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科研工具

565条记录

  • 491.让火山图躺下来:倾斜45°的火山图

    [摘要]:读文章时发现了这样一个火山图:火山图的基本做法我们之前已经讲过了(转录组不求人系列(十):NCS级别的火山图,总有一款适合你!),看看上图这篇Cell文章的火山图,它居然是倾斜的,其实很多NCS的文章在火山图的可视化上都采用这样的模式。接下来我们就学习下如何制作吧!画这种火山图需要的数据还是差异分析结果,但是需要两列数据,两个分组的平均表达量。之前用DESeq分析差异基因的时候(转录组不求人系列(... [发表时间:2022/3/24 10:03:31]

  • 492.使用AutoDock CrankPep进行蛋白-多肽对接

    [摘要]:文章来源:叮当学术。蛋白-多肽相互作用涉及许多细胞生理和病理过程,大多数治疗性多肽因其具有高生物活性和低毒性而广受制药业青睐。ADCP全称为AutoDockCrankPep,是一个专门用于对接多肽的AutoDock对接引擎。它结合了蛋白质折叠技术以及刚性受体的有效形式作为亲合力计算基础,在受体的能量景观的背景下进行多肽折叠的运算。ADCP采用蒙特卡罗方法对多肽的折叠进行计算,同时优化多肽和受体分子... [发表时间:2022/3/23 17:15:55]

  • 493.PPT绘制Janus粒子组装,比3D软件快!

    [摘要]:大家好,好久不见,我是威少!今天分享用PPT绘制Janus粒子的组装模型,绘制过程比其他3D软件建模更加简单,效果图如下:详细步骤1.插入直径2.5的圆,去除边框,填充设置为渐变填充,类型线性,角度为0,保留两个渐变光圈,分别设置为黄色和蓝色,位置都位于50%。再复制出三个圆,将其渐变角度分别更改为90、180、270,再按如图所示位置摆放,并将四个圆组合(Ctrl+g)。2.选择组合的圆,点击O... [发表时间:2022/3/23 17:02:58]

  • 494.轻松解决Mac上「应用程序“xxx”不能打开」的问题

    [摘要]:我们很多时候会在互联网上下载Mac软件,在安装和打开的时候会遇到各种问题,例如出现的这个弹窗「应用程序“xxx”不能打开」的问题。乍一看是这个应用程序有问题,其实不是。这个问题出现的主要原因是应用程序的文件权限有问题,没有可执行权限导致的。选中软件右击,点击「显示包内容」,会跳转到此软件的源文件目录。然后依次进入「Contents」-「MacOS」,会看到APP的执行文件,由于在解压的时候权限分配... [发表时间:2022/3/23 16:37:31]

  • 495.康复科研人必会的科研绘图工具!Origin系列1:软件获取和安装

    [摘要]:说到科研绘图工具,大家最熟悉的是GraphPadPrime,它的功能是不错,师兄师姐口口相传的科研小白入门必备工具。工具虽好,但最近也听说出了一些不友好的事情:全英文界面,对于英文较差的同学是个难点;收费,网上已有很多破解版,但考虑到维护正版版权问题,据说有很多外国期刊在看到文章中使用该软件时需要提供注册号,这导致很多使用绿色版的同仁稿件被拒。这怎么办啊?Excel做出来的图没有那么好看,还能用什... [发表时间:2022/3/23 16:30:24]

  • 496.再谈Meta分析的注册问题

    [摘要]:“护”说科研笔者最近在单位闭环,荒废了不少 今天再聊聊Meta分析的注册问题 大家都知道,发表Meta分析的第一步是注册,当前支持注册Meta分析的平台有三个(公众号前期也介绍过系统评价和Meta分析的注册):①Cochrane②PROSPERO③INPLASY 第一个比较难,有能力的朋友可以试试;第二个是全球通用的,也是公认的Meta分析注册平台;第三个,可能很多人比较陌生,因为它是前几年刚出来... [发表时间:2022/3/23 16:23:03]

  • 497.算伴网——全新的生物医药计算体验

    [摘要]:数据科学的发展为生物医药研究提供了强大的动力,网络平台和工具软件的使用已经成为科研人员不可或缺的技能之一。然而面对纷乱复杂的平台工具,往往让人无所适从,难以快速选出最给力的科研神器。如何了解工具软件的权威性和上手难易度,如何保证在第一时间获知最新上线的信息平台,科研人员亟需一个“收纳平台的平台,管理工具的工具”!为此,唯信团队耗时两年,为生物医药领域的计算爱好者倾情打造“算伴网”(scibank.... [发表时间:2022/3/23 15:23:09]

  • 498.ABAQUS本构调整及常见问题解决办法

    [摘要]:最近有很多小伙伴询问:自己模拟的结果与试验结果不吻合是哪里的问题,该怎么调整?其实大多数情况下还是混凝土本构、钢筋本构、网格划分的问题,那么我将较为常见的几个的问题例举出来并给出相应的解决办法。(以下为自己学习时的一些经验,不一定正确,希望大家保持思考判别的意识,多去尝试,才能找到其变化的规律)   问题一:模拟的滞回曲线没有下降段 该问题的原因主要是输入的混凝土应力应变参数问题。在abaqus中... [发表时间:2022/3/23 14:35:05]

  • 499.学术科研期刊文献下载翻译写作好用的书签与毕业工作感想

    [摘要]:老司机毕业快一年多了,没有深造博士,也没有继续搞科研,更没有从事化学材料大类相关工作了。出来社会后,都会发现这一大类的行业并不吃香[希望只是我个人经历]。(或许大家会继续读博出国等等回来高校做老师,那肯定是另外一种待遇,希望你能够坚持。)或许你是准备毕业的研三,还是瞻望着的研二,还是刚刚挑着理想的研一。假若你们不嫌弃,在这宝地分享一下我毕业和工作的一些感想经历一些愚见。或许是正能量,或许是负能量,... [发表时间:2022/3/23 14:16:51]

  • 500.十分钟学会用PPT绘制脂质双分子层

    [摘要]:—关键词PPT绘图脂质双分子层在细胞信号通路模式图中,常常涉及到细胞脂质双分子层的绘制,如何简单快速地绘制出脂质双分子层呢?今天,我们就简单介绍下如何在PPT中绘制脂质双分子层。首先,我们需要在PPT中绘制一个圆形,打开PPT,选择插入,形状找到椭圆图形,画出一个椭圆,如下图接下来,点击选中椭圆,在格式中调整椭圆参数,这里以0.3厘米为例接下来对图形颜色进行填充,可以选择自己感兴趣的颜色选择合适的... [发表时间:2022/3/23 14:05:20]

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