当选定了拟投期刊和论文的最后一稿准备好后，就可向SCI期刊投稿了。
一、准备投稿信
SCI期刊的编辑往往需要一些有关作者及其论文的信息，而作者也希望给编辑提供一些有助于其全文送审及决策的信息。这些信息都应该包括在投稿信（covering letter）中。投稿信应包括以下几个方面的内容。
（1）论文的题目和所有作者的姓名及地址。
（2）论文的类型（letter，regular paper，special section paper，review，tutorial or communication）.
（3）论文的意义或新意（What issues led to this work？What gap is being filled？What is the broader context for this work？What is new here？To our knowledge，this is the first report showing….）.
（4）声明文稿权转让。
（5）无一稿多投（This manuscript has not been previously published and is not currently in press，under review，or being considered for publication by another journal）.
（6）所有列出作者均对文稿有确切贡献。
（7）文稿内容真实，无伪造。
（8）所有作者均已阅读文稿，且同意送稿（All authors have read and approved the manuscript being submitted，and agree to its submitted to this journal）。
（9）建议审稿人及因存在竞争关系而不宜做审稿人的名单。
（10）通讯作者（corresponding author）的姓名、详细地址、电话和传真号码、Email地址。
（11）通迅作者签名。
Science对投稿信要求更多：
·The title of the paper and a statement of its main point. · Any information needed to ensure a fair review process.
·Names of colleagues who have reviewed the paper.
·Also required for submission are the following：Names，telephone，and Email addresses for all authors.
·A statement that none of the material has been published or is under consideration elsewhere，including the Internet.
·Names，affiliations and Email addresses of five potential references.
·For investigations on humans，a statement indicating that informed consent was obtained after the nature and possible consequences of the studies were explained.
·For authors using experimental animals，a statement that the animals' care was in accordance with institutional guidelines.
·Copies of any paper by you or your coauthors that is in press or under consideration elsewhere that relates to the work submitted to Science，or of any paper that is cited in your paper as in press.These materials should be sent as attached PDF files in an email to science_editors@aaas.org.
·Written permission from any author who is not an author of your manuscript hut whose work is cited as a personal communication or in press.Permission must allow distribution of in press manuscripts or relevant data to reviewers or any interested reader upon publication.
许多论文因SCI期刊编辑部找不到合适的审稿人（Reviewer），致使稿件一拖再拖。提供审稿人名单和详细通讯地址，会加快审稿速度。此外，找到的审稿人也可能因不熟悉该研究方向，而低估稿件的意义而被退稿。因此，在投稿的同时，提供一些熟悉论文内容的审稿人是必要的。提供审稿人要尽可能熟悉该稿件所做的工作。审稿人可以在文章末尾的参考文献中找，也可以推荐你所熟悉的相同领域专家。
二、阅读投稿须知
从相应SCI期刊网站的homepage下载Instruction for Author，并且按照要求准备好原稿的所有文件，如投稿份数、论文格式、长度、图表、参考文献格式、配图说明等，逐条遵循。一般SCI论文可分为回顾性文章（review article）、普通论文（regular/research article）、快讯（short communication）等。不同的论文类型，对原稿的格式要求也有所变化。不同的学科，正文的内容和形式会有所增减；图表、公式的数量也会有所不同。此外，不但原稿的内容要符合SCI期刊的要求，而且在字数、页数、格式、文件储存形式等方面，均需与投稿的SCI期刊的要求一致。否则，论文在初选阶段会很快落选。
三、投稿前询问
在将论文全文投稿前，研究人员也许可以从Science、Nature等编辑处获得非正式的反馈信息。这种服务的目的是节省时间——如果编辑认为论文不适合发表，可以将论文及时投到其他期刊，而不被耽误。如果希望使用投稿前询问服务，选择期刊的在线系统发送一段话，解释论文的重要性，以及论文的摘要或概述段和相关的引用目录，以便编辑能够将投稿与其他相关工作进行对比判断。编辑也许会很快邀请你递交完整的论文（这并不意味着发表的任何承诺），或许告诉你这篇论文不适合在该期刊发表。如果接到的是否定的回应，请不要回复。如果你确信自己论文的重要性，那就不要在乎编辑的疑惑，你可以通过期刊的在线投稿系统递交论文的全文。编辑会对你的工作做更详尽的评估。
四、向SCI期刊投稿的方式
科技论文作者SCI期刊投稿的方式有三种。
（1）邮寄形式。邮寄形式，即通过国际快件或航空将论文的原稿邮寄给期刊的主编或编辑部。
1）稿件包装：一般应按以下顺序备齐资料。
·投稿信。
·论文稿拷贝份数。以打印稿（hard copy）投稿。
·版权转让声明（可以在论文接受后追加）。
以上材料不要用订书钉固定，以免途中因订书钉移动而损坏稿件；但可以用大型曲别针固定，照片可以在信封中夹硬纸片保护。
2）稿件邮寄。邮寄稿件应注意：正确的投稿地址及收稿人。有的SCI期刊在“投稿须知”中特别指出投稿地址与订刊或订单行本地址不一样，以免造成时间耽搁。
邮寄稿件形式曾经是SCI论文投稿的近乎唯一的方式，现在采用这种方式接受来稿的SCI期刊越来越少了。
（2）电子邮件形式。电子邮件形式，即作者将SCI论文Email给编辑部。现在有许多SCI期刊已经告别了邮寄和电子邮件的时代，开始只受理网上投稿。某些期刊仅允许一些没有图表的短文、特邀论文（review、book chapter）或“给编辑的信”通过Email投稿。几乎所有的SCI期刊均不接受Fax投稿。
（3）网上投稿。网上投稿（online submission）方式速度更快，而且稿件不会丢失。目前网上投稿是主要投稿方式。网上投稿常需要作者在线（Online）注册。一旦作者在网上登记注册投稿，每个主要步骤都有记录，很受SCI期刊作者的欢迎。
五、网上投稿
（1）网上注册（online registration），也称为作者注册。注册时要把自己的姓名、单位、联系地址，包括电话、传真和电子邮箱等登记得准确无误。注册成功后，作者会收到E-mail回执。
（2）按部就班地输入论文的各个主要部分，如题目、作者、摘要、关键词、正文、图表等。在输入每个部分的时候，要通读该部分的有关要求，再次确认自己输入的文件是否符合要求。这听起来并不难，但实际上作者在这方面的疏忽却很多。
（3）确认每个部分输入的完整性。有些作者在输入文件时过于匆忙，10个图只输入一半，这样的稿件即使到了编辑部也不能送审，只能返回作者补漏。如果审校员一时疏忽或主编没有察觉，将有缺欠的文章发出送审，则审稿人因为缺图，不能正常审阅文章。这样造成的麻烦所耽误的时间会更多。
（4）输入文件完毕后，也就是所有的部分成功输入后，不要忘了点击投稿发送键（【Sending】或【Submitting】）。否则，稿件只会存储在作者自己的文件夹中，而不是发到编辑部的文件夹里。论文提交成功后，作者会收到Email回执。
同时，网上会自动生成论文提交成功后的信息。打印保存。
目前，许多SCI期刊网上投稿，需把文件由一种存储形式转换到另一种存储形式，如Word文件变成PDF文件。在这个转换过程中，计算机屏幕上会呈停滞状态，看上去好像死机了。其实不然，只需耐心等待。如果有问题，屏幕上则会出现问题预警或解决问题的提示。如果作者不能自行解决故障或问题反复出现，作者可与出版社在线投稿支持系统的相关部门（online submission support team）联系，求得帮助。此外值得一提的是，部分著名出版社的网页上除附有投稿须知外，还专门设计了针对网上投稿的指导示范文件（tuition program）。总之，网上投稿并不难，关键是准备充分，而且在实际上机操作时按部就班，不能单纯求快，否则欲速则不达。
网上投稿后，编辑部还会给你一个正式的回执和稿件编号。稿件编号可用于稿件追踪（follow-up）。因此，要保存好。
有些期刊（如Nature）收到投稿时，除了会提供一个编号还会安排一位编辑，这位编辑负责阅读论文，征询科学顾问和编辑部同事的非正式建议，并将你的投稿与本领域最近所发表的其他论文进行比较。如果论文看起来新颖、引人注目，所描述的工作很直接又有深远的意义，那么编辑会将论文送出去作同行评审，通常会送给两个或三个独立的专家。然而，因为期刊只能在某一领域或次领域发表极少数的论文，因此许多论文未经同行评审就被拒绝，即使这些论文描述的可能是可靠的科学结果。
六、网上投稿常见问题
网上投稿通常快速并相对容易。然而，如果作者疏忽遵守期刊的要求，可能延迟或停止发送审稿过程（the submission and peer-review process）。网上投稿常见问题有以下几个。
（1）论文字数超过规定的要求。例如，按要求，原稿不能超过3000字，可有的原稿长达3200字，甚至更多。
（2）图不规范。
·递交图文件（figure file）方式不正确。多数SCI期刊要求每单独图作为一个单独文件递交，而不是把所有的图合成为一个文件再递交。
·图的分辨率太低。应该用高分辨率的图（300 dots per inch）。
·图的格式（format）不对。常用图的指定格式为GIF、JPEG、TIFF。不要用非指定格式，如PDF、WBMP、Word、RLE和PowerPoint。
·没有图解（figure legend）。
（3）没有递交“a conflict of interest disclosure”（利益冲突披露）。有些SCI期刊要求作者在投稿的同时，要递交“a conflict of interest disclosure”。
（4）缺首页（Title page）。
（5）缺摘要。
（6）缺投稿信。
（7）动物和人体实验没有被伦理委员会批准。
（8）论文的格式不符合所投SCI期刊的要求。
七、常见问题
问题1：在Wiley投一篇文章，上传的时候一直上传不上去，不知道出现什么错误。好不容易上传上去，确认PDF格式的时候发现生成的PDF中图片不显示，排版出现了很大的变化。可是自己生成的PDF是对的。这是什么原因呢？怎么解决？
原因：网速的问题。
问题2：论文提交（submitted）已经2个月了，可是网上状态一直都是submitted，那是这是怎么回事？
原因：稿件正在审理，有时候出版社处理稿件比较慢。
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