其对比的结果仅供参考，不能作为推理的依据;多种对照形式同时并存。
3.重复原则：所谓重复原则，就是在相同实验条件下必须做多次独立重复实验。一般认为重复5次以上的实验才具有较高的可信度。
4.平衡原则：一个实验设计方案的均衡性好坏，关系到实验研究的成败。应充分发挥具有各种知识结构和背景的人的作用，群策群力，方可有效地提高实验设计方案的均衡性。在实验设计的过程中要注意时间上的分配，只有在时间上分配好了，才不会出现一段时间特别忙而一段时间特别闲的情况。
5. 弹性原则：所谓空格，指的是在时间分配图上留有空缺。适当的空缺是非常必要的，只有这样才能富有弹性的实施实验计划，并不断地调整好自己的实验进度。
6. 最经济原则：不论什么实验，都有它的最优选择方案，这包括在资金的使用上，也包括人力时间的损耗上，必要时可以预测一下自己实验的产出和投入的比值，这个比值越大越好，当然是以你所拥有的实验条件作基础的。
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