科研工具社会实践

241.干货|多功能的免费科研图片处理工具：Image J

[摘要]：ImageJ是由NationalInstitutesofHealth（NIH）开发的基于java的免费开源软件，用于处理和分析图像。在生物及医学图像分析中起着非常重要的作用。很多科研人员都是用它来处理数据的。但很不幸的是，这款软件对于小白来说，并不容易上手。想想还有大量的图像要分析，so不学也得学。先从软件安装开始，下载地址直接百度ImageJ进官网，点击Downloads，进入界面选择你需要的版... [发表时间：2022/5/27 10:33:45]
242.PyMOL绘图简明教程--常用命令速查手册

[摘要]：PyMOL是一个分子三维结构显示软件，适用于创作高品质的小分子或是生物大分子（特别是蛋白质）的三维结构图像。在前面的推文中，一木为大家分享了PyMOL使用的一些基本操作和使用技巧，也分享了一些常用命令。本期内容为大家分享PyMOL使用过程中的常用命令速查手册，可以满足日常的绘图需求。内容根据官网提供的“PyMOLReferenceCard”即“PyMOL参考卡片”整理，需要英文原版的可自行在官网下... [发表时间：2022/5/27 10:29:21]
243.找不到国内外文献？这二十个方法亲测有效！

[摘要]：01如何查询国内学位论文？如何获取全文？目前可查询国内学位论文文摘的数据库包括：国家科技图书文献中心的中文学位论文数据库（免费-文摘）：http://www.nstl.gov.cn/NSTL/CALIS高校学位论文库（免费-文摘）：http://opac.calis.edu.cn中国优秀博硕士学位论文全文数据库（文摘免费，全文收费）：http://epub.cnki.net/kns/brief/r... [发表时间：2022/5/27 10:02:32]
244.Grammarly—如何通过设置写作目标来调整学术写作的专业程度

[摘要]：Grammarly免费版本可以帮助英文习作用户迅速修改文章中基本的“拼写错误”，“标点符号”以及简单的“语法问题”。但正式的英文学术写作要求中“简明易懂，直截了当”，“正式且严肃”，“自信准确地使用学术性语言表达”，英文学术写作用户需要了解如何使用Grammarly高级版本调整写作目标“Goals-Adjustgoals”（写作目标）和设置写作风格“WritingStyles”（写作风格）设置以获... [发表时间：2022/5/27 9:36:05]
245.第十二讲 R-配对样本t检验

[摘要]：在过去的几天里，我们分别介绍了单样本的t检验、单样本的Wilcoxon检验和两独立样本的t检验及两独立样本的Wilcoxon检验（点击文字可跳转）。今天，我们继续前面的话题，介绍用于两个配对样本的统计学检验方法。符合正态分布的配对样本，我们可以使用配对样本t检验。配对样本t检验配对样本t检验用于样品的两个相关组之间的比较手段。在这种情况下，同一样本有两个值（即一对值）。举个例子，在1个月内有20只... [发表时间：2022/5/27 8:43:19]
246.Zotero效率插件，实现文献引用、书目、笔记等多项功能，附下载！

[摘要]：笔者之前介绍了Zotero如何联动Obsidian，详情请看文献管理Zotero拾取文献数据，写文献综述效率高，可联动OB，这个过程需要用到Obsidian插件Citations和Zotero插件BetterBibTeX。后来，笔者介绍了一款Zotero的第三方插件MDnotes，可以导出PDF的元数据和笔记为markdown文件，为Obsidian所用。这个方法比Obsidian插件Citati... [发表时间：2022/5/27 8:41:57]
247.单细胞多组学联合分析转录因子？百搭的宝藏数据库推荐给你！

[摘要]：GRNdb数据库基于scRNA-seq和bulkRNA-seq的TF-target表达调控关系数据库嗨，小伙伴们大家好啊！转录因子（TFs）及其下游靶基因形成的基因调控网络（Generegulatorynetworks，GRNs）在基因表达调控中扮演重要角色，新的一周我们来学习GRNdb数据库，提供基于scRNA-seq和bulkRNA-seq的基因调控网略及共表达信息，帮助小伙伴们更方便进行基因... [发表时间：2022/5/26 10:14:26]
248.Deeplung:深度学习项目笔记（二）——医学影像学dicom,mhd及raw文件读取与可视化

[摘要]：医学影像学医学影像是指为了医疗或医学研究，对人体或人体某部份，以非侵入方式取得内部组织影像的技术与处理过程。dicom文件相关1.1什么是dicom图像DICOM（DigitalImagingandCommunicationsinMedicine）即医学数字成像和通信，是医学图像和相关信息的国际标准。其是目前应用最为广泛的医学影像格式，常见的CT,核磁共振，心血管成像等大多采用的是docim格式的... [发表时间：2022/5/26 9:44:42]
249.语义分割（Semantic Segmentation）方法

[摘要]：1.什么是语义分割语义分割是当今计算机视觉领域的关键问题之一。从宏观上看，语义分割是一项高层次的任务，为实现场景的完整理解铺平了道路。场景理解作为一个核心的计算机视觉问题，其重要性在于越来越多的应用程序通过从图像中推断知识来提供营养。其中一些应用包括自动驾驶汽车、人机交互、虚拟现实等，近年来随着深度学习的普及，许多语义分割问题正在采用深层次的结构来解决，最常见的是卷积神经网络，在精度上大大超过了其... [发表时间：2022/5/26 9:43:20]
250.PubMed-文献检索神器，你真的会用嘛？（数据库分享一）

[摘要]：一个科研小白开始做科研完成一篇论文，那么他大致需要先经历以下几个阶段：查文献选题：具有充分临床意义的课题（选别人没有做过的边角想法）查文献做题：标准的分析流程、统计学方法（依葫芦画瓢）查文献写题：学习别人精炼的词句（改改主语宾语）借用组里师兄师姐们的话讲就是：“从文献中来到文献中去”，“文献是最好的老师~”换句话总结起来就是：查文献，查文献，还是查文献。可见查文献和会查文献的重要性。而一说到查文献... [发表时间：2022/5/26 9:09:35]

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