论文的署名是一个很重要的问题。署名一则是分享成果的荣誉，二则是一种责任。往往涉及到名利的事情处理不好是很容易产生误会、误解或矛盾的。看起来似乎很简单的署名问题，实际操作起来有些时候也是很难的。
学术论文应该如何署名呢？所有署名的作者都要对论文负责。署名作者是那些对论文做出实质性贡献的人。一般实验的实施者和执笔者为第一作者。一般实验的设计者(指导者）等（如导师或科研团队（课题）的领队）可为通讯作者。
我们知道，当今的科学研究已经不再是一个人单枪匹马的时代了，大的科研项目如脑的研究、人类基因组学、全球气候变化的研究等，需要科学家之间、学术团体之间、国内外科学家之间的合作才能完成。这样一篇论文的署名人数也越来越多，一些国际合作研究项目，论文的署名人数有几十人甚至几百人已经不是新鲜事情了。那么署名如何排序呢？
署名原则
以实验生物学为例。作为论文署名的人员应该是在实验设计、数据收集、数据分析和论文写作等全过程中做出了实质性（或主要）贡献的人。
按照惯例，一般作为实验的实施者，又是论文的执笔者，自然应该是论文的第一作者，如研究生、博士后、一些年轻学者等。导师或者项目（课题、实验）的设计者，对论文的主体主要负责的人一般作为通讯作者，列在排名的最后一位。
往往论文作者的最后一位往往是实验室的负责人。第一和最后一位作者之间的作者排序可以根据对论文的实际贡献大小进行。论文的作者应该做到能够对论文的细节和主要结论熟悉并同意发表，并能够回答读者等对论文的相关问题和质疑。由于有些时候，对一篇论文的贡献大小是很难定量化的，所以最好是在实验开始前，就讨论好论文作者的署名顺序。如果能早些讲清楚署名的原则和相关安排，以后就不会产生一些不必要的纠纷。
对于一些重要的论文，有多个作者做出的贡献是等价的，可以作为联合第一作者处理，但是作为联合通讯作者的比较少见。那些对实验过程做出了贡献（如实验员、动物饲养员等）但没有达到作为作者的程度、在论文的写作过程中提供一般性帮助（如协助查阅文献、分析数据）时，在论文中必须进行致谢。
有些特殊情况也是需要考虑的，如有些提供了某项研究的重要学术思想和设计思路的；有些提供了实验中不可缺少的实验材料；有些提供了研究中必须的重要实验设备；等等类似情况，如果当事者（方）提出要作为论文作者署名，是可以考虑的。当然有些是在实验开始前就已经讨论决定了的，就没有这些麻烦了。
作者的责任
必须强调的是在论文上署名的作者除了分享成果的荣誉外，重要的是要对论文成果的真实性等方面负有责任。如果在论文中没有特别的分工说明，发表的论文的一旦出现了问题，如出现数据不实、剽窃、抄袭等学术不端行为时，所有作者都要承担相关责任。
现在有些刊物在发表前让作者签名，说明阅读过并同意发表论文中的数据和结论，有些刊物是规定通讯作者可以代表所有作者。还有些刊物要求明确说明每个作者的责任和贡献，如谁收集的数据；谁设计的实验，谁实施的实验；谁参与讨论，谁进行数据分析；谁执笔等。
之前Nature上刊登诺贝尔奖得主Linda B. Buck和共同作者发表的声明，撤销了他们2001年发表在Nature上的一篇论文，声明中说：“他们发现2001年的论文数据和原始数据间有矛盾。”文章注明了每个作者的贡献，原文是这样的：Author Contributions（作者贡献）：L.B.B. and L.F.H. ,conceived the project（获得项目）, L.F.H. and J.-P.M.prepared gene-targeting constructs to generate the mice （准备所必须的实验材料）, S.S. trained Z.Z. in gene-targeting techniques （负责技术培训）, Z.Z. prepared and analysed the mice and provided all figures and data for the paper（实施实验、获得数据、提供数据和图表）, and L.B.B. and Z.Z. wrote the paper （执笔写作）. Correspondence and requests for materials should be addressed to L.B.B （通讯作者是Linda B. Buck）。
不规范署名
现阶段在国内也确实存在着论文署名不规范问题，有些是属于不知道规矩，有些则是其他原因：
1、随便挂名：不管对论文有无贡献，只要是一个实验室的，一个研究集体的成员，每个成员几乎在每篇论文上都署名。这样可以增加每个人员发表论文的数量。
2、领导挂名：有时候有些研究人员为了“巴结”某些领导或掌握资源的官员，在某些论文上署上领导的大名。也有些时候是相关领导暗示或主动要求挂名。
3、名人被借“光”挂名：有时候有些学者为了论文审稿或发表顺利，没有征求当事人的同意，就强行将一些学问高的学者（如院士等）的名字挂上（有些可能是自己的导师等）。
4、为了职称晋升而挂名：有些人为了评职称急需，而在没有任何贡献的论文上挂名。
5、强求挂名：有些项目负责人或实验室领导强求在实验室的所有论文上署上自己的名字。
6、为了某种目的而收买挂名：如学校评估、博士点申请等急需高质量的论文，利用金钱收买，在论文上署名。
7、为了毕业和学位而挂名：有些学生为了满足单位的获得学位的要求，急于毕业获得学位，在自己没有贡献的文章上挂名。
提醒导师和研究生需要注意的事情
由于某些利益目的（如考核等），有些研究生将自己硕士期间的工作，以读博士学位的单位名义发表；或者署上自己的博士导师的名字；或者论文中没有自己硕士导师的名字等等，这是非常错误的，每位导师和研究生都必须严肃对待这些事情。首先论文（成果）的产权归原单位（获得项目支持的单位）。硕士生要尊重自己导师的劳动，不能太“势力眼”。同理，博士生毕业后，博士期间的所有数据都必须以原单位的名义发表，博士生导师应该作为作者之一（如果导师负责的话，一般应该是通讯作者），原单位必须是第一产权单位。
“多栖教授”问题
当今一篇论文挂很多单位的多问题，一则是由于兼职的、“两栖”的教授学者太多；再则是由于现实的利益关系。看看某些所谓我国“独立创新”的高质量论文，实则是在国外的实验室做的结果，由于自己在国内某个单位兼职（讲座教授之类的），这位学者的名字上会有两个甚至多个单位。还有一些学者纯粹是为了增加论文数量，在与自己的专业毫无关系的论文上挂名。国内的“多栖教授”的论文署名情况也是这样的。
研究生需明白成果的归属问题
如果你从事的研究课题项目、学术思想和实验总体设计都是导师或者实验室负责人完成（或负责完成的），不管这个成果有多大多重要，即使是获得诺贝尔奖的成果，成果应该归属于这个实验室，属于你的导师或项目负责人。当然，研究生所做出的贡献是不可埋没的。
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