摘要、引言和结论是论文中常见的标题明晰的大纲结构。除此之外，还有一些标题比较自由的大纲结构，用以介绍论文的核心内容，包括方法和结构等内容。
论文的摘要
摘要连同标题出现在检索系统之中，一些读者会依据摘要决定是否获取全文，论文审稿人可能依据摘要决定是否审稿。因此，摘要必须能独立阅读，且有效地传达论文的全部信息。为了独立阅读，摘要不能包含需要翻阅论文其余部分才能明白意义的缩写语、符号和编号。例如，摘要中不能出现对参考文献按编号引用。
摘要的五个要素
你要解决的问题可能是别人指出的需要进一步解决的问题或者你发现的遗留问题，或者是提出一个完全新的问题。如果问题重要，需要突出问题的介绍。你要解决的问题的重要性可能在学术界形成共识，那么就需要突出问题。
2、动机
你的动机总要需要强调，需要交代你指望达到什么目的，实现该目标的意义。
3、方法
如果你提出的或采用的方法是解决问题的关键，那么需要强调方法。
4、结果和结论
在介绍结果和结论时，强调对重要结构和结论的介绍，次要结果和结论可以在摘要中忽略。如果你有一个重要发现，那么需要强调。在摘要中最后指出你得到的结论有什么意义。
对于一些面向更多读者的综合性期刊，摘要以宽发的问题开始，逐步收缩到你的动机、方法、结果和结论，在摘要的结论中又指出你的结论有什么更广泛的意义。摘要通过这种宽到窄到宽的结构，不仅能让文章传递给更广泛的读者，同时还能保持结果的可信度。
引言
引言应包含背景、需求、任务和目标四个部分的内容，让读者从这四部分内容看出你问题的来龙去脉与重要性。这种重要性可以通过强调当前知识或方法中存在的差距（空白）来强调。
引言的四个部分
引言应以宽泛的大背景开始，这样就先留住更多的读者。接着将背景收窄，指出本文关系的问题及其重要性，对这些问题解决到什么程度及有什么期待。
2、需求
进一步，通过指出文献遗留的空白指出需要进一步研究的问题，这就是需求。
3、任务
围绕需求，指出自己会完成哪些具体工作，这些具体工作有什么重要性。
4、目标
引言最后介绍论文期望实现什么目标，为此，论文的核心部分内容是怎样安排介绍顺序的。
在引言中，先通过背景介绍，将读者引向主题，接着介绍相关文献，告诉读者目前的进展以及尚有哪些空白，从而引出还有什么需要进一步研究，让读者承认工作的必要性，知晓你问题的来源。接着向读者介绍你做了什么工作及其重要性。读者如果了解到你的工作很重要，那么就会迫不及待地了解你论文的目标，即你会在论文中介绍什么且是如何安排论文的内容。
论文核心部分的大纲结构
论文的核心部分的一级大纲有两种结构：规范结构和自由结构。一级大纲称为节（这里指期刊论文，对于学位论文和专著，一级大纲是章），二级是子节，必要时还可以安排三级大纲。
规范结构（IMRaD结构）
核心部分的一级大纲以方法、结果和讨论为标题，分别介绍方法、结果和讨论。规范结构也称为IMRaD结构，这里，I指Introduction，即引言；M指Method，即方法；R指Results，即结果；D指Discussion，即讨论。规范结构的论文并不把总结性结论作为一级大纲放在末尾，往往放在讨论部分的最后一个二级大纲结构之中。规范结构也有一些变体。
对于方法不是主体的论文，方法可放到结果的第一部分（Mensh & Kording， 2017），这样的结构也称为IRaD结构。统计分析表明，虽然规范结构在20世纪70年代被推崇，但即使对那些特别强调规范结构的期刊，也只有一部分论文严格采用规范结构。
例如，Bertin et al（2013)针对一个时期发表在Plos One系列期刊上的论文的分析表明：a.第一节只有40%-80%的论文以引言为标题。b.第二节只有48%-90%的论文以方法为标题。c.第三节只有48%-89%的论文以结果为标题。d.第四节只有52%-86%的论文以讨论为标题。
自由结构
除最前面的引言和最后的结论外，自由结构的论文的中间部分即核心内心部分的一级大纲以解决的问题的性质作为划分依据。核心内容的一级大纲一般采用描述型标题，即指出问题的类型而不指出结论的标题。自由结构又分为并联型、串联型和混合型三种子类。混合型是指既有并联型也有串联型。
各一级大纲的内容相互独立。例如，“第2节 奔跑速度与腿长的相关性分析”、“第3节 奔跑速度与体重的相关性分析”。将两节顺序调换，稍加修改后不影响论文的写作与阅读。
2、串联型
各一级大纲的内容相互关联，后面的要用到前面的内容作为基础或出发点。例如，“第2节 奔跑速度与腿长相关性分析”、“第3节 相关性分析方法的验证”、“第4节 相关性分析方法的应用”。规范结构其实是一种典型的串联型结构，因此可以当作自由结构的一种特定情况，其中，结果部分要用到前面的方法，讨论部分是针对前面的结果讨论。无论是规范结构还是自由结构的论文，一级大纲之下的内容一般会按性质归类到二级大纲之中。此时，可以把一级大纲之下的内容也当作一篇论文一样，先在起始位置给出简介，即往下要交代什么，接着按规范结构或自由结构划分二级大纲并填写内容。
如果一个二级大纲下的内容太多，还应划分三级大纲，以便导读更容易。与一级大纲指出该节的主题不同，三级大纲可使用声明型标题，即指出结论的标题。对于二级和三级大纲，相邻的子标题应具有相同的类型、相同的语法和相同的句型。
例如，假定第2.2节的标题是“公众对全球变暖不知情的原因分析”，那么，下一级大纲可以是2.2.1 政府没有进行足够的宣传2.2.2 科学家没有撰写科普文章这样，第三级标题都是声明型标题（指出了结论的标题）、具有相同的语法和句型。一级大纲无论是采用何种结构，都需要让方法、结果和讨论以某种显式或隐含的形式出现在论文的核心部分，且满足一些要求与规范。下面分别讨论如何介绍方法、结果和讨论。
方法介绍
1、研究思路
概述你解决问题的整体思路是什么。可以是对其余四个要素的一个整体性概述。对于没有将方法作为单独一节或子节的论文，这种研究思路可以在引言之中介绍。
2、手段的介绍
指你使用的工具、材料、样本等。以工具为例，可以是数学方法，可以是实验设备，可以是软件工具。手段可能是现成的，也可能是改进的，还可能是自己构建的。
3、方式与步骤
需要介绍你使用手段的方式如何，有什么具体步骤。手段对谁都一样，但不同的人使用手段的方式有差异，采取的步骤有差异。这些差异会导致不同的结果，因此指出你采用的方式与步骤。
4、原始结果的处理方法
如果你的研究有定量数据，那么你首先得到的是原始数据（raw data），此时，你需要介绍你处理这些数据的方法，你将如何展示这些数据。
5、合理性讨论
需要说明或论证你的方法（包括思路、手段和使用方式）是合理的，以此得到的结果是可靠的、有意义的。对于数学论文，这种合理性讨论隐含在正确的数学推理逻辑之中。方法介绍的一个原则：对方法介绍要遵循让读者认为通过此种方法所得到的结果可信、可验证和可重复。
结果的介绍（先筛选、再凝练、后组织）
你的结果可以是发现了什么现象、得到了什么规律、验证了什么、纠正了什么认识、给出了什么知识。对于大多数论文，你得到的结果是原始结果，甚至是大量的结果。需要对结果进行筛选、凝练和组织。
1、结果的筛选
挑选那些有意义的、值得讨论的、可以总结出规律的、反映原创的结果。需要注意的是，如果你在检验一个方法的优劣，则不能通过去掉差的结果来说明方法优越。对于结论也有类似要求，不能去掉那些不支持结论的结果来论证结论的合理性。
2、结果的凝练
通过提炼、归纳和重新表述等方式凝练结果。对于数据类结果，特别少时在文字中介绍，较多时放在表格中，非常多的数据用图形展示。论文不能包含太多的结果，在结果较多时，应进行合理归类，减少表面上的结果的数目。例如，对于数学类论文，重要结果可浓缩在定理之中。
将结果进行合理的归类并按合理的逻辑顺序，用客观的语气表述。合理的逻辑顺序包括：由前到后的顺序、由次要到重要的顺序、承前启后的顺序、由浅入深的顺序、由基础到应用的顺序、由原因到结果的顺序。读者一般能记住开头或者末尾的结果，因此，最重要的结果要么放在前面，要么放在后面。
结论与总结
在介绍结果时，可能讨论出了一些结论。例如，如果你的观测结果是全球平均气温在一年年增加，那么你就得到了全球在变暖的结论。一些数学论文中证明的数学定理本身就是结论。而这里所说的结论，是指论文末尾的总结性结论，往往以结论（conclusion）或总结（summary）为标题。那么，论文末尾的结论或总结有什么要求呢？读者如果阅读了论文的核心部分，尤其详细阅读了方法、结果与讨论，那么有可能被太多的细节困住了，最后会迷失你的要点。于是，为了让被细节困住的读者走出核心部分，需要进入结论或总结部分来掌握要点。
对于规范结构的论文，可以在讨论的末尾给出一个以结论为标题的子节。对于自由结构的论文，可以把结论或总结作为最后的一个一级大纲内容。在结论或总结部分，需要对论文工作进行概括、归纳重要结论并且指出未来还有什么工作要做。
1、对论文的概括
用概述性语句简要回顾你面对的问题、采用的方法和得到的主要结果。
2、重要结论
总结你得到的重要结论及其意义。对重要结论的概述要达到这样的程度：给读者留下深刻的记忆。
3、未来工作
概括还有什么进一步工作需要开展，是否构成正在开展的工作，或者是建议其他学者完成。
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