科研工具社会实践

211.数次登上Nature封面，论科研绘图我只服他！

[摘要]：ApacheECharts是一个直观生动，支持数据交互定制的Web数据可视化图表网站，从数据到导出都是基于网页端展示非常方便！ApacheECharts功能介绍01、丰富的可视化类型ECharts提供了常规的折线图、柱状图、散点图、饼图、K线图，用于统计的盒形图，用于地理数据可视化的地图、热力图、线图，用于关系数据可视化的关系图、treemap、旭日图，多维数据可视化的平行坐标，还有用于BI的漏斗... [发表时间：2022/6/6 9:14:23]
212.如何“白嫖”高大上的单细胞分析

[摘要]：自2019年被Nature期刊评为最值得期待的生物技术之一以来，单细胞测序技术一直被认为是文章和课题中的高端技术。谁都想自己的课题里能有单细胞分析的图。但自己样本测序价格又很贵，用公开的单细胞测序数据吧，又不会代码...科研者之家家族的临床生信之家，近日上线了单细胞可视化分析工具，全程零代码，鼠标点点点就可以实现“高大上，公司动则大几千”的单细胞分析。首先进入到官网www.aclbi.com，首页... [发表时间：2022/6/6 9:09:50]
213.查文献，你不会只用Pubmed吧？

[摘要]：导师交代了一个新课题，要你查下K562细胞可以用哪些培养液培养？最常用哪种？要求在5分钟内搞定。懵逼了吧？你还会去pubmed搜么？实际，直接用AI写作助手就可以了，虽然他被定为成写作神器，但收录的都是已经发表的文献里的语料，所以完全可以用于查文献。根据命题，培养液啊之类的信息都属于文章方法学部分，所以左侧直接选择Methods部分，检索内容输入“K562medium”,你就可以一键检索到在线SC... [发表时间：2022/6/6 9:08:31]
214.关于“变量”你必须知道的那些事

[摘要]：在上一篇文章里我们说明了一个好的研究假设需要具备以下特点：介绍清楚自变量、因变量是谁介绍清楚自变量与因变量的关系假设是可测量的我们还介绍了自变量和因变量的本质以及区别：自变量(independentvariable)用于引起、解释、预测因变量因变量(dependentvariable)是一个研究中被引起、被解释、被预测的东西那到底什么是变量？关于变量你必须知道哪些基本知识？变量从measureme... [发表时间：2022/6/2 10:52:00]
215.做空间转录组测序你最好先知道的两三事

[摘要]：上一期（空间转录组测序之实验相关常见Q&A）介绍了关于在空间转录组实验过程中遇到的常见问题。在基迪奥近两期的空间组学培训中，发现还是有众多老师对自己实验设计中，样本是否适合进行空间转录组测序有一定的疑惑。因此，这一期将专门为大家介绍关于空间转录组测序中样本选择与处理的相关内容。Q1：组织含水量高的样本如何处理样本在包埋降温的过程中，样本内的水分会形成冰晶从而刺破细胞。冰晶在－60℃~0℃形成，因此... [发表时间：2022/6/2 9:25:41]
216.Julia 向 Python 宣战！

[摘要]：近两年，凭借动态特性和易于扩展性，Python在企业级应用程序、机器学习/人工智能模型、数据科学等工作中，备受开发者青睐，其火热程度早已超越了编程语言界的老牌兵Java。而Python有朝一日会成为今朝的Java吗？对此，本文作者发文表示，30岁的Python正面临着来自编程语言世界的新参与者——Julia的威胁，而这究竟是怎么一回事？以下为译文：自上世纪90年代以来，编程语言Python已经取得... [发表时间：2022/6/1 14:23:46]
217.AI+医疗平台搭建

[摘要]：医院影像数据--分类任务以《乳腺癌识别》以及《COVID-19新冠肺炎识别》为例，介绍何如从CT扫描数据中识别指定疾病。image-202008232100382401、图像分类网络详解。（1）面向精度的图像识别网络，LeNet、AlexNet、VGG、Inception、ResNet等。（2）面试速度的图像识别网络，MobileNetV1、MobileNetV2、ShuffleNet等。2、CT... [发表时间：2022/6/1 14:22:08]
218.刘良华：教育叙事研究是什么与怎么做

[摘要]：叙事研究并非教育研究领域的“新潮”或“另类”,它一直存在于传统的教育研究之中。教育叙事研究是传统教育研究中的一个分支,如何理解叙事研究,取决于人们如何看待教育研究的框架。教育叙事研究与其他教育研究方法究竟构成什么关系,为什么提倡教育叙事研究,对这些问题的探究是理解叙事研究的意义和操作方法的基本前提。01/什么是教育叙事研究在有关教育叙事研究的讨论中,常常遇到的问题是:教育叙事研究是否可以虚构,教育... [发表时间：2022/6/1 14:01:30]
219.空气质量模型学习笔记 ——（模型基本介绍）

[摘要]：Part1SMOKE模型排放源处理系统，而不是排放源清单整理系统。与其他以运算法则为基础的处理系统相比效率高的多，且更为快速和灵活；模型的输出结果可以直接整合成CMAQ等模型可以识别的数据格式主要功能处理排放源资料数据，将排放数据内插到模式网格点上，并根据排放源的季变化和日变化规律，将年排放资料转化为每小时排放源强度。编码规则排放管理区编码【6位】示例1：XX（省级）YY（地市）ZZ（区县）示例2... [发表时间：2022/6/1 11:35:25]
220.复现Cell图表：双侧柱状图展示上下调GO富集结果

[摘要]：今天我们做一下这篇《Cell》文章的富集结果图。这是一个双侧柱状图，特点是，可以理解为上下调分开展示。当然，还可以将P值等信息添加在图上。其实我们之前好几篇文章做过双侧柱状图，但不足之处是没有像这篇文章一样，坐标轴位于中间，且通路分别展示在两侧，以及添加更多信息！接下来盘它！读入数据，可以将上下调提前标记分开。setwd("E:/生物信息学/复现Cell双侧柱状图GO")Alibrary(ggpl... [发表时间：2022/6/1 10:49:01]

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