以下文章来源于北京生物结构前沿研究中心 ,作者谭佳鑫
上周发布了哪些“结构”文章?又取得了哪些科研进展?
结构速递栏目以每周“结构”相关领域刊文为主题,梳理一周结构发文大事记,“结构速递”为您传递最新、最快、最权威的结构资讯。
2022.12.19~2022.12.25
CNS刊登文章
01
Nature
2022/12/21
“Actin cytoskeleton and complex cell architecture in an Asgard archaeon”
阿斯加德古菌被认为是已知的最接近真核生物的原核物种。它们的基因组含有数百种真核生物标志蛋白(eukaryotic signature proteins,ESPs),这引发了人们对真核细胞进化的假说。有关ESPs在精巧的细胞骨架和复杂的细胞结构的形成中的作用有很多推测,但ESPs从未被可视化过。
来自奥地利维也纳大学Christa Schleper和来自瑞士分子生物学与生物物理研究所的Martin Pilhofer课题组合作可视化了阿斯加德古菌的肌动蛋白细胞骨架和复杂的细胞结构。
研究人员报道了一种高度富集的“Candidatus Lokiarchaeum ossiferum”的培养物,它是阿斯加德门的一个成员,在20℃的有机碳源上厌氧生长。它每7-14天分裂一次,细胞密度达到每毫升5×107个。与以前培养的单个阿斯加德菌株相比,它的基因组明显更大。ESPs占其蛋白质编码基因的5%,包括四种肌动蛋白同源物。研究人员用冷冻电子断层扫描技术对富集培养物进行了成像,基于其核糖体的特征片段,识别出“Ca. L. ossiferum”细胞,细胞表征为球状的细胞体和带有频繁收缩的突起分支网络。细胞包膜由一个单一的膜和复杂的膜表面结构组成。一个长距离的细胞骨架延伸到整个细胞体、突起和收缩处。细丝的扭曲的双链结构与F-肌动蛋白一致。免疫染色表明,这些细丝包括Lokiactin--阿斯加德古菌中最高度保守的ESP之一。最终研究人员提出,复杂的基于肌动蛋白的细胞骨架的出现早于真核生物的出现,并且是阿斯加德门演化过程中的一个重要特征,它为复杂的细胞结构提供了支架保护作用。
原文链接
https://www.nature.com/articles/s41586-022-05550-y
02
Cell
2022/12/22
“Mechanism of IFT-A polymerization into trains for ciliary transport”
纤毛内转运(IFT)是一种高度保守的转运过程,蛋白质通过IFT- A和IFT- B复合物与其马达蛋白组装成线性阵列形式的火车状聚合物沿纤毛微管运输。IFT-A被夹在IFT-B和纤毛膜之间,这与它在跨膜和膜相关货物运输中的假定作用一致。
来自哈佛医学院的Alan Brown实验室使用冷冻电镜(cryo-EM)解析了纯化自利什曼原虫(L. tarentolae)的天然IFT-A复合物的结构。研究发现,亚复合物的重排使IFT- A在IFT火车上横向聚合,揭示了一种协同组装机制。令人惊讶的是,研究人员发现 IFT-A 使用一个共同的界面来结合脂质体和 IFT-B。这一结果表明IFT-A结合膜或 IFT-B 在纤毛基部可能具有竞争关系。这项工作为理解IFT列车组装和货物相互作用提供了机械基础。
原文链接
https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(22)01508-2
Science
本周无
2022.12.19~2022.12.25
子刊刊登文章
01
Molecular Cell
12.19
“Mechanism of Lys6 poly-ubiquitin specificity by the L. pneumophila deubiquitinase LotA”
02
Nature Structural & Molecular Biology
12.19
1.“Polλ promotes microhomology-mediated end-joining”
12.19
2.“A single 2′-O-methylation of ribosomal RNA gates assembly of a functional ribosome”
03
Nature Communications
12.19
1.“Rational enzyme design for enabling biocatalytic Baldwin cyclization and asymmetric synthesis of chiral heterocycles”
12.20
2.“Mechanism of human Lig1 regulation by PCNA in Okazaki fragment sealing”
12.20
3.“Morphological control enables nanometer-scale dissection of cell-cell signaling complexes”
12.21
4.“Molecular mechanism of antibody neutralization of coxsackievirus A16”
12.21
5.“Structure of a RecT/Redβ family recombinase in complex with a duplex intermediate of DNA annealing”
12.21
6.“Antibodies targeting the neuraminidase active site inhibit influenza H3N2 viruses with an S245N glycosylation site”
12.21
7.“Protein complex prediction using Rosetta, AlphaFold, and mass spectrometry covalent labeling”
12.21
8. “The UFM1 system regulates ER-phagy through the ufmylation of CYB5R3”
12.21
9.“Calcium-permeable channelrhodopsins for the photocontrol of calcium signalling”
04
Science Advances
12.21
1. “Mechanisms of DNA opening revealed in AAA+ transcription complex structures”
12.23
2.“Cryo-EM structure of the human adenosine A2B receptor–Gs signaling complex”
转自:“水木未来资讯”微信公众号
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