硕士论文总的来说是本科毕业论文框架和思想上的延伸和细化，文章中所要讨论的知识点变多了，讨论的较多更为更熟和理性化。
但是一两年的学习能让思想的广度和深度上升到另一个水平吗？
就学术上而言，那是肯定的，就个人思想深度而言，不一定。见过太多硕士毕业出来的人和大学本科毕业就出来工作的人不分伯仲。可见个人思想修行这个与在学校受学多久并没有直接关系。
那么，该如何写好硕士论文呢？
给硕士萌新的小建议
1. 先看综述，后看论著。看综述搞清概念，看论著掌握方法。
2. 早动手在师兄师姐离开之前学会关键技术。
3. 多数文章看摘要，少数文章看全文。掌握了一点查全文的技巧，以掌握全文为乐。
4. 集中时间看文献。看过总会遗忘。看文献的时间越分散，浪费时间越多。集中时间看更容易联系起来，形成整体印象。
5. 做好记录和标记。复印或打印的文献，直接用笔标记或批注。pdf 或html 格式的文献，可以用编辑器标亮或改变文字颜色。
6. 准备引用的文章要亲自看过。转引造成的以讹传讹不胜枚举。
7. 注意文章的参考价值。刊物的影响因子、文章的被引次数能反映文章的参考价值。但要注意引用这篇文章的其它文章是如何评价这篇文章的：支持还是反对，补充还是纠错。
8. 交流是最好的老师。做实验遇到困难是家常便饭。但首先应该想到的是交流。对有身份的人，私下的请教体现你对他的尊重；对同年资的人，公开的讨论可以使大家畅所欲言，而且出言谨慎。千万不能闭门造车。
9. 最高层次的能力是表达能力，再好的工作最终都要靠别人认可。表达能力，体现为写和说的能力，是需要长期培养的素质。
文献管理
1. 下载电子版文献时（caj，pdf，html），把文章题目粘贴为文件名。注意，文件名不能有特殊符号，要把 \ / : * ? < > | 以及 换行符删掉。 每次按照同样的习惯设置文件名，可以防止重复下载。
2. 不同主题存入不同文件夹。文件夹的题目要简短，如：PD，LTP,PKC，NO。
3. 看过的文献归入子文件夹，最起码要把有用的和没用的分开。
4. 重要文献根据重要程度在文件名前加001,002，003 编号，然后按名称排列图标，最重要的文献就排在最前了。
5. 复印或打印的文献，用打孔器（￥10-15）打孔，装入硬质文件夹（￥10-20/个）。
我们经常会在参考文献的引用上耍一些小聪明，殊不知这些都会降低论文质量。
1. 知而不引。明明借鉴了同行的类似工作，却故意不引用同行的类似工作，使自己工作看上去"新颖""领先"。实际上审稿的可能就是同行。
2. 断章取义。故意截取作者试图否定的部分来烘托自己的观点。
3 引而不确。没有认真看原文，引文错漏。
4. 来源不实。某些字句来源不可靠(比如非正式的或非学术的出版物)，且不注明来源。常见于一些统计数字。
5. 盲目自引。不是为了说明自己的工作与前期工作之间的关系，而是单纯为提高自己文章被引用次数而自引。
怎样读文献
1. 目标：漫无目的则毫无效率，抓不住重点才效率低下。选题之前可能会有一段时间处于迷茫状态，不知从哪入手。胡乱看了大量文献，却不知所以然。在导师的指导下，在同行的启发下，有些人可以迅速明确目标，有的放矢，入门就从这里开始
2. 层次：对于一个具体的课题来说，相关文献分属于三个层次：研究方向、研究领域、研究课题。
看文献时要分清手上的文献是属于那个层次，这决定你对它要掌握到什么程度。
研究方向层次的文献：一般涉及，基础知识，学科水准，了解当前重大进展与趋势，达到专业人员水平；
研究领域层次的文献：了解焦点与热点，已/正/将进行的课题，达到专家水平；
研究课题层次的文献：要全面，了解历史、现状、展望、主要方法、手段，达到No1专家水平。正确分辨文章的层次，才能把精力用到点子上。
3. 形式：广义的文献包括可以阅读的所有出版形式。教科书、专著、会议摘要汇编、期刊、网页、甚至ppt文件。比如要了解免疫应答的基本形式，最好是看教科书；要参考大鼠脑立体定位图谱，最好是看专著；要知道最新进展，最好是查阅期刊；要了解别人的研究动向，最好是参会或看会议论文汇编。不要找错信息源。
4. 程度：对文献的熟悉程度不同，阅读文献的方式大不相同。新手学习式阅读，逐字逐句，搞清细节，掌握最基本的知识点。
5. 矛盾：文献读的多了，脑子里塞满了信息，反而无所适从。为了解决这个问题，循证医学划分临床试验证据的等级；
同理，我们看文献也要重视实验证据的强度。发现矛盾，是第一步；找出异同，是第二步；思考解决，是第三步。从相互矛盾的结论推导中发现矛盾的根源，此时如能跳出圈外，不走思维定势，从原始的科学问题出发，"无招胜有招"，真正是到达另外一种境界了。
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