New Phytol.|基于多组学框架揭示草莓风味基因及其调控元件

风味是影响消费者偏好的关键因子并且是植物育种计划中日益关注的焦点。在水果作物中，识别控制挥发性有机化合物合成的关键基因对加速风味改善具有重要意义，但许多物种的多倍体和杂合性阻碍了风味改良进程。

近日，美国佛罗里达大学的研究人员在八倍体栽培草莓进行了基因组、转录组和代谢组研究，并通过多组学手段揭示了控制草莓风味的关键基因及其调控元件。研究成果以题为A multi-omics framework reveals strawberry flavor genes and their regulatory elements发表在New Phytologist上。

在该研究中，研究人员生成了多组学数据集，包括196 个不同育种系的表达数量性状基因座 (eQTL) 图、高风味育种选择的单倍型阶段基因组、五种单倍型的全基因组结构变异图以及305个草莓个体的挥发物全基因组关联研究（GWAS）。此外，研究人员还发现叠加调控元件、结构变异和 GWAS 分析将众多基因的等位基因特异性表达与对风味很重要的挥发性化合物的变异联系起来。此外，该研究认为，通过结合草莓中的多种组学数据，可以发现影响风味的基因的自然变并有利于优异风味的育种工作。比如，研究人员基于组学数据推测邻氨基苯甲酸合成酶 α 亚基 1 在邻氨基苯甲酸甲酯生物合成中发挥重要作用并通过水果瞬时基因表达得到进一步印证。该研究结果展示了在水果作物中发现风味基因的框架，以及对具有复杂和理想风味的品种进行分子育种的途径。 

原文链接：https://nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/nph.18416

转自：植物科学SCI

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