大家都知道，SCI论文从投稿到发表要经历漫长的过程，在投稿系统中上传了文件后，也要经过一系列的审稿状态。如果出现了Accept，那么就要恭喜你了，说明你的文章已经被期刊接受，是一个值得庆贺的大好消息。
论文被接受固然是一件令人兴奋的事，但是也别高兴太早，接受并不等于出版，之间还要经历几个流程。而这其中的细节处理很大程度上影响到论文见刊的时间，如果处理不当甚至会导致被撤稿的悲惨结局。
论文被接受后，论文的出版流程将进入下一阶段，出版社会联系通讯作者进行接受后事宜的沟通，直接关系到文稿能否最终发表以及何时发表。所以，这个阶段也是十分重要的，但往往很容易被大家忽视。究其原因，是因为平时作者投稿、修回会很积极，及时登陆邮箱或期刊主页密切关注文稿状态和进展，但是收到接受函邮件后作者感觉松了一口气而松懈下来，不再那么紧密地关注文稿进展，这样有时候会错过一些关键邮件（尤其是当投稿邮箱不是常用邮箱时），从而造成一些不良后果，极端情况下甚至可能会导致论文被撤稿，导致写好的论文无法成功发表，继而功亏一篑。
接下来就让我们一起来看看Accept后还有哪些流程需要处理吧！
一、清样校对和签署版权协议
在文稿的接受函中，一般会有相关段落提到后续仍有版权问题需要作者签署。这个时候作者需要耐心等待，经常留意文稿的通讯作者邮箱，看看是否收到印刷编辑寄回的清样（Proofs）和版权转让协议书（Copyright transfer agreement）或者出版协议书（Publishing agreement）。
清样（Proofs）校对是论文接受后最重要的一步。到了这一阶段，一般不允许作者再对文稿进行大幅度修改，只可以更正一些不影响结果和结论的小错误，而且几乎所有的期刊清样时都会请作者仔细核对作者信息和单位。有的作者由于清样阶段不够认真，单位或作者信息错误，导致不能毕业或晋升（因为和单位要求的署名方式不一样），后期就会很被动。因此，一定要和单位科研处明确，自己的单位应该如何署名，最好不要自行翻译。值得一提的是，如果研究有基金资助，基金号一定要核对准确。否则，论文发表后可能无法用于基金结题。
由于不同期刊发送清样的时间和步骤都不太一样，所以处理方式也不尽相同。有的期刊是由出版社来负责清样事宜，期刊编辑部在发送接受邮件通知作者后就会在一定时间内将文稿转到出版社（快的1–2天，慢的需要几个月），之后出版社就会与通讯作者联系清样事宜，可能是对已经排版好了的PDF版本进行确认，也可能是请作者直接在网页上处理。
有的期刊则会由专业的语言编辑对文稿进行润色后再发给作者核对清样，有时候甚至还可能会有一些文稿相关的问题需要作者修改。此时，作者按要求处理即可。一般来说，这类期刊的清样时间与接受时间间隔要长一些，有的甚至长达一年。所以，这期间作者需要时刻关注通讯作者邮箱。
还有一类期刊（如PLoS ONE），在文稿接受后就会直接以接受版本在线发表，但是，接受前也会让作者按照期刊要求仔细修改文稿，也就是说，在接受前有一个类似清样的处理过程。到了这一阶段，作者一定要记得不能随意更改关键数据，如果更改了数据是有可能导致论文被期刊编辑部撤稿的。所以，一定要记住清样时不能更改关键结果和结论。
清样时要查看主要作者名字和单位是否写错（大部分期刊是不允许投稿后随意增减作者的），基金号是否写错，图表中的数据是否有误。有的期刊清样校正后的稿子是不允许再改动的。如果一定要再次改动就要收取费用，并且会延误出版。不论是在线清样还是PDF清样，一般需要尽快传回给出版社的印刷编辑。必须要注意的是，清样后再对文稿进行改动将会非常困难，很多情况下不能进行大修改而只能勘误（Erratum）了。届时需要联系编辑，并准备一个勘误说明。所以，这也要求作者在清样这一步非常细心地校对文稿，尽可能地查出所有错误。
另外，并非所有出版社都是在接受后签署版权转让协议书或出版协议书的，有些期刊编辑部会要求投稿的时候签署协议。如果是论文接受后要求作者签署这个文件，作者一定要及时签署，以免耽搁了文稿接受后的处理速度。一般来说，期刊编辑部或出版社在没有收到作者签署版权转让协议书或出版协议书之前，论文是不会发表的。通常情况下，电子版的版权转让协议书有两种确认形式：一种是在投稿的最后步骤，在网上同意版权转让就可以。一旦完成后，系统就会自动给通讯作者发一封确认邮件，就不再需要进一步处理了；而另一种是作者下载打印填写后再扫描上传给出版社。
二、版面费、彩图费
一般来说，在期刊编辑部或出版社发来清样和版权转让协议书的同一封邮件中，会告知支付版面费的标准和支付方式。虽然很多期刊是不收版面费的，但开放获取的期刊会收版面费，随着此类期刊越来越多，收版面费的期刊比例也越来越高。还有的纸质版期刊版面比较紧张，论文长度控制在几页以内是不收取版面费的，而超出的页面则按照一定收费标准进行收费。通常，一些学会或研究机构主办的期刊是不收版面费的。一份期刊是否收版面费以及收费标准，可以在该期刊主页上的投稿须知中得知。也有少量收版面费的杂志期刊会在作者投稿时就会问到是否愿意在论文接受时交版面费。所以，只要作者仔细研究目标期刊的信息，就可以得知目标杂志是否收取版面费了。
另外一个涉及到收取费用的是彩图费，在传统的纸质出版刊物中几乎所有期刊都收取彩图费，有的期刊既有纸质版又有电子版，只有印刷成彩色纸质版才会收取彩图费，电子版的彩图则是不收费的。
收费问题需要慎重对待，不能掉以轻心，因为对于需要收取费用的期刊来说，作者不缴费论文是不会发表的。有时候作者可能及时返回了清样，但是没有及时付款或彻底忘记付款，最终也是有可能导致论文被期刊编辑部撤稿的。所以，不要心存侥幸以为可以免单。
有一些期刊在论文发表后寄发票（Invoice）给作者付费，这时作者应及时安排付费，如果出现先发表了而一直不付费，出版社一定会追缴，还有可能产生不良影响。轻者在后续投稿的过程中会有不良记录，影响论文的接受，重者可能导致已发表论文撤稿。
三、单行本征订
论文接受后，通常会收到期刊编辑部关于作者是否订阅单行本（也称为抽印本，Offprints或Reprints）的问题。其实单行本是书籍出版的一种形态，是一套多本的出版品当中仅包含作者论文的一本。单行本分两种：有封面的和没有封面的。有封面的单行本的封面上带有该杂志本期的封面以及该论文的题目、作者等信息。没有封面的则仅有论文本身。两种单行本纸质都比较好。
现在网络发达，绝大多数期刊已有全文PDF文档在网上刊登，下载很方便。PDF文档同杂志上发表的几乎一模一样，得到广泛认同。所以，许多作者不再定购单行本。值得一提的是，单行本目前还是有存在的必要。首先，多数期刊并不是免费向所有读者提供全文，只有在单位或个人订购了在线杂志（Online subscription）后才可下载。有些期刊则需作者选择是否免费向所有读者提供网上全文（即开放获取），如果是，则由作者付费，读者免费。许多不缺钱的作者会选择承担这部分的费用，因为对外开放阅读，无疑将会增加论文的引用率，以及作者的学术声誉。其次，也有一些期刊，是在收取作者版面费的情况下免费向读者开放全文，不过也有很多期刊即使收了不菲的版面费，读者要下载全文仍要再次收费。最后，目前国内有些单位的行政部门要求晋升职称用的论文一定要提交刊登论文的期刊或单行本（最好有封面），或从图书馆订的纸质期刊中的论文复印件。
目前向作者索要论文的已经不多，而且作者很容易从网上得到自己论文的PDF，直接E-mail给索要者即可。所以，面对期刊编辑部关于单行本的问题，作者是否需要单行本以及需要多少单行本要根据作者的实际需求来决定，因为订购单行本是需要付费的。
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