JIA | 西北农林科技大学园艺学院王西平教授团队QTL-seq分析揭示葡萄无核分子研究新思路
2022/10/18 16:10:12 阅读:141 发布者:
无核是当前鲜食葡萄生产和消费的重要发展趋势和育种方向,葡萄无核性状成因复杂,涉及多个生物学过程,种子发育过程中胚、胚乳及种皮任何一个环节异常都会形成无核葡萄,调控通路多样。目前葡萄无核相关研究日益增多,然而葡萄无核关键基因及分子机制仍不够明晰。
近期,西北农林科技大学园艺学院王西平教授团队完成的题为“QTL-seq analysis of the seed size trait in grape provides new molecular insights on seedlessness”的研究论文在Journal of Integrative Agriculture (《农业科学学报》(英文),JIA) 2022年10期正式发表。
该研究通过对有核葡萄‘红地球’、无核葡萄‘森田尼无核’及二者杂交后代进行基因组重测序,鉴定非同义突变SNP并结合已发表转录组数据开展联合分析。发现非同义突变SNP发生在蛋白激酶、转录因子、细胞色素P450等与种子发育相关基因上,且这些基因在有核和无核葡萄胚珠发育过程中差异表达,参与激素平衡、种皮和胚乳发育、繁殖性器官发育、氧化还原、衰老及细胞死亡等生物学过程。基于SNP-index分析,鉴定到一个潜在的种子大小性状相关QTL区域,并进一步开展SNaPshot分析在葡萄子代群体内进行验证。本研究从基因组水平上揭示了有核、无核葡萄子代胚珠发育差异,为后续基因功能研究和葡萄分子育种提供宝贵资源。
河北农业大学园艺学院王莉讲师和西北农林科技大学园艺学院张松霖博士为论文共同第一作者,王西平教授为通讯作者。该研究受到了国家联合基金 (U1603234)、陕西省葡萄种质创新团队 (2013KCT-25)、中央高校基本科研业务费专项资金 (Z109021571、2452019170)、河北省青年科学基金 (C2021204146) 和河北省教育厅青年基金 (QN2020232) 的支持。
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https://doi.org/10.1016/j.jia.2022.07.047
转自:“植物生物技术Pbj”微信公众号
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