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东北农业大学陈庆山课题组染色体片段代换系分析挖掘大豆根瘤数相关候选基因的研究

2022/8/11 14:10:17  阅读:161 发布者:

大豆是世界上重要的粮食作物,与其它豆科植物相似,大豆可以与根瘤菌共生。大豆与根瘤菌共生固氮对于发展可持续农业至关重要。Ⅲ型效应因子是形成共生的重要调控子,结瘤数目是表明根瘤菌侵染状况的重要特征。然而,在与结瘤相关的数量性状位点上编码Ⅲ型效应因子的基因却很少被发现。

近期,东北农业大学陈庆山教授课题组完成的题为 Characterization of chromosome segment substitution lines reveals candidate genes associated with the nodule number in soybean的研究论文Journal of Integrative Agriculture (《农业科学学报》(英文), JIA) 20228期正式发表。

该研究对大豆根瘤数量相关位点进行了鉴定;确定了候选基因中的差异表达基因;鉴定出与结瘤性状相关的4个候选基因,为大豆结瘤相关基因的深入研究奠定基础。

该研究以染色体片段代换系(CSSL)为材料,对大豆根瘤数量相关QTL进行了鉴定。通过检测SNP标记和QTL区间内候选基因,确定其中的差异表达基因。鉴定得到与SNP相关的4个候选基因GmCDPK28GmNAC1GmbHLHGmERF5与结瘤性状及共生建立关键过程和途径相关。编码转录因子的候选基因GmERF5可能与型效应因子NopAA直接互作。研究结果为进一步研究共生关系建立必须的遗传网络及信号通路中涉及的型效应因子提供了宝贵的资源。

东北农业大学农学院陈庆山教授团队的邹佳男副教授为该文章的第一作者,辛大伟研究员、王锦辉博士为该文章的通讯作者。该研究得到了中国国家自然科学基金项目(320702743207201431971899)、中国博士后科学基金(2020M681072)、中青年科学技术创新领军人才项目(2018RA2172)资助。

点击链接阅读全文:https://doi.org/10.1016/S2095-‍3119(21)63658-4

转自:植物科学最前沿

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