中国科学院朱宝利/高福等揭开中国耐药性肠道沙门氏菌和优势血清变种的时间动态情况

肠道沙门氏菌是人类和动物中最常见的细菌病原体之一。欧美国家对耐药沙门氏菌和优势血清变型的趋势和地理分布进行了系统的研究，而中国尚未开展相关研究。

2022年11月29日，中国科学院微生物研究所朱宝利、高福及上海市疾病预防控制中心许学斌共同通讯在National Science Review（IF=23）在线发表题为“The temporal dynamics of antimicrobial-resistant-Salmonella enterica and predominant serovars in China”的研究论文，该研究揭示了中国耐药性肠道沙门氏菌和主要血清变型的时间动态。本研究采用“一种健康”策略，使用>3.5万株肠道沙门氏菌对中国优势血清变型的时空动态进行了研究。该研究发现，在中国，伤寒沙门氏菌是导致人类感染的主要血清病毒，这与澳大利亚一致，与北美和欧洲国家不一致。作者随机选择1962个分离株进行比较基因组学和抗微生物药物耐药性研究，发现在14年的时间里，每个分离株的抗生素耐药性基因(ARGs)数量分别是人类和非人类来源的1.84和2.69倍。

2006-2019年耐药沙门氏菌菌株比例呈上升趋势，尤其是β-内酰胺类、喹诺酮类、四环素和利福平耐药菌株比例上升趋势明显。此外，我们发现，与其他血清相比，鼠疫的序列类型（STs）的多样性更高，来自猪的ST34和来自鸡的ST19分别与引起儿童和成人胃部感染的分离物有关。本研究结果填补了中国肠道沙门氏菌优势血清变型和耐药趋势的数据空白。这些数据为优先考虑食源性疾病和食品安全干预措施的公共卫生决策者提供了有用的信息。

肠道沙门氏菌是全球食源性疾病的主要原因，耐抗生素肠道沙门氏菌分离株对公众健康构成严重威胁。肠道沙门氏菌由11个亚种。肠炎沙门氏菌亚种伤寒沙门氏菌(S. Typhi)和副伤寒(S.Paratyphi )A、B或C可在人类中引起伤寒和副伤寒，统称为肠道热，而其他的血清变型被粗略地描述为非伤寒沙门氏菌(NTS)。之前的研究表明，从1951年到2007年，中国共检测到322个血清变型。近年来，S. Telkebier、S. Telkebier、S. Uzaramo 和S. changwananni 均为其课题组同事在国内发现，且均为国外首次鉴定和报道。

虽然之前的meta分析已经很好地总结了五大洲(非洲、美洲、亚洲、欧洲和大洋洲)沙门氏菌的流行和多样性，但目前还没有对中国沙门氏菌优势血清变型的流行病学和时空动态的系统研究。为了填补这一数据空白，该研究系统地分析了14年来中国23个省或直辖市的沙门氏菌本地监测系统数据库(也称为细菌学习联盟)中登记的从人类和非人类来源分离的> 3.5万株肠球菌菌株的特征，为S. enterica 的基础研究和公共卫生风险预测提供支持。

中国NTS抗菌药物耐药性的时空变化（图源自National Science Review ）

肠杆菌科抗生素耐药性(AMR)的出现和传播严重威胁人类和动物的健康。值得注意的是，耐氟喹诺酮类沙门氏菌和产生超广谱β-内酰胺酶(ESBL)的肠杆菌科在2017年被世卫组织列为对人类健康构成风险的高度优先病原体，需要研究和开发新的抗生素。据估计，到2050年抗生素耐药性的持续上升每年将导致1000万人死亡，国内生产总值将减少2-3.5%。

该项工作首次系统地概述了中国分离自人类和非人类来源的肠链球菌的血清变型流行率和耐药性趋势。S. Typhimurium，S. Enteritidis 和S. Derby 是中国人类感染的主要病原。总之，该研究结果代表了中国最大的肠链球菌纵向监测系统，并提供了有关肠链球菌血清变型和AMR的趋势和分布的有价值的公共卫生知识。这项大型的观察性研究将为中国的食品安全干预、控制和预防耐药沙门氏菌的发展和传播提供有价值的信息。

原文链接：

https://doi.org/10.1093/nsr/nwac269

转自：“iNature”微信公众号

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