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121.如何将通路图导入到Cytoscape中？
[摘要]：安装插件首先，通过App菜单下的“AppManager”进入Cytoscape的插件管理器。App菜单下的其他选项为之前已经安装好的一些插件。在插件管理器中的Search栏中，只需输入插件的名称（如这里只需前几个字母wiki）可快速找到相应的插件，用鼠标选中相应的插件后，点击Install按钮即可开始安装。导入通路图导入Wiki网络图的方法有两种，第一种方法是通过File菜单下的Import命令导... [发表时间：2022/8/10 8:39:31]
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122.如何绘制高分必备的各类常见图表？要学就 all in！
[摘要]：在探索数据时，如何做到快速又轻松获得漂亮的发表级图表呢？今天给大家推荐一款基于ggplot2的可视化R包grafify，包中内置多类科研人所需的常见图表和配色方案，代码简单，并且不同图表函数的参数逻辑一致，学会一个基本就能allin全部图表的绘制方法！发表级的散点柱形图、箱线图、箱线蜂群图、组合小提琴图、QQ图、密度分布曲线图、直方图、前后配对连线图，今天让你全部一次学会！#包的安装与载入：ins... [发表时间：2022/8/10 8:36:19]
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123.接力AlphaFold，星药科技发布TBind，开启分子蛋白复合物结构预测新纪元
[摘要]：继2018年、2020年的两代 AlphaFold 的横空出世后，蛋白质结构预测已经接近实验精度，为计算赋能药物研发领域打下了坚实基础。在药物研发漫长的研发环节中，分子与蛋白质的相互作用预测是下一个计算赋能药物研发领域的“圣杯”。近日，星药科技在预印本平台bioRxiv发表了题为：TrigonometryAwareNeuralNetworKforDrug-ProteinBindingStructu... [发表时间：2022/8/5 9:26:31]
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124.T检验：从理解到应用
[摘要]：通常我们实际工作面对的数据差异性并不是那么显著，而为了消除人为的主观臆断，就不得不引入统计检验。T检验是一种常用作均值判断的统计检验方法，Excel数据分析加载项和SPSS会是我们经常使用的工具，在下面会给出两种工具对应的实际操作步骤。单样本T检验：常用于样本均值与总体均值的比较。独立样本T检验：常用于两个独立样本之间均值的比较。配对样本T检验：常用于在某种程度上相关的两个样本之间均值的比较。这个... [发表时间：2022/7/29 8:54:50]
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125.你需要懂一点儿“Agent建模”
[摘要]：作者：S.Gabbriellini来源： 复杂系统与计算社会学无论是危险病毒在全球范围内的传播，由少数分子引发的城区意外骚乱，还是政党派系和议会选举，人们发现：已经越来越难以理解（更不用说预测）这些复杂社会现象究竟如何是展现的了。集体行为不仅难以预测，而且在社会角色层面往往也是不受欢迎的。当众多个体行为聚集在一起时，我们可以在全局范围内观察到那些导致（不良）后果的强行为模式（比如谢林模型）。高级分... [发表时间：2022/7/29 8:53:43]
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126.质谱检测，你需要知道的原理和参数
[摘要]：相比于表观修饰、转录、翻译过程，处于转录下游产物的蛋白质、代谢物往往具备更强的表型解释能力，这两个组学也常作为上游调控机制（如：基因的转录、翻译过程）的延伸，将基因调控与表型响应关联起来，多角度阐述表型差异的内在调控机制。不同于具有A、T、C、G、U碱基序列信息的DNA、RNA。蛋白质、代谢物则是由元素（C、H、O、N等）构成的立体化合物，想依赖测序技术获得大量的蛋白质、代谢物种类和丰度信息，目前... [发表时间：2022/7/28 10:53:10]
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127.如何查找目标基因的详细信息？
[摘要]：基因的功能研究是生命科学研究中非常重要的一部分，而如何查找感兴趣已知基因的信息就显得非常重要。之前在《如何查找感兴趣基因的信息？》一文已经为大家介绍过一种方法，这里再为大家介绍一个类似的数据库。数据库的首页如下：数据库链接：https://www.genecards.org/关于目标基因信息的查找，共有两种方式，一是输入关键词直接搜索基因信息，二是通过ExploreaGenes输入框直接查找基因，... [发表时间：2022/7/28 10:49:48]
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128.SCI论文作图 | 四大原则与四大软件
[摘要]：原则一：分辨率多数期刊对不一样的图也会有不一样的要求，一般来说有三种要求：1.lineartwork（纯纯的黑白图，没有中间颜色）。是要求最高的，1200dpi以上。2.combiantionartwork（halftoneartwork与lineartwork的组合，或彩色图与lineartwork的组合）。属于中间档，600dpi以上。3.halftoneartwork（颜色深浅有差别的灰度图... [发表时间：2022/7/28 9:51:00]
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129.细胞分化的势能景观分解理论：始于基因、成于调控、终于类型 | NSR
[摘要]：在多细胞生物体中，细胞在基因调控网络的作用下有序分化，形成形态、结构、功能各异的各类细胞，进而构成复杂的生命体。那么，能否根据基因调控网络（GeneRegulatoryNetwork,GRN），来推断细胞的分化过程呢？最近在线发表于《国家科学评论》（NationalScienceReview,NSR）的一项研究工作利用动力学分析工具和数值计算手段，给出了一种在考虑细胞生灭因素下，定量展现细胞分化过... [发表时间：2022/7/26 11:13:35]
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130.Npj Comput. Mater.: 机器视觉：加速大面积钙钛矿电池优化
[摘要]：近年来，钙钛矿基光伏电池的效率迅速提高，目前已经达到17.9%，接近单晶硅基器件的效率（20.4%）。然而现在钙钛矿基器件的最大面积只有800 cm2左右，远远低于单晶硅器件的尺寸（14800 cm2）。解决该问题的关键在于寻找能够实现稳定均匀薄膜的溶液涂覆方法及工艺。而寻找和优化工艺参数的前提是能够快速高效地检测生长薄膜的品质。目前薄膜检测方法主要通过人工实现，费时费力，成为实现工艺参数优化的瓶... [发表时间：2022/7/26 11:11:52]
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